More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4420 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  100 
 
 
418 aa  845  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  70.43 
 
 
424 aa  615  1e-175  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  70.8 
 
 
425 aa  610  1e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  68.01 
 
 
434 aa  578  1e-164  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  64.61 
 
 
423 aa  575  1e-163  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  64.99 
 
 
435 aa  569  1e-161  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  67.8 
 
 
445 aa  567  1e-160  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  64.9 
 
 
434 aa  561  1e-159  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6095  geranylgeranyl reductase  66.27 
 
 
440 aa  546  1e-154  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0614228 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  64.75 
 
 
423 aa  520  1e-146  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  64.03 
 
 
423 aa  516  1e-145  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  59.43 
 
 
457 aa  501  1e-141  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  56.84 
 
 
431 aa  486  1e-136  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  59.38 
 
 
430 aa  483  1e-135  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  55.71 
 
 
430 aa  478  1e-134  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  57.73 
 
 
426 aa  477  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2717  geranylgeranyl reductase  57.62 
 
 
443 aa  470  1e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  55.79 
 
 
431 aa  456  1e-127  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07370  geranylgeranyl reductase family protein  54.85 
 
 
431 aa  457  1e-127  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0284516 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03150  geranylgeranyl reductase family protein  55.98 
 
 
424 aa  454  1e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.992088  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  52.48 
 
 
419 aa  412  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2826  geranylgeranyl reductase  51.77 
 
 
443 aa  409  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0858816 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3131  geranylgeranyl reductase  50.59 
 
 
444 aa  395  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17730  geranylgeranyl reductase family protein  45.75 
 
 
466 aa  335  9e-91  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0362  geranylgeranyl reductase  38.88 
 
 
436 aa  239  7e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.495463  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1099  geranylgeranyl reductase  39.66 
 
 
435 aa  211  2e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.997696  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  36.31 
 
 
393 aa  211  3e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  36.51 
 
 
393 aa  210  4e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0784  geranylgeranyl reductase  38.27 
 
 
406 aa  202  9e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0765  geranylgeranyl reductase  38.42 
 
 
406 aa  202  1e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.616022  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0770  geranylgeranyl reductase  36.32 
 
 
400 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10571  oxidoreductase  37.2 
 
 
408 aa  199  7e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.649109  normal  0.274108 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5254  geranylgeranyl reductase  37.78 
 
 
416 aa  198  2e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1826  geranylgeranyl reductase  36.36 
 
 
393 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1873  geranylgeranyl reductase  36.36 
 
 
393 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700646  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1807  geranylgeranyl reductase  36.07 
 
 
393 aa  192  9e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.622254  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0991  geranylgeranyl reductase  34.22 
 
 
418 aa  188  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0948  geranylgeranyl reductase  36.02 
 
 
417 aa  186  5e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.3862  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0714  geranylgeranyl reductase  36.27 
 
 
415 aa  179  8e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  35.33 
 
 
413 aa  159  7e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  34.71 
 
 
411 aa  154  3e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  32.63 
 
 
384 aa  150  5e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1294  geranylgeranyl reductase  37.5 
 
 
420 aa  148  2e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.730528  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  31.91 
 
 
376 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  33.33 
 
 
398 aa  138  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0390  monooxygenase FAD-binding  34.73 
 
 
425 aa  137  3e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0398453 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  33.33 
 
 
375 aa  130  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0164  putative electron transfer oxidoreductase  35.91 
 
 
420 aa  131  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.762503  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  33.12 
 
 
409 aa  127  4e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  29.48 
 
 
398 aa  124  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  28.94 
 
 
389 aa  118  2e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  27.62 
 
 
382 aa  117  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  28.33 
 
 
390 aa  116  7e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  31.97 
 
 
385 aa  115  1e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  33.24 
 
 
378 aa  114  2e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  4.24296e-05 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5969  geranylgeranyl reductase  32.31 
 
 
409 aa  114  4e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.365894  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  26.75 
 
 
376 aa  113  7e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  29.2 
 
 
408 aa  112  8e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0830  geranylgeranyl reductase  27.55 
 
 
415 aa  112  9e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  31.38 
 
 
379 aa  110  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  28.19 
 
 
398 aa  108  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2388  flavoprotein-containing dehydrogenase  31.71 
 
 
414 aa  107  6e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0523144  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  29.82 
 
 
406 aa  106  7e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6208  monooxygenase FAD-binding protein  30.62 
 
 
403 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00171157  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  32.83 
 
 
384 aa  103  5e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3185  monooxygenase FAD-binding protein  28.74 
 
 
375 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.388588  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1073  geranylgeranyl reductase  30.95 
 
 
452 aa  100  6e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0173  geranylgeranyl reductase  29.33 
 
 
405 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  6.08264e-05  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  27 
 
 
390 aa  99  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2189  geranylgeranyl reductase  32.9 
 
 
383 aa  98.6  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  32.22 
 
 
407 aa  98.6  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  27.4 
 
 
402 aa  98.6  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  27.71 
 
 
370 aa  98.6  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1823  geranylgeranyl reductase  30.61 
 
 
406 aa  98.6  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626977  normal  0.601961 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1161  geranylgeranyl reductase  30.62 
 
 
429 aa  97.8  3e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2702  geranylgeranyl reductase  32.94 
 
 
401 aa  97.4  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  25.62 
 
 
390 aa  97.4  4e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  29.01 
 
 
396 aa  97.4  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0508  geranylgeranyl reductase  33.05 
 
 
376 aa  97.4  4e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  31.51 
 
 
403 aa  97.4  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4276  geranylgeranyl reductase  27.93 
 
 
405 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0178  geranylgeranyl reductase  29.38 
 
 
405 aa  97.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  30.37 
 
 
506 aa  96.7  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  30.46 
 
 
384 aa  95.5  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.25722e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  27.64 
 
 
395 aa  95.9  1e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0388  geranylgeranyl reductase  26.95 
 
 
362 aa  94  4e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  32.56 
 
 
400 aa  94  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  25.68 
 
 
387 aa  92.8  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  26.17 
 
 
390 aa  92.8  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4038  geranylgeranyl reductase  30.4 
 
 
406 aa  92.4  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.670598  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0660  geranylgeranyl reductase  29.87 
 
 
406 aa  91.3  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0877902 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3265  geranylgeranyl reductase  28.53 
 
 
406 aa  90.9  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0200135 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16731  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  26.61 
 
 
468 aa  90.5  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  27.3 
 
 
391 aa  90.1  7e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1825  FAD dependent oxidoreductase  23.34 
 
 
455 aa  89  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133963  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0808  geranylgeranyl reductase  32.72 
 
 
406 aa  89.4  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.967973  hitchhiker  0.000310699 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  28.04 
 
 
441 aa  88.2  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1347  geranylgeranyl reductase  28.86 
 
 
453 aa  87.8  3e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0129504  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1955  hypothetical protein  30.58 
 
 
405 aa  87.8  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1497  geranylgeranyl reductase  28.37 
 
 
418 aa  87.4  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>