67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0418 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_0418  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  420  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3896  hypothetical protein  98.54 
 
 
206 aa  413  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0430  sterol-binding domain-containing protein  99.03 
 
 
206 aa  413  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.493767  hitchhiker  0.0000569108 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0444  Sterol-binding domain protein  98.54 
 
 
206 aa  407  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.224285  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4200  hypothetical protein  88.78 
 
 
205 aa  378  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3726  hypothetical protein  89.32 
 
 
206 aa  379  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3552  hypothetical protein  88.83 
 
 
206 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0404  hypothetical protein  88.35 
 
 
206 aa  377  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.459828  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0505  hypothetical protein  88.83 
 
 
206 aa  375  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0474  hypothetical protein  65.69 
 
 
206 aa  280  1e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0526  sterol-binding domain-containing protein  60.78 
 
 
207 aa  263  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4097  hypothetical protein  59.8 
 
 
207 aa  256  1e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3793  sterol-binding domain-containing protein  60.78 
 
 
207 aa  255  3e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3374  hypothetical protein  57.79 
 
 
207 aa  246  1e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.581541  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0460  hypothetical protein  52.43 
 
 
206 aa  221  9e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3203  hypothetical protein  46.38 
 
 
205 aa  189  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.663058  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00563  hypothetical protein  37.5 
 
 
211 aa  132  5e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2997  hypothetical protein  36.55 
 
 
207 aa  123  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001926  hypothetical protein  34.69 
 
 
211 aa  123  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2431  hypothetical protein  36.46 
 
 
207 aa  121  7e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0322  hypothetical protein  32.11 
 
 
210 aa  118  4.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0272  hypothetical protein  30.15 
 
 
210 aa  109  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3944  sterol-binding domain-containing protein  29.65 
 
 
216 aa  106  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3640  hypothetical protein  28.64 
 
 
211 aa  98.2  8e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3914  Sterol-binding domain protein  28.57 
 
 
202 aa  96.3  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3959  hypothetical protein  29.53 
 
 
201 aa  95.5  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3762  Sterol-binding domain protein  30 
 
 
202 aa  91.3  9e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0249  sterol-binding domain-containing protein  27.62 
 
 
206 aa  87.8  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.300084 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03727  hypothetical protein  27.46 
 
 
201 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4306  hypothetical protein  27.46 
 
 
201 aa  86.7  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4174  sterol-binding domain-containing protein  27.46 
 
 
201 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00890552 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4355  hypothetical protein  27.46 
 
 
201 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.963397  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4058  hypothetical protein  27.46 
 
 
201 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4145  Sterol-binding domain protein  27.46 
 
 
201 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03676  hypothetical protein  27.46 
 
 
201 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4179  hypothetical protein  27.46 
 
 
201 aa  84.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4298  hypothetical protein  27.27 
 
 
201 aa  84.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.115246  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4251  hypothetical protein  27.46 
 
 
201 aa  84.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5275  hypothetical protein  27.98 
 
 
201 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0592137  normal  0.315828 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4202  hypothetical protein  27.27 
 
 
201 aa  84.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4217  hypothetical protein  26.94 
 
 
201 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00208427 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4358  hypothetical protein  27.46 
 
 
201 aa  84.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03489  hypothetical protein  28.17 
 
 
211 aa  82.8  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4246  Sterol-binding domain protein  30.61 
 
 
207 aa  82.8  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480375  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0543  hypothetical protein  26.87 
 
 
211 aa  82.8  0.000000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4055  Sterol-binding domain protein  28.92 
 
 
213 aa  82  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0295  hypothetical protein  26.9 
 
 
235 aa  80.5  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126992  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4210  hypothetical protein  27.23 
 
 
213 aa  73.2  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0060  Sterol-binding domain protein  27 
 
 
207 aa  67  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5803  hypothetical protein  26.44 
 
 
208 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0596  hypothetical protein  26 
 
 
216 aa  59.7  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.307135  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2971  hypothetical protein  24.71 
 
 
205 aa  58.5  0.00000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2819  hypothetical protein  24.71 
 
 
205 aa  58.2  0.00000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66910  hypothetical protein  25.96 
 
 
208 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45420  hypothetical protein  25.26 
 
 
207 aa  55.1  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.471069  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0453  sterol-binding domain-containing protein  24.21 
 
 
207 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663917  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0070  hypothetical protein  26.63 
 
 
209 aa  53.9  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0522  hypothetical protein  25.76 
 
 
205 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265718  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5062  sterol-binding domain-containing protein  24.87 
 
 
207 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0386  hypothetical protein  23.65 
 
 
207 aa  52  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.778532  normal  0.105703 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4886  hypothetical protein  24.87 
 
 
207 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.8199 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5012  hypothetical protein  24.35 
 
 
207 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57602  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4116  hypothetical protein  29.58 
 
 
189 aa  48.9  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.804871  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2344  hypothetical protein  21.83 
 
 
202 aa  47  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1206  hypothetical protein  26.54 
 
 
192 aa  47  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2018  hypothetical protein  22.28 
 
 
220 aa  45.4  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.987101  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0388  hypothetical protein  23.33 
 
 
207 aa  42.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>