More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0651 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  100 
 
 		 240 aa  477  1e-134  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0212  ribonuclease III  83.76 
 
 		 248 aa  376  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3433  ribonuclease III  79.2 
 
 		 268 aa  337  9.999999999999999e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.699086  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2780  ribonuclease III  79.48 
 
 		 267 aa  323  1e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.16188  normal  0.181798 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1574  ribonuclease III  68.24 
 
 		 246 aa  322  4e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0764716 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1177  ribonuclease III  69.1 
 
 		 252 aa  301  8.000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.312769  hitchhiker  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7995  Ribonuclease III  74.06 
 
 		 243 aa  296  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.509721  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1287  ribonuclease III  67.81 
 
 		 252 aa  296  1e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.134604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8017  ribonuclease III  71.96 
 
 		 276 aa  287  8e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3281  ribonuclease III  72.54 
 
 		 276 aa  286  2e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1139  ribonuclease III  69.23 
 
 		 306 aa  280  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.323858  normal  0.0251289 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1883  ribonuclease III  65.89 
 
 		 249 aa  274  7e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0277805  normal  0.0189831 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2122  ribonuclease III  64 
 
 		 243 aa  273  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0434013 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3601  ribonuclease III  68.95 
 
 		 270 aa  273  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2293  ribonuclease III  60.96 
 
 		 240 aa  269  2.9999999999999997e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.051216  hitchhiker  0.000715248 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4192  ribonuclease III  58.67 
 
 		 234 aa  261  8.999999999999999e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2072  ribonuclease III  63.23 
 
 		 262 aa  259  2e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.497475  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12940  ribonuclease III  64.36 
 
 		 240 aa  255  3e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5964  ribonuclease III  66.67 
 
 		 267 aa  256  3e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1609  ribonuclease III  59.91 
 
 		 252 aa  253  2.0000000000000002e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.425776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11290  RNAse III  57.02 
 
 		 234 aa  252  3e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09490  RNAse III  66.22 
 
 		 250 aa  250  1e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.805869  normal  0.162457 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1376  Ribonuclease III  66.67 
 
 		 224 aa  249  4e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.028132  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2239  Ribonuclease III  58.72 
 
 		 242 aa  248  6e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000641726 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2501  ribonuclease III  60.09 
 
 		 240 aa  248  8e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1567  ribonuclease III  61.14 
 
 		 249 aa  245  3e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0292107  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4029  ribonuclease III  65.6 
 
 		 270 aa  244  9e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2273  ribonuclease III  58.53 
 
 		 239 aa  244  9e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2171  ribonuclease III  61.01 
 
 		 235 aa  243  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1949  ribonuclease III  62 
 
 		 234 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1929  ribonuclease III  62 
 
 		 234 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1995  ribonuclease III  62 
 
 		 234 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0814275  normal  0.249883 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1666  ribonuclease III  52.14 
 
 		 241 aa  238  5.999999999999999e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.397284  normal  0.0114969 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10860  RNAse III  58.9 
 
 		 228 aa  238  8e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0129939  normal  0.199787 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08900  RNAse III  56.81 
 
 		 220 aa  226  3e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.493633  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1041  ribonuclease III  45 
 
 		 242 aa  201  6e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.834225  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  50.88 
 
 		 235 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18360  RNAse III  55.07 
 
 		 250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  45.74 
 
 		 230 aa  199  3e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0336  ribonuclease III  47.06 
 
 		 242 aa  196  2.0000000000000003e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  52.07 
 
 		 235 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  44.44 
 
 		 245 aa  194  9e-49  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  50 
 
 		 242 aa  189  4e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  45.67 
 
 		 232 aa  187  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  46.57 
 
 		 236 aa  187  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  47.27 
 
 		 259 aa  185  5e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  47.62 
 
 		 246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  46.89 
 
 		 236 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  42.67 
 
 		 236 aa  183  3e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  44.2 
 
 		 246 aa  181  7e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2460  ribonuclease III  42.04 
 
 		 231 aa  181  1e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.214805  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  43.61 
 
 		 246 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  47.34 
 
 		 233 aa  180  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  44.4 
 
 		 246 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1690  ribonuclease III  41.41 
 
 		 241 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00872848  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1972  ribonuclease III  41.41 
 
 		 241 aa  179  4e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00427234  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1714  ribonuclease III  41.85 
 
 		 240 aa  177  1e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  43.04 
 
 		 246 aa  174  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3545  ribonuclease III  50 
 
 		 282 aa  173  2.9999999999999996e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895887  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1650  ribonuclease III  50.52 
 
 		 385 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2159  ribonuclease III  49.25 
 
 		 377 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201039 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2208  Ribonuclease III  51.03 
 
 		 383 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0908  ribonuclease III  39.91 
 
 		 248 aa  172  5.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640181  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2296  Ribonuclease III  51.03 
 
 		 383 aa  171  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.302366  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  47.76 
 
 		 240 aa  171  7.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_897  ribonuclease III  40.27 
 
 		 248 aa  171  1e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000334707  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1778  ribonuclease III  49.75 
 
 		 234 aa  170  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.574202  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  42.86 
 
 		 246 aa  169  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3813  Ribonuclease III  47.52 
 
 		 262 aa  169  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119761  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1347  ribonuclease III  47.69 
 
 		 241 aa  169  3e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.461222  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1025  ribonuclease III  39.91 
 
 		 237 aa  168  6e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00427221  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  43.26 
 
 		 235 aa  166  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1502  ribonuclease III  44.5 
 
 		 231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00547993  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1753  ribonuclease III  42.65 
 
 		 230 aa  165  5e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.159532  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0862  ribonuclease III  41.83 
 
 		 231 aa  165  5.9999999999999996e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1092  Ribonuclease III  45.41 
 
 		 228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.268595  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1641  ribonuclease III  42.29 
 
 		 240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1292  ribonuclease III  40 
 
 		 243 aa  163  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  46.04 
 
 		 246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1317  ribonuclease III  40 
 
 		 243 aa  163  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3959  Ribonuclease III  47.45 
 
 		 228 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1494  ribonuclease III  38.57 
 
 		 222 aa  162  5.0000000000000005e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  39.22 
 
 		 233 aa  161  7e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2807  ribonuclease III  35.96 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000160446  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3948  ribonuclease III  44.14 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.399561  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1295  ribonuclease III  44.14 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0290325  hitchhiker  3.99354e-16 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  41.35 
 
 		 221 aa  159  5e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1947  ribonuclease III  41.71 
 
 		 253 aa  159  5e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1272  ribonuclease III  40.67 
 
 		 229 aa  158  6e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.812547  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2501  ribonuclease III  42.38 
 
 		 245 aa  157  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00121317  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2065  ribonuclease III  39.11 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3303  Ribonuclease III  41.86 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2813  ribonuclease III  41.86 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  0.303497 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2232  Ribonuclease III  46.8 
 
 		 256 aa  157  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0797386 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3891  ribonuclease III  43.69 
 
 		 245 aa  156  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1081  ribonuclease III  42.25 
 
 		 239 aa  156  2e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3897  ribonuclease III  43.69 
 
 		 245 aa  156  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000342133  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3672  ribonuclease III  42.03 
 
 		 245 aa  156  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.405617  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3987  ribonuclease III  43.69 
 
 		 245 aa  156  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.484862  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3863  ribonuclease III  43.69 
 
 		 245 aa  156  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2755e-51 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>