More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2534 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_2534  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 367 aa  750    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.809153  normal  0.0324751 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5658  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 602 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.525886  normal  0.309242 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5521  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 524 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.90101 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0249  histidine kinase  33.62 
 
 		 459 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0754  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.69 
 
 		 492 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.499334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1445  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 		 390 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3383  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 		 548 aa  113  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.918408  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2454  histidine kinase  29 
 
 		 367 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000691569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0147  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 		 588 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.96879 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72390  putative two-component sensor  35.45 
 
 		 595 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6820  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 532 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 		 519 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.916439  normal  0.413843 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0149  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 		 593 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 		 592 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.207763 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0264  PAS  31.96 
 
 		 595 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3530  histidine kinase  30.31 
 
 		 548 aa  109  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0132  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 		 593 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3074  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 		 378 aa  108  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 		 502 aa  108  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1395  histidine kinase  32.29 
 
 		 581 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0977  histidine kinase  29.61 
 
 		 551 aa  108  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0254133 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2207  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 		 760 aa  108  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166244 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3466  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 		 548 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0535402  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6283  alginate biosynthesis sensor protein KinB  32.73 
 
 		 595 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0189  histidine kinase  30.8 
 
 		 598 aa  106  6e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.602586 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  28.26 
 
 		 1427 aa  106  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6300  histidine kinase  31.2 
 
 		 1255 aa  105  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.396058 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1384  sensory histidine kinase AtoS  31.28 
 
 		 617 aa  105  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2748  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.82 
 
 		 476 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.662437  normal  0.393877 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0694  external sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 		 592 aa  105  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.52754  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3892  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 		 512 aa  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0336  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 		 612 aa  104  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.84228  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0471  sensor histidine kinase  25.62 
 
 		 419 aa  104  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.328588  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1319  sensor histidine kinase  28.76 
 
 		 367 aa  104  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0335  sensory box histidine kinase  31.63 
 
 		 595 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0620  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 		 518 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3741  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 		 367 aa  104  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.49679  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0047  alginate biosynthesis sensor protein KinB  31.96 
 
 		 596 aa  104  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0989  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 		 477 aa  104  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1396  sensor histidine kinase/response regulator  30.3 
 
 		 1092 aa  103  4e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0903  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.76 
 
 		 1262 aa  103  4e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3018  Signal transduction histidine kinase, NtrY  31.58 
 
 		 712 aa  103  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2207  multi-sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 		 866 aa  103  5e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1428  histidine kinase  27.37 
 
 		 457 aa  103  6e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3168  histidine kinase  28.44 
 
 		 369 aa  103  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2669  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.24 
 
 		 1047 aa  103  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2364  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.26 
 
 		 646 aa  102  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.765238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1992  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 		 372 aa  103  7e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0711  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 		 702 aa  103  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4097  nitrogen regulation protein NR(II)  26.3 
 
 		 349 aa  103  7e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.744488 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_887  sensor histidine kinase/response regulator  29.22 
 
 		 1258 aa  102  9e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2923  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.91 
 
 		 541 aa  102  9e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252505  hitchhiker  0.00000000439976 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2017  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.56 
 
 		 422 aa  102  9e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2742  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.53 
 
 		 544 aa  102  9e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.617202  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1495  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 		 579 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1365  histidine kinase  30.57 
 
 		 496 aa  102  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4254  nitrogen regulation protein NR(II)  26.74 
 
 		 349 aa  102  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.388785 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1590  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.09 
 
 		 447 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.632481 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0065  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 		 377 aa  102  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1928  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 920 aa  102  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1094  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 		 364 aa  102  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 		 1029 aa  101  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135444  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.54 
 
 		 612 aa  102  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0530317 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1188  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 		 679 aa  101  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91419 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2392  histidine kinase  34.78 
 
 		 502 aa  101  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4128  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.28 
 
 		 752 aa  102  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.43986 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28 
 
 		 1415 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2943  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 586 aa  101  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4395  nitrogen regulation protein NR(II)  26.37 
 
 		 349 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0599  sensor histidine kinase  30.33 
 
 		 516 aa  100  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.712445  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0201  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.28 
 
 		 408 aa  100  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0646  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 		 484 aa  100  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.609641  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03754  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with GlnG  26.37 
 
 		 349 aa  100  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4117  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.37 
 
 		 349 aa  100  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4391  nitrogen regulation protein NR(II)  26.37 
 
 		 349 aa  100  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.132536  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.11 
 
 		 492 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251898  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5315  nitrogen regulation protein NR(II)  26.37 
 
 		 349 aa  100  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.962522  normal  0.565649 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4096  nitrogen regulation protein NR(II)  26.37 
 
 		 349 aa  100  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4147  nitrogen regulation protein NR(II)  26.37 
 
 		 349 aa  100  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.208237 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1566  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.33 
 
 		 1047 aa  100  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03703  hypothetical protein  26.37 
 
 		 349 aa  100  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 		 368 aa  100  4e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.834527  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1004  sensory box histidine kinase  30.52 
 
 		 363 aa  100  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.27324  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3077  Signal transduction histidine kinase  27.64 
 
 		 492 aa  100  5e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3208  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  29.49 
 
 		 702 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.289512 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4471  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.22 
 
 		 677 aa  100  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.465536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0066  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.38 
 
 		 748 aa  100  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2116  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 		 524 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0941  sensor histidine kinase, putative  28.21 
 
 		 248 aa  100  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2762  GAF sensor Signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 		 373 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0037  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 387 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4259  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.59 
 
 		 804 aa  99.8  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3414  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.46 
 
 		 406 aa  99.8  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1628  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 		 929 aa  99.8  8e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1983  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.59 
 
 		 847 aa  99.8  8e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.138459 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1439  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.85 
 
 		 608 aa  99.4  9e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2473  sensor histidine kinase  30.2 
 
 		 493 aa  99.4  9e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0696  histidine kinase  25.85 
 
 		 248 aa  99.4  9e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0073771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1431  sensory histidine kinase AtoS  28.85 
 
 		 608 aa  99.4  9e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250093  hitchhiker  0.00150562 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2368  sensory histidine kinase AtoS  28.85 
 
 		 608 aa  99.4  9e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>