66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_4055 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_4055  Sterol-binding domain protein  100 
 
 		 213 aa  426  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4246  Sterol-binding domain protein  93.43 
 
 		 207 aa  392  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480375  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3914  Sterol-binding domain protein  63.98 
 
 		 202 aa  266  1e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3762  Sterol-binding domain protein  61.5 
 
 		 202 aa  258  5.0000000000000005e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0249  sterol-binding domain-containing protein  56.81 
 
 		 206 aa  244  6e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.300084 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3944  sterol-binding domain-containing protein  55.98 
 
 		 216 aa  239  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0272  hypothetical protein  55.98 
 
 		 210 aa  238  4e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3640  hypothetical protein  54.07 
 
 		 211 aa  227  1e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3959  hypothetical protein  51.66 
 
 		 201 aa  223  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4358  hypothetical protein  48.82 
 
 		 201 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4251  hypothetical protein  48.82 
 
 		 201 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4179  hypothetical protein  48.82 
 
 		 201 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4298  hypothetical protein  48.82 
 
 		 201 aa  209  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.115246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4202  hypothetical protein  48.82 
 
 		 201 aa  209  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4306  hypothetical protein  46.92 
 
 		 201 aa  205  4e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4174  sterol-binding domain-containing protein  46.92 
 
 		 201 aa  205  4e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890552 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03676  hypothetical protein  46.92 
 
 		 201 aa  205  4e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4355  hypothetical protein  46.92 
 
 		 201 aa  205  4e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.963397  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4058  hypothetical protein  46.92 
 
 		 201 aa  205  4e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03727  hypothetical protein  46.92 
 
 		 201 aa  205  4e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4145  Sterol-binding domain protein  46.92 
 
 		 201 aa  205  4e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4217  hypothetical protein  46.92 
 
 		 201 aa  204  6e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208427 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5275  hypothetical protein  46.45 
 
 		 201 aa  201  6e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0592137  normal  0.315828 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2431  hypothetical protein  33.97 
 
 		 207 aa  121  7e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2997  hypothetical protein  32.54 
 
 		 207 aa  118  6e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001926  hypothetical protein  33.01 
 
 		 211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00563  hypothetical protein  33.97 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0322  hypothetical protein  31.07 
 
 		 210 aa  108  6e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0543  hypothetical protein  29.25 
 
 		 211 aa  101  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4097  hypothetical protein  31.71 
 
 		 207 aa  90.9  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0404  hypothetical protein  34.31 
 
 		 206 aa  89  5e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.459828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3374  hypothetical protein  31.95 
 
 		 207 aa  89  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.581541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3726  hypothetical protein  32.18 
 
 		 206 aa  86.7  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0505  hypothetical protein  29.35 
 
 		 206 aa  86.3  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3552  hypothetical protein  32.18 
 
 		 206 aa  86.3  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4200  hypothetical protein  32.56 
 
 		 205 aa  85.5  5e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3203  hypothetical protein  34.1 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.663058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0418  hypothetical protein  28.92 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3896  hypothetical protein  29.76 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0444  Sterol-binding domain protein  29.76 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.224285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0430  sterol-binding domain-containing protein  29.57 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.493767  hitchhiker  0.0000569108 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0474  hypothetical protein  31.87 
 
 		 206 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0295  hypothetical protein  31.95 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126992  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0526  sterol-binding domain-containing protein  27.32 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3793  sterol-binding domain-containing protein  30.64 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0460  hypothetical protein  32.08 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4210  hypothetical protein  29.68 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03489  hypothetical protein  29.22 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0060  Sterol-binding domain protein  26.19 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2971  hypothetical protein  25.24 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2819  hypothetical protein  25.24 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0596  hypothetical protein  26.44 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.307135  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4886  hypothetical protein  27.14 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.8199 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45420  hypothetical protein  26.32 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.471069  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5012  hypothetical protein  27.14 
 
 		 207 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0453  sterol-binding domain-containing protein  26.19 
 
 		 207 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0217  hypothetical protein  32.24 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0388  hypothetical protein  21.74 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5062  sterol-binding domain-containing protein  26.67 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1206  hypothetical protein  36.7 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2344  hypothetical protein  24.06 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0386  hypothetical protein  25 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.778532  normal  0.105703 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0522  hypothetical protein  23.92 
 
 		 205 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0687  hypothetical protein  28.4 
 
 		 231 aa  44.7  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0070  hypothetical protein  33 
 
 		 209 aa  43.5  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0712  hypothetical protein  28.92 
 
 		 231 aa  42  0.008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.502118  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>