73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3793 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_3793  sterol-binding domain-containing protein  100 
 
 
207 aa  426  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0526  sterol-binding domain-containing protein  70.73 
 
 
207 aa  317  6e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4097  hypothetical protein  68.45 
 
 
207 aa  309  2e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3374  hypothetical protein  65.85 
 
 
207 aa  293  1e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.581541  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0474  hypothetical protein  61.31 
 
 
206 aa  262  3e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3552  hypothetical protein  62.44 
 
 
206 aa  259  1e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0404  hypothetical protein  62.44 
 
 
206 aa  259  2e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.459828  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3726  hypothetical protein  62.44 
 
 
206 aa  258  3e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3896  hypothetical protein  60.78 
 
 
206 aa  258  3e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0505  hypothetical protein  62.25 
 
 
206 aa  259  3e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0444  Sterol-binding domain protein  61.27 
 
 
206 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.224285  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0430  sterol-binding domain-containing protein  60.78 
 
 
206 aa  256  1e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.493767  hitchhiker  0.0000569108 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0418  hypothetical protein  60.78 
 
 
206 aa  255  3e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4200  hypothetical protein  58.82 
 
 
205 aa  251  7e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0460  hypothetical protein  48.24 
 
 
206 aa  190  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3203  hypothetical protein  41.75 
 
 
205 aa  180  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.663058  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2431  hypothetical protein  38.89 
 
 
207 aa  136  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00563  hypothetical protein  37.44 
 
 
211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001926  hypothetical protein  36.73 
 
 
211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2997  hypothetical protein  38.02 
 
 
207 aa  129  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0322  hypothetical protein  28.5 
 
 
210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3944  sterol-binding domain-containing protein  29.74 
 
 
216 aa  102  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3959  hypothetical protein  32.12 
 
 
201 aa  102  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0272  hypothetical protein  29.23 
 
 
210 aa  102  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4251  hypothetical protein  29.53 
 
 
201 aa  99.8  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3914  Sterol-binding domain protein  30 
 
 
202 aa  99.8  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4179  hypothetical protein  29.53 
 
 
201 aa  98.6  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4358  hypothetical protein  29.53 
 
 
201 aa  98.6  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4202  hypothetical protein  29.02 
 
 
201 aa  97.8  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4298  hypothetical protein  29.02 
 
 
201 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.115246  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0249  sterol-binding domain-containing protein  30.1 
 
 
206 aa  95.9  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.300084 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3640  hypothetical protein  28.72 
 
 
211 aa  95.5  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0543  hypothetical protein  28.27 
 
 
211 aa  90.1  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3762  Sterol-binding domain protein  28.95 
 
 
202 aa  90.1  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4210  hypothetical protein  29.27 
 
 
213 aa  89.7  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4145  Sterol-binding domain protein  27.46 
 
 
201 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4174  sterol-binding domain-containing protein  27.46 
 
 
201 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00890552 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4306  hypothetical protein  27.46 
 
 
201 aa  87.4  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03727  hypothetical protein  27.46 
 
 
201 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4355  hypothetical protein  27.46 
 
 
201 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.963397  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4058  hypothetical protein  27.46 
 
 
201 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03676  hypothetical protein  27.46 
 
 
201 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4217  hypothetical protein  27.46 
 
 
201 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00208427 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5275  hypothetical protein  26.94 
 
 
201 aa  85.1  7e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0592137  normal  0.315828 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4246  Sterol-binding domain protein  30.88 
 
 
207 aa  81.3  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480375  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0295  hypothetical protein  26.94 
 
 
235 aa  80.5  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126992  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03489  hypothetical protein  29.19 
 
 
211 aa  79.7  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4055  Sterol-binding domain protein  30.64 
 
 
213 aa  79.3  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0060  Sterol-binding domain protein  27.14 
 
 
207 aa  73.2  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0596  hypothetical protein  23 
 
 
216 aa  65.5  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.307135  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0070  hypothetical protein  25.13 
 
 
209 aa  62  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2819  hypothetical protein  24.26 
 
 
205 aa  60.5  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2971  hypothetical protein  23.88 
 
 
205 aa  60.5  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0453  sterol-binding domain-containing protein  23.47 
 
 
207 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663917  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5803  hypothetical protein  26.24 
 
 
208 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66910  hypothetical protein  26.47 
 
 
208 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5062  sterol-binding domain-containing protein  23.47 
 
 
207 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4886  hypothetical protein  23.98 
 
 
207 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.8199 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3416  hypothetical protein  23.71 
 
 
213 aa  56.2  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5012  hypothetical protein  23.47 
 
 
207 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57602  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0386  hypothetical protein  22.11 
 
 
207 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.778532  normal  0.105703 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45420  hypothetical protein  24.48 
 
 
207 aa  54.7  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.471069  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2701  hypothetical protein  22.78 
 
 
219 aa  51.6  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000952725 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2344  hypothetical protein  22.16 
 
 
202 aa  50.8  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1206  hypothetical protein  23.28 
 
 
192 aa  49.7  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0066  hypothetical protein  21.89 
 
 
204 aa  48.5  0.00007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2119  hypothetical protein  21.89 
 
 
204 aa  48.5  0.00007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.145601  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0522  hypothetical protein  23.33 
 
 
205 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265718  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0388  hypothetical protein  19.9 
 
 
207 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2018  hypothetical protein  23.76 
 
 
220 aa  45.1  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.987101  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1187  Sterol-binding domain protein  21.43 
 
 
212 aa  42.4  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.044865  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0697  hypothetical protein  27.93 
 
 
196 aa  41.6  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5151  hypothetical protein  20 
 
 
207 aa  41.6  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>