More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_0702 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 
137 aa  270  3e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  60.27 
 
 
231 aa  87.8  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  55.07 
 
 
142 aa  85.9  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  50.68 
 
 
301 aa  82.8  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3686  transcriptional regulator, XRE family  41.82 
 
 
133 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1604  DNA-binding protein  48.65 
 
 
114 aa  80.9  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00115974  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0916  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 
115 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2791  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 
139 aa  72  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 
123 aa  72  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  39.81 
 
 
321 aa  71.2  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2256  transcriptional regulator, XRE family  47.3 
 
 
117 aa  70.9  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0218  Cro/CI family transcriptional regulator  44.94 
 
 
158 aa  70.5  0.000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.631577  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3466  transcriptional regulator, XRE family  43.06 
 
 
121 aa  70.1  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0801  XRE family transcriptional regulator  42.5 
 
 
111 aa  68.9  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000260527  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  43.9 
 
 
152 aa  69.3  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119777  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0510  XRE family transcriptional regulator  43.18 
 
 
114 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000759518  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2431  XRE family transcriptional regulator  34.33 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  50.72 
 
 
163 aa  67.8  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0495  XRE family transcriptional regulator  50.82 
 
 
100 aa  68.2  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400235  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0703  XRE family transcriptional regulator  51.72 
 
 
84 aa  67.8  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000971993  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  42.5 
 
 
118 aa  66.6  0.00000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1292  transcriptional regulator, XRE family  35.56 
 
 
110 aa  65.1  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.020008  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  40.79 
 
 
145 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  46.27 
 
 
206 aa  63.5  0.0000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  42.25 
 
 
142 aa  63.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1249  Cro/CI family transcriptional regulator  52.38 
 
 
74 aa  63.2  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  34.62 
 
 
118 aa  63.2  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0471  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.3 
 
 
72 aa  63.5  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0418  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  46.03 
 
 
113 aa  62  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00527482  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0432  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  46.03 
 
 
113 aa  62  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000371645  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0697  transcriptional regulator, XRE family  31.03 
 
 
151 aa  61.6  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2917  transcriptional regulator AnsR  35.04 
 
 
125 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.41229  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2885  ans operon repressor protein  35.04 
 
 
125 aa  61.2  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0484001  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3137  transcriptional regulator AnsR  35.04 
 
 
125 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3138  transcriptional regulator AnsR  35.04 
 
 
125 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  36.9 
 
 
123 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2120  transcriptional regulator AnsR  35.04 
 
 
125 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3117  transcriptional regulator AnsR  35.04 
 
 
125 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2792  XRE family transcriptional regulator  44.93 
 
 
124 aa  61.2  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3160  transcriptional regulator AnsR  35.04 
 
 
125 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.980504  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  42.65 
 
 
104 aa  60.8  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  39.02 
 
 
200 aa  60.5  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000578065  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2847  ans operon repressor protein  34.19 
 
 
125 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0599  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 
73 aa  60.1  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1576  transcriptional regulator, XRE family  41.79 
 
 
75 aa  60.1  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1714  XRE family transcriptional regulator  47.46 
 
 
67 aa  59.7  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000253714  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2433  transcriptional regulator, XRE family  39.44 
 
 
132 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000213647 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1565  transcriptional regulator, XRE family  41.79 
 
 
75 aa  60.1  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1587  transcriptional regulator, XRE family  41.79 
 
 
75 aa  60.1  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0656  transcriptional regulator, XRE family  43.94 
 
 
71 aa  58.9  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6747  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 
115 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0012  transcriptional regulator  40.98 
 
 
131 aa  58.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388282  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2790  transcriptional regulator, XRE family  48.39 
 
 
133 aa  58.2  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000203467  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2431  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 
125 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000620136 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  37.68 
 
 
115 aa  57.8  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  41.54 
 
 
436 aa  57.8  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1067  transcriptional regulator, XRE family  36.76 
 
 
82 aa  57.8  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0145003  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2210  putative DNA-binding protein  49.06 
 
 
61 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0513  transcriptional regulator, XRE family  43.08 
 
 
70 aa  57  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.041665  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  31.5 
 
 
256 aa  57  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0958  transcriptional regulator, XRE family  48.39 
 
 
133 aa  57  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2814  transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 
128 aa  57  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1998  hypothetical protein  37.7 
 
 
142 aa  56.2  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.846621  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2077  hypothetical protein  37.7 
 
 
126 aa  56.2  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3945  transcriptional regulator, XRE family  34.31 
 
 
125 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0843  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 
130 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1628  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 
133 aa  57  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4271  transcriptional regulator, XRE family  34.31 
 
 
125 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.313399 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0468  transcriptional regulator, XRE family  34.33 
 
 
82 aa  55.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000157698  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  38.24 
 
 
206 aa  56.2  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  30.08 
 
 
128 aa  56.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2429  transcriptional regulator, XRE family  42.42 
 
 
127 aa  55.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159098 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  37.8 
 
 
490 aa  55.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  33 
 
 
115 aa  55.5  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  33 
 
 
115 aa  55.5  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2467  transcriptional regulator, XRE family  32.71 
 
 
122 aa  54.7  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000461389  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2209  putative DNA-binding protein  33.66 
 
 
117 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.706329  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2146  transcriptional regulator, XRE family  37.68 
 
 
206 aa  54.3  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0483341  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  35.29 
 
 
92 aa  53.9  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4781  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 
113 aa  54.3  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00061071  normal  0.699893 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3219  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 
125 aa  54.3  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0281  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 
78 aa  54.3  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0335018  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2624  XRE family transcriptional regulator  30.58 
 
 
112 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00551798  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3450  transcriptional regulator protein-like protein  36.59 
 
 
489 aa  54.3  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168406  normal  0.18413 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  40.32 
 
 
144 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4788  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 
114 aa  53.9  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200631  normal  0.763075 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  30.39 
 
 
252 aa  53.9  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4388  helix-turn-helix domain-containing protein  36.92 
 
 
355 aa  53.9  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0058  transcriptional regulator, XRE family  38.57 
 
 
112 aa  53.5  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0711688  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  29.37 
 
 
255 aa  53.5  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3344  DNA-binding protein  35.9 
 
 
374 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.455978  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3317  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 
281 aa  53.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000786405  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  38.36 
 
 
229 aa  53.1  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  36.47 
 
 
149 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0630  helix-turn-helix domain protein  44.44 
 
 
139 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  35.29 
 
 
149 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 
149 aa  52.4  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  35.29 
 
 
149 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3326  DNA-binding protein  35.9 
 
 
374 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>