66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A3640 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A3640  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  423  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3944  sterol-binding domain-containing protein  97.22 
 
 
216 aa  414  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0272  hypothetical protein  96.19 
 
 
210 aa  398  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0249  sterol-binding domain-containing protein  61.39 
 
 
206 aa  254  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.300084 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4246  Sterol-binding domain protein  54.9 
 
 
207 aa  227  1e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480375  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4055  Sterol-binding domain protein  54.07 
 
 
213 aa  227  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3959  hypothetical protein  55.28 
 
 
201 aa  222  3e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3914  Sterol-binding domain protein  56.06 
 
 
202 aa  222  3e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4251  hypothetical protein  55.28 
 
 
201 aa  220  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4358  hypothetical protein  54.77 
 
 
201 aa  218  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4179  hypothetical protein  54.77 
 
 
201 aa  218  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4298  hypothetical protein  54.27 
 
 
201 aa  218  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.115246  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4202  hypothetical protein  54.27 
 
 
201 aa  218  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4306  hypothetical protein  54.27 
 
 
201 aa  216  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4217  hypothetical protein  54.27 
 
 
201 aa  216  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00208427 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4174  sterol-binding domain-containing protein  54.27 
 
 
201 aa  216  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00890552 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03676  hypothetical protein  54.27 
 
 
201 aa  216  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4355  hypothetical protein  54.27 
 
 
201 aa  216  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.963397  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4058  hypothetical protein  54.27 
 
 
201 aa  216  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03727  hypothetical protein  54.27 
 
 
201 aa  216  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4145  Sterol-binding domain protein  54.27 
 
 
201 aa  216  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3762  Sterol-binding domain protein  54.36 
 
 
202 aa  213  9.999999999999999e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5275  hypothetical protein  53.77 
 
 
201 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0592137  normal  0.315828 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00563  hypothetical protein  37.06 
 
 
211 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001926  hypothetical protein  37.06 
 
 
211 aa  139  3.9999999999999997e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2431  hypothetical protein  36.79 
 
 
207 aa  136  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2997  hypothetical protein  34.69 
 
 
207 aa  135  6.0000000000000005e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0322  hypothetical protein  35.23 
 
 
210 aa  126  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0543  hypothetical protein  32.66 
 
 
211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0418  hypothetical protein  28.64 
 
 
206 aa  98.2  8e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3896  hypothetical protein  28.64 
 
 
206 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0474  hypothetical protein  29.35 
 
 
206 aa  96.7  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0430  sterol-binding domain-containing protein  28.64 
 
 
206 aa  96.7  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.493767  hitchhiker  0.0000569108 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0444  Sterol-binding domain protein  29.02 
 
 
206 aa  95.9  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.224285  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3793  sterol-binding domain-containing protein  28.72 
 
 
207 aa  95.5  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0505  hypothetical protein  28.57 
 
 
206 aa  95.1  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0526  sterol-binding domain-containing protein  26.02 
 
 
207 aa  92.8  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4200  hypothetical protein  27.14 
 
 
205 aa  90.5  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3374  hypothetical protein  28.57 
 
 
207 aa  89.7  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.581541  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3552  hypothetical protein  28.22 
 
 
206 aa  89.4  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0404  hypothetical protein  28.64 
 
 
206 aa  88.2  9e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.459828  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3726  hypothetical protein  28.14 
 
 
206 aa  87  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0460  hypothetical protein  29.47 
 
 
206 aa  86.3  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0295  hypothetical protein  30.05 
 
 
235 aa  84  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126992  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03489  hypothetical protein  31.9 
 
 
211 aa  82  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4097  hypothetical protein  23.47 
 
 
207 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3203  hypothetical protein  30.59 
 
 
205 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.663058  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4210  hypothetical protein  30.2 
 
 
213 aa  68.2  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0596  hypothetical protein  28.22 
 
 
216 aa  60.1  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.307135  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2344  hypothetical protein  28.02 
 
 
202 aa  57  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2819  hypothetical protein  24.53 
 
 
205 aa  55.8  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2971  hypothetical protein  24.53 
 
 
205 aa  56.2  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0060  Sterol-binding domain protein  26.42 
 
 
207 aa  54.3  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0522  hypothetical protein  28.4 
 
 
205 aa  52  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265718  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0386  hypothetical protein  25.44 
 
 
207 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.778532  normal  0.105703 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2701  hypothetical protein  26 
 
 
219 aa  49.7  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000952725 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0388  hypothetical protein  21.52 
 
 
207 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0687  hypothetical protein  30.43 
 
 
231 aa  47.4  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45420  hypothetical protein  25.87 
 
 
207 aa  47.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.471069  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5062  sterol-binding domain-containing protein  24.34 
 
 
207 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1206  hypothetical protein  28.74 
 
 
192 aa  43.9  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4886  hypothetical protein  24.34 
 
 
207 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.8199 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5012  hypothetical protein  24.34 
 
 
207 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57602  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0784  hypothetical protein  24.49 
 
 
240 aa  42  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2018  hypothetical protein  25.38 
 
 
220 aa  42.4  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.987101  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0712  hypothetical protein  29.19 
 
 
231 aa  42  0.007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.502118  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>