58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0397 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0397  ATPase  100 
 
 		 360 aa  711    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5503  AAA ATPase  46.01 
 
 		 464 aa  309  5e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328038  hitchhiker  0.00036536 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7060  hypothetical protein  32.17 
 
 		 445 aa  169  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3443  SMC domain-containing protein  24.53 
 
 		 709 aa  94.4  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0416993  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6340  SMC domain protein  25.07 
 
 		 420 aa  92.4  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815029  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5461  AAA ATPase  27.08 
 
 		 769 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0023  AAA ATPase  27.51 
 
 		 736 aa  89.7  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4982  hypothetical protein  25.38 
 
 		 464 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  37.72 
 
 		 439 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0201  hypothetical protein  36.64 
 
 		 442 aa  80.9  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0853474 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2697  AAA ATPase  42.59 
 
 		 410 aa  78.6  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308966  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2683  hypothetical protein  37.11 
 
 		 478 aa  74.7  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2489  SMC domain-containing protein  25.43 
 
 		 452 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000889729  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5113  hypothetical protein  34.91 
 
 		 422 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0004  ATP binding protein  48.19 
 
 		 454 aa  70.9  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  29.53 
 
 		 437 aa  70.9  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  41.49 
 
 		 440 aa  70.9  0.00000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3137  ATPas  35.09 
 
 		 449 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  35.65 
 
 		 482 aa  70.1  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3668  hypothetical protein  34.86 
 
 		 408 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1964  hypothetical protein  35 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1600  ATPase  38.95 
 
 		 427 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0426773  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0419  hypothetical protein  32.26 
 
 		 421 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  31.82 
 
 		 406 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3725  ATPase  29.88 
 
 		 455 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  33.33 
 
 		 430 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4173  AAA ATPase  42.62 
 
 		 415 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0641  AAA ATPase  22.97 
 
 		 418 aa  66.2  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0743  hypothetical protein, putative phage gene  25.44 
 
 		 414 aa  65.5  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0257  ATPase  25.63 
 
 		 403 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1462  SMC domain protein  34.55 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0928  SMC domain protein  24.3 
 
 		 577 aa  62.4  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.384804  normal  0.0676455 
 
 
-
 
NC_002950  PG0742  antigen PgaA  37 
 
 		 445 aa  62.4  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1849  SMC domain protein  34.91 
 
 		 422 aa  62.4  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2903  ATP-binding protein involved in virulence-like protein  36.26 
 
 		 453 aa  60.5  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.473037 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2940  hypothetical protein  41.38 
 
 		 410 aa  60.1  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1791  hypothetical protein  44.64 
 
 		 369 aa  52.4  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1398  hypothetical protein  33.73 
 
 		 610 aa  51.6  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1155  SMC domain-containing protein  32.98 
 
 		 852 aa  48.9  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1300  SMC domain-containing protein  32.98 
 
 		 852 aa  48.9  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.975813  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2531  hypothetical protein  44.19 
 
 		 608 aa  48.1  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.41472  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2482  putative ABC transporter, ATP-binding domain  37.04 
 
 		 976 aa  48.1  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.169992  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0224  ATPase  25.45 
 
 		 352 aa  47  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0363611 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0120  ATP-dependent OLD family endonuclease  52.38 
 
 		 429 aa  46.6  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2562  hypothetical protein  30.14 
 
 		 541 aa  45.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.421281 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1448  ABC transporter related protein  39.19 
 
 		 264 aa  45.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.425565  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0681  ATP-dependent endonuclease of the OLD family  24.55 
 
 		 353 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.734229 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3609  ABC transporter related  58.97 
 
 		 263 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4760  SMC domain-containing protein  23.6 
 
 		 533 aa  45.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4617  ABC transporter related  38.26 
 
 		 314 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2539  SMC domain protein  38.46 
 
 		 1085 aa  45.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0111  hypothetical protein  32.76 
 
 		 368 aa  43.9  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4769  ABC transporter related  46.94 
 
 		 253 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.530136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2494  ABC transporter related  47.37 
 
 		 268 aa  43.5  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.347402 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2421  ABC transporter related  33.33 
 
 		 286 aa  43.5  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00390383  normal  0.0144872 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2832  SMC domain protein  29.87 
 
 		 580 aa  43.5  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1714  exonuclease SbcC  37.04 
 
 		 1214 aa  43.1  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.595206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3149  ABC transporter related  39.68 
 
 		 271 aa  42.7  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0281771  hitchhiker  0.00000000506205 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>