68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0404 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_0404  hypothetical protein  100 
 
 		 206 aa  418  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.459828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3726  hypothetical protein  98.06 
 
 		 206 aa  410  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3552  hypothetical protein  98.06 
 
 		 206 aa  412  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0418  hypothetical protein  88.35 
 
 		 206 aa  377  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4200  hypothetical protein  88.78 
 
 		 205 aa  376  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3896  hypothetical protein  87.86 
 
 		 206 aa  374  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0430  sterol-binding domain-containing protein  87.86 
 
 		 206 aa  374  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.493767  hitchhiker  0.0000569108 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0444  Sterol-binding domain protein  87.8 
 
 		 206 aa  370  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.224285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0505  hypothetical protein  83.5 
 
 		 206 aa  357  7e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0474  hypothetical protein  66.67 
 
 		 206 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0526  sterol-binding domain-containing protein  62.25 
 
 		 207 aa  266  1e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4097  hypothetical protein  61.27 
 
 		 207 aa  262  2e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3793  sterol-binding domain-containing protein  62.44 
 
 		 207 aa  259  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3374  hypothetical protein  60.3 
 
 		 207 aa  256  2e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.581541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0460  hypothetical protein  55.02 
 
 		 206 aa  225  4e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3203  hypothetical protein  45.15 
 
 		 205 aa  187  1e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.663058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2997  hypothetical protein  34.9 
 
 		 207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0322  hypothetical protein  31.58 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00563  hypothetical protein  35.18 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2431  hypothetical protein  35.75 
 
 		 207 aa  109  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001926  hypothetical protein  32.65 
 
 		 211 aa  108  6e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3914  Sterol-binding domain protein  33.51 
 
 		 202 aa  99  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3944  sterol-binding domain-containing protein  29.65 
 
 		 216 aa  96.3  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0272  hypothetical protein  29.15 
 
 		 210 aa  94.7  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3959  hypothetical protein  33.14 
 
 		 201 aa  92.8  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0249  sterol-binding domain-containing protein  29.52 
 
 		 206 aa  89.4  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.300084 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4055  Sterol-binding domain protein  34.31 
 
 		 213 aa  89  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3640  hypothetical protein  28.64 
 
 		 211 aa  88.2  9e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4246  Sterol-binding domain protein  34.85 
 
 		 207 aa  86.3  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480375  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3762  Sterol-binding domain protein  30.53 
 
 		 202 aa  85.9  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03489  hypothetical protein  27.7 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0295  hypothetical protein  29.65 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126992  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4145  Sterol-binding domain protein  27.46 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03676  hypothetical protein  27.46 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4306  hypothetical protein  27.46 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03727  hypothetical protein  27.46 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4174  sterol-binding domain-containing protein  27.46 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890552 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4058  hypothetical protein  27.46 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4355  hypothetical protein  27.46 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.963397  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4217  hypothetical protein  30.61 
 
 		 201 aa  79  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208427 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0543  hypothetical protein  27.33 
 
 		 211 aa  78.2  0.00000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5275  hypothetical protein  26.94 
 
 		 201 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0592137  normal  0.315828 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4358  hypothetical protein  32.57 
 
 		 201 aa  77.8  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4179  hypothetical protein  32.57 
 
 		 201 aa  77.8  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4251  hypothetical protein  32.57 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4298  hypothetical protein  32 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.115246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4202  hypothetical protein  32 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4210  hypothetical protein  28.22 
 
 		 213 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0596  hypothetical protein  28.64 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.307135  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0060  Sterol-binding domain protein  27 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45420  hypothetical protein  29.84 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.471069  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5803  hypothetical protein  29 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2971  hypothetical protein  27.27 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2819  hypothetical protein  26.15 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66910  hypothetical protein  28.86 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0522  hypothetical protein  28.33 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0453  sterol-binding domain-containing protein  25.26 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0070  hypothetical protein  27.64 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4116  hypothetical protein  29.73 
 
 		 189 aa  52.4  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.804871  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2018  hypothetical protein  24.87 
 
 		 220 aa  51.6  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.987101  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5062  sterol-binding domain-containing protein  25.26 
 
 		 207 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0386  hypothetical protein  25.83 
 
 		 207 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.778532  normal  0.105703 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4886  hypothetical protein  25.26 
 
 		 207 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.8199 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5012  hypothetical protein  24.74 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0697  hypothetical protein  26.17 
 
 		 196 aa  45.8  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0388  hypothetical protein  24.17 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0217  hypothetical protein  26.98 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1206  hypothetical protein  28.31 
 
 		 192 aa  41.6  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>