More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0982 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0982  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  100 
 
 		 312 aa  628  1e-179  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.165427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3623  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  47.79 
 
 		 294 aa  209  7e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.619094  normal  0.846236 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0448  peptidase M48 Ste24p  39.51 
 
 		 292 aa  147  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0464  peptidase M48 Ste24p  39.02 
 
 		 292 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1260  hypothetical protein  40.17 
 
 		 275 aa  136  6.0000000000000005e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.617614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0989  peptidase M48 Ste24p  37.56 
 
 		 270 aa  135  7.000000000000001e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.168656  hitchhiker  0.00764497 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2381  peptidase M48, Ste24p  34.68 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5784  putative lipoprotein  38.89 
 
 		 479 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66690  putative protease  38.43 
 
 		 479 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1887  peptidase M48, Ste24p  33.9 
 
 		 315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2250  peptidase M48, Ste24p  31.95 
 
 		 284 aa  123  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.581419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0670  peptidase M48, Ste24p  35.68 
 
 		 288 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00234542  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0539  peptidase M48, Ste24p  36.11 
 
 		 478 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3882  peptidase M48, Ste24p  36.07 
 
 		 340 aa  119  9e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4327  peptidase M48 Ste24p  36.28 
 
 		 286 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  37.62 
 
 		 493 aa  118  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0040  hypothetical protein  38.2 
 
 		 513 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.257159 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4160  peptidase M48 Ste24p  29.72 
 
 		 489 aa  116  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0504491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  32.34 
 
 		 424 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  33.5 
 
 		 489 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0410  M48 family peptidase  31.65 
 
 		 288 aa  113  4.0000000000000004e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000410475  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1212  peptidase M48  31.16 
 
 		 285 aa  113  4.0000000000000004e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2828  peptidase M48 Ste24p  35.75 
 
 		 284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  33.17 
 
 		 489 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  30.54 
 
 		 280 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  33.66 
 
 		 489 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  37.1 
 
 		 479 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4877  peptidase M48 Ste24p  30.99 
 
 		 492 aa  109  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1307  hypothetical protein  35.2 
 
 		 490 aa  108  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.31128  normal  0.470451 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3182  peptidase M48 Ste24p  33.18 
 
 		 487 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258553  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1134  peptidase M48 Ste24p  33.18 
 
 		 487 aa  106  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  35.62 
 
 		 436 aa  106  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776404  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3517  peptidase M48 Ste24p  31.22 
 
 		 487 aa  106  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000725556  normal  0.963067 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0123  peptidase M48 Ste24p  29.61 
 
 		 279 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3305  peptidase M48, Ste24p  31.36 
 
 		 278 aa  105  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.137005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  36.32 
 
 		 494 aa  105  7e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0120  peptidase M48 Ste24p  29.61 
 
 		 279 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0733637 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  33.64 
 
 		 504 aa  105  8e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0867  peptidase M48, Ste24p  33.49 
 
 		 427 aa  105  8e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1755  peptidase M48 Ste24p  31.31 
 
 		 493 aa  105  9e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3171  peptidase M48 Ste24p  31.35 
 
 		 445 aa  103  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3716  peptidase, M48 family  29.27 
 
 		 487 aa  103  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.997857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1099  peptidase M48, Ste24p  33.17 
 
 		 365 aa  103  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000343868  hitchhiker  0.000201004 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1795  peptidase M48, Ste24p  34.26 
 
 		 513 aa  103  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02386  predicted peptidase  29.27 
 
 		 487 aa  103  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0985911  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1175  peptidase M48 Ste24p  29.27 
 
 		 487 aa  103  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.108568  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2628  M48 family peptidase  29.27 
 
 		 487 aa  103  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3127  M48 family peptidase  31.6 
 
 		 494 aa  103  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000135694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2776  M48 family peptidase  29.27 
 
 		 487 aa  103  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00342563  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2641  M48 family peptidase  29.27 
 
 		 487 aa  103  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.938933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0404  peptidase M48 Ste24p  30.73 
 
 		 604 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.527715  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02348  hypothetical protein  29.27 
 
