72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3914 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3914  Sterol-binding domain protein  100 
 
 
202 aa  400  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3762  Sterol-binding domain protein  75.62 
 
 
202 aa  312  2.9999999999999996e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4246  Sterol-binding domain protein  66.67 
 
 
207 aa  270  1e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480375  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4055  Sterol-binding domain protein  63.98 
 
 
213 aa  266  1e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0249  sterol-binding domain-containing protein  60.7 
 
 
206 aa  251  6e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.300084 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3944  sterol-binding domain-containing protein  58.08 
 
 
216 aa  234  7e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0272  hypothetical protein  57.58 
 
 
210 aa  233  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3959  hypothetical protein  53.23 
 
 
201 aa  224  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3640  hypothetical protein  56.06 
 
 
211 aa  222  3e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4145  Sterol-binding domain protein  52.26 
 
 
201 aa  211  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4058  hypothetical protein  52.26 
 
 
201 aa  211  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4355  hypothetical protein  52.26 
 
 
201 aa  211  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.963397  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4174  sterol-binding domain-containing protein  52.26 
 
 
201 aa  211  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00890552 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4306  hypothetical protein  52.26 
 
 
201 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03676  hypothetical protein  52.26 
 
 
201 aa  211  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03727  hypothetical protein  52.26 
 
 
201 aa  211  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4217  hypothetical protein  52.26 
 
 
201 aa  211  7e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00208427 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5275  hypothetical protein  51.76 
 
 
201 aa  207  9e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0592137  normal  0.315828 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4179  hypothetical protein  51.26 
 
 
201 aa  204  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4358  hypothetical protein  51.26 
 
 
201 aa  204  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4251  hypothetical protein  50.75 
 
 
201 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4202  hypothetical protein  50.25 
 
 
201 aa  201  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4298  hypothetical protein  49.75 
 
 
201 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.115246  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2431  hypothetical protein  38.89 
 
 
207 aa  142  3e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001926  hypothetical protein  36.87 
 
 
211 aa  137  8.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00563  hypothetical protein  36.87 
 
 
211 aa  134  8e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2997  hypothetical protein  38.19 
 
 
207 aa  132  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0322  hypothetical protein  30.77 
 
 
210 aa  112  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0474  hypothetical protein  31.58 
 
 
206 aa  102  5e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4097  hypothetical protein  27.32 
 
 
207 aa  101  9e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0543  hypothetical protein  27.08 
 
 
211 aa  100  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0505  hypothetical protein  30.53 
 
 
206 aa  100  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3793  sterol-binding domain-containing protein  30 
 
 
207 aa  99.8  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0526  sterol-binding domain-containing protein  28.64 
 
 
207 aa  100  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3726  hypothetical protein  33.51 
 
 
206 aa  99.8  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0404  hypothetical protein  33.51 
 
 
206 aa  99  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.459828  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3552  hypothetical protein  32.98 
 
 
206 aa  97.8  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3374  hypothetical protein  30.1 
 
 
207 aa  97.1  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.581541  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0418  hypothetical protein  28.57 
 
 
206 aa  96.3  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4200  hypothetical protein  28.57 
 
 
205 aa  95.9  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3203  hypothetical protein  32.12 
 
 
205 aa  95.5  5e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.663058  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3896  hypothetical protein  28.57 
 
 
206 aa  94.7  7e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0444  Sterol-binding domain protein  28.57 
 
 
206 aa  94.7  7e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.224285  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0430  sterol-binding domain-containing protein  28.57 
 
 
206 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.493767  hitchhiker  0.0000569108 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03489  hypothetical protein  29.81 
 
 
211 aa  84.3  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0460  hypothetical protein  29.26 
 
 
206 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0295  hypothetical protein  28.86 
 
 
235 aa  77.4  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126992  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4210  hypothetical protein  33.49 
 
 
213 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0060  Sterol-binding domain protein  30.65 
 
 
207 aa  73.9  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2971  hypothetical protein  27.69 
 
 
205 aa  72.4  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2819  hypothetical protein  27.69 
 
 
205 aa  72.4  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0388  hypothetical protein  26.5 
 
 
207 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0453  sterol-binding domain-containing protein  28.5 
 
 
207 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663917  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0386  hypothetical protein  27.5 
 
 
207 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.778532  normal  0.105703 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5062  sterol-binding domain-containing protein  27.59 
 
 
207 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5012  hypothetical protein  27.59 
 
 
207 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57602  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4886  hypothetical protein  27.59 
 
 
207 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.8199 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0522  hypothetical protein  25.89 
 
 
205 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265718  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45420  hypothetical protein  25.89 
 
 
207 aa  53.5  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.471069  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2344  hypothetical protein  23.62 
 
 
202 aa  51.6  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2018  hypothetical protein  24.75 
 
 
220 aa  49.3  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.987101  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0596  hypothetical protein  24.26 
 
 
216 aa  48.5  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.307135  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02770  hypothetical protein  29.05 
 
 
214 aa  48.1  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.763471  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5151  hypothetical protein  25.38 
 
 
207 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2119  hypothetical protein  21.78 
 
 
204 aa  45.1  0.0006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.145601  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0066  hypothetical protein  21.78 
 
 
204 aa  45.1  0.0006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5803  hypothetical protein  24.24 
 
 
208 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0712  hypothetical protein  26.79 
 
 
231 aa  43.5  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.502118  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0687  hypothetical protein  27.1 
 
 
231 aa  43.5  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66910  hypothetical protein  24.24 
 
 
208 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0070  hypothetical protein  30.48 
 
 
209 aa  42.4  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1191  hypothetical protein  35.45 
 
 
215 aa  42  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>