More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0715 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0715  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 698 aa  1420    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5029  TonB-dependent siderophore receptor  44.54 
 
 		 708 aa  560  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0747  TonB-dependent siderophore receptor  43.49 
 
 		 702 aa  553  1e-156  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.429786 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0800  putative ferrisiderophore receptor signal peptide protein  42.39 
 
 		 705 aa  552  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0817  TonB-dependent siderophore receptor  43.06 
 
 		 702 aa  544  1e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.682704 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5036  TonB-dependent siderophore receptor  32.67 
 
 		 751 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.549683 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3576  TonB-dependent siderophore receptor  32.01 
 
 		 743 aa  297  5e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0391438 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5420  TonB-dependent siderophore receptor  31.86 
 
 		 743 aa  296  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00589363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3848  TonB-dependent siderophore receptor  31.92 
 
 		 743 aa  294  3e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4689  TonB-dependent siderophore receptor  31.87 
 
 		 743 aa  289  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141202  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3674  TonB-dependent siderophore receptor  31.87 
 
 		 743 aa  289  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2436  TonB-dependent siderophore receptor  31.56 
 
 		 743 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.849974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3864  TonB-dependent siderophore receptor  33.19 
 
 		 710 aa  287  4e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0182976  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1847  TonB-dependent siderophore receptor  32.56 
 
 		 729 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.343723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3769  TonB-dependent siderophore receptor  32.86 
 
 		 724 aa  276  9e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.503702  normal  0.128914 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1424  TonB-dependent siderophore receptor  32.31 
 
 		 710 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550485 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1460  TonB-dependent siderophore receptor  32.58 
 
 		 712 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0192209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1993  TonB-dependent siderophore receptor  31.99 
 
 		 719 aa  265  2e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.811377  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1610  TonB-dependent siderophore receptor, putative  31.55 
 
 		 724 aa  262  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.317263  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3686  TonB-dependent siderophore receptor  30.76 
 
 		 754 aa  259  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00871  ferric siderophore receptor protein  31.57 
 
 		 746 aa  251  4e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.619675  normal  0.877748 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3358  TonB-dependent siderophore receptor  29 
 
 		 808 aa  250  6e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.260724  normal  0.726447 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4497  ferric siderophore receptor protein (TonB-dependent siderophore receptor)  30.54 
 
 		 744 aa  249  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504252  normal  0.0702404 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02690  TonB-dependent outer membrane Receptor  30.14 
 
 		 704 aa  249  2e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1878  TonB-dependent siderophore receptor  30.49 
 
 		 722 aa  248  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3327  TonB-dependent siderophore receptor  29.46 
 
 		 804 aa  244  5e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218834 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30860  TonB-dependent siderophore receptor  29.2 
 
 		 710 aa  241  5e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.950998  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2582  TonB-dependent siderophore receptor  28.97 
 
 		 802 aa  239  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.431715  normal  0.0101305 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3544  TonB-dependent siderophore receptor  29.25 
 
 		 727 aa  238  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4499  TonB-dependent siderophore receptor  30.29 
 
 		 706 aa  238  3e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.883355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1104  TonB-dependent siderophore receptor  27.77 
 
 		 728 aa  238  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413225  normal  0.151659 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3225  TonB-dependent siderophore receptor  29.69 
 
 		 715 aa  238  3e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.251172  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1003  TonB-dependent siderophore receptor  32.08 
 
 		 758 aa  237  6e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5515  TonB-dependent siderophore receptor  30.13 
 
 		 726 aa  236  8e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0150  TonB-dependent siderophore receptor  29.35 
 
 		 729 aa  234  3e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2781  TonB-dependent siderophore receptor  30.13 
 
 		 805 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150566  normal  0.217763 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2129  TonB-dependent siderophore receptor  29.95 
 
 		 722 aa  234  5e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.759874  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3084  TonB-dependent siderophore receptor  29.84 
 
 		 819 aa  230  8e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39820  putative tonB-dependent receptor protein  28.68 
 
 		 804 aa  229  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2123  TonB-dependent siderophore receptor  29.44 
 
 		 725 aa  227  6e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4013  TonB-dependent siderophore receptor  29.34 
 
 		 879 aa  224  3e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.302904 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4406  TonB-dependent siderophore receptor  31.03 
 
 		 709 aa  224  4e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684267  normal  0.0387925 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0972  TonB-dependent siderophore receptor  27.7 
 
 		 762 aa  224  4.9999999999999996e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.804591  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1110  TonB-dependent siderophore receptor  29.33 
 
 		 768 aa  223  7e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2339  TonB-dependent siderophore receptor  28.29 
 
 		 800 aa  223  8e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39890  TonB-dependent siderophore receptor  28.51 
 
 		 708 aa  223  8e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596471  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3385  TonB-dependent siderophore receptor  27.31 
 
 		 730 aa  223  9e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5891  TonB-dependent siderophore receptor  28.84 
 
 		 772 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3374  putative