 		 487 aa  103  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.14863  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1182  peptidase M48 Ste24p  29.27 
 
 		 487 aa  103  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0564416 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1239  M48 family peptidase  31.6 
 
 		 494 aa  103  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000273921  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1069  peptidase M48 Ste24p  33.18 
 
 		 488 aa  103  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1356  peptidase M48 Ste24p  31.6 
 
 		 524 aa  103  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2641  TPR repeat-containing protein YfgC  30.62 
 
 		 487 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00482944  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2731  TPR repeat-containing protein YfgC  30.62 
 
 		 487 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.211116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2862  TPR repeat-containing protein YfgC  30.62 
 
 		 487 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2689  TPR repeat-containing protein YfgC  30.62 
 
 		 487 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.534359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2753  TPR repeat-containing protein YfgC  30.62 
 
 		 487 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  32.26 
 
 		 484 aa  102  9e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2868  peptidase, M48 family  29.67 
 
 		 487 aa  102  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2122  TPR repeat-containing protein  29.6 
 
 		 483 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318434  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2400  peptidase M48, Ste24p  30.43 
 
 		 550 aa  102  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0992443  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  28.97 
 
 		 282 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  28.9 
 
 		 268 aa  100  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2978  peptidase M48, Ste24p  30.14 
 
 		 487 aa  100  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.604124  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  28.7 
 
 		 268 aa  99.4  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2197  hypothetical protein  33.94 
 
 		 265 aa  98.2  1e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  32.11 
 
 		 500 aa  98.6  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2169  peptidase M48 Ste24p  29.54 
 
 		 486 aa  97.8  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1543  peptidase M48, Ste24p  31.7 
 
 		 477 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.457387  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2987  peptidase M48 Ste24p  29.3 
 
 		 487 aa  97.8  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.595956  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0012  peptidase M48, Ste24p  29.73 
 
 		 284 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3958  hypothetical protein  31.75 
 
 		 477 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1200  peptidase M48 Ste24p  32.1 
 
 		 275 aa  97.1  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.724049 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3980  peptidase M48 Ste24p  31.56 
 
 		 478 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3647  peptidase M48, Ste24p  30.14 
 
 		 480 aa  97.1  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00143596  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  27.27 
 
 		 479 aa  96.3  6e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0130  peptidase M48, Ste24p  29.35 
 
 		 528 aa  96.3  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0628  peptidase M48 Ste24p  31.53 
 
 		 480 aa  95.9  7e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.173678 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1232  hypothetical protein  31.11 
 
 		 478 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.705832 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1262  peptidase M48, Ste24p  31.11 
 
 		 478 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349395  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1841  peptidase M48, Ste24p  31.86 
 
 		 485 aa  95.1  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.891186  normal  0.107833 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4186  peptidase M48 Ste24p  31.11 
 
 		 478 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.129955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0844  peptidase M48 Ste24p  31.08 
 
 		 470 aa  94.7  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000290245  normal  0.0785618 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3190  hypothetical protein  28.38 
 
 		 483 aa  94.4  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.602192  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000181  Zn-dependent protease with chaperone function  30.74 
 
 		 262 aa  94.4  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.787256  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0200  peptidase M48, Ste24p  30.28 
 
 		 475 aa  94.7  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0178367 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0482  peptidase M48 Ste24p  31.5 
 
 		 569 aa  94.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0469  peptidase M48 Ste24p  31.5 
 
 		 567 aa  94.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0926  peptidase M48, Ste24p  30.45 
 
 		 481 aa  94  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.240705 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3748  regulatory protein, ArsR  32.37 
 
 		 423 aa  94  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2567  peptidase M48, Ste24p  28.57 
 
 		 392 aa  93.6  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0107  putative lipoprotein  32.12 
 
 		 262 aa  93.2  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1658  peptidase M48, Ste24p  30.45 
 
 		 477 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.782843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0402  peptidase M48, Ste24p  32.04 
 
 		 529 aa  92.8  6e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  31.3 
 
 		 605 aa  92.8  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3332  peptidase M48, Ste24p  28.24 
 
 		 268 aa  93.2  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.835171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>