More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2148 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2148  PfkB domain-containing protein  100 
 
 		 312 aa  607  1e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.950763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6402  kinase, PfkB family  66.33 
 
 		 316 aa  365  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223985  normal  0.0576873 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1627  PfkB domain protein  43.39 
 
 		 309 aa  189  4e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  42.37 
 
 		 297 aa  189  5.999999999999999e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  43.6 
 
 		 303 aa  186  5e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2129  putative sugar kinase  42.37 
 
 		 298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.101939  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3300  PfkB domain protein  41.67 
 
 		 314 aa  183  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  40.94 
 
 		 304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2385  PfkB domain-containing protein  42.03 
 
 		 297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.790997  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  41.89 
 
 		 300 aa  168  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3558  PfkB domain protein  44.86 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.321996  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1470  ribokinase-like domain-containing protein  40.75 
 
 		 298 aa  151  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  32.8 
 
 		 317 aa  151  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1435  ribokinase-like domain-containing protein  40.07 
 
 		 293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000559808 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2001  PfkB domain protein  35.84 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24440  sugar kinase, ribokinase  37.96 
 
 		 288 aa  144  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.480444  normal  0.238886 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1580  ribokinase-like domain-containing protein  36.05 
 
 		 309 aa  136  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0863941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0416  PfkB  33.67 
 
 		 320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3778  PfkB domain protein  37.76 
 
 		 297 aa  123  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00891877  normal  0.801682 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1170  PfkB domain-containing protein  30.98 
 
 		 305 aa  113  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0154398  normal  0.362053 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2615  PfkB domain protein  31.29 
 
 		 305 aa  109  7.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2854  ribokinase-like domain-containing protein  33.83 
 
 		 328 aa  104  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000011716  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1142  PfkB  32.44 
 
 		 310 aa  99  8e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0676537  normal  0.093061 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  33.23 
 
 		 331 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2565  ribokinase-like domain-containing protein  35.36 
 
 		 333 aa  97.1  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  29.43 
 
 		 312 aa  94.7  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  34.91 
 
 		 338 aa  94  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  32.52 
 
 		 331 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4407  PfkB domain protein  29.75 
 
 		 330 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  32.2 
 
 		 337 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4087  PfkB domain protein  29.25 
 
 		 330 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  31.27 
 
 		 337 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  31.25 
 
 		 337 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  31.25 
 
 		 337 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  30.62 
 
 		 330 aa  90.9  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  28.96 
 
 		 299 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  33.85 
 
 		 407 aa  89.7  6e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  30.32 
 
 		 304 aa  89.4  8e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  34.17 
 
 		 360 aa  88.2  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  30.39 
 
 		 306 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  27.99 
 
 		 333 aa  87  4e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  25.57 
 
 		 338 aa  86.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2764  PfkB domain protein  35.49 
 
 		 289 aa  86.3  6e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.11778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  27.36 
 
 		 330 aa  85.9  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3378  ribokinase-like domain-containing protein  28.89 
 
 		 330 aa  85.5  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2482  ribokinase-like domain-containing protein  30.69 
 
 		 349 aa  85.1  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1976  putative ribokinase  33.66 
 
 		 305 aa  85.5  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.191043  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2146  fructokinase protein  33.77 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000404752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  29 
 
 		 334 aa  84.3  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0447  ribokinase-like domain-containing protein  26.49 
 
 		 301 aa  84.7  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  32.08 
 
 		 315 aa  84  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  32.26 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4692  PfkB domain protein  35.81 
 
 		 307 aa  83.6  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.099486  normal  0.349994 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0873  ribokinase-like domain-containing protein  35.21 
 
 		 315 aa  83.6  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.763397  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  33.33 
 
 		 314 aa  83.2  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  28.04 
 
 		 333 aa  82.8  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0215  ribokinase-like domain-containing protein  31.48 
 
 		 333 aa  82.8  0.000000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.26013  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  33.84 
 
 		 331 aa  82.4  0.000000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0615  PfkB  30.13 
 
 		 317 aa  81.6  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2283  ribokinase  32.71 
 
 		 310 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  29.74 
 
 		 315 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6290  ribokinase  30.92 
 
 		 320 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.631078 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0457  ribokinase-like domain-containing protein  30.72 
 
 		 313 aa  81.3  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  28.68 
 
 		 320 aa  81.6  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1845  ribokinase-like domain-containing protein  32.35 
 
 		 341 aa  80.9  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273033  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  33.55 
 
 		 320 aa  80.9  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3022  PfkB domain protein  32.35 
 
 		 333 aa  81.3  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.523599  normal  0.417909 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0147  ribokinase-like domain-containing protein  30.92 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.719935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  29.1 
 
 		 315 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  29.74 
 
 		 315 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1539  ribokinase  30.59 
 
 		 320 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7361  ribokinase  29.8 
 
 		 308 aa  80.1  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  29.37 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  29.37 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  29.37 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05631  carbohydrate kinase  26.21 
 
 		 335 aa  80.1  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.577343 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  31.33 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1228  ribokinase-like domain-containing protein  30.92 
 
 		 337 aa  80.1  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  29.37 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4013  ribokinase-like domain-containing protein  30.72 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0819  cell division protein FtsA  31.06 
 
 		 328 aa  79.7  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000392808  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2872  ribokinase-like domain-containing protein  30.63 
 
 		 335 aa  79.7  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1165  PfkB domain protein  31.48 
 
 		 335 aa  79.3  0.00000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188666 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  30.1 
 
 		 302 aa  78.6  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1838  carbohydrate kinase  26.22 
 
 		 335 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  30.36 
 
 		 333 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  32.12 
 
 		 333 aa  78.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0251  PfkB  32.35 
 
 		 333 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2556  PfkB domain protein  35.39 
 
 		 316 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1278  PfkB domain-containing protein  31.89 
 
 		 317 aa  78.2  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0457  PfkB  30.63 
 
 		 333 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2652  PfkB domain protein  34.98 
 
 		 316 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3107  ribokinase-like domain-containing protein  30 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00442891  hitchhiker  0.000119063 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  28.68 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  32.59 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2297  ribokinase  31.11 
 
 		 309 aa  77  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0434925  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0562  PfkB domain protein  29.62 
 
 		 328 aa  77  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  28.9 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0987  ribokinase  27.05 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.135221  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3538  PfkB domain protein  29.06 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000797657  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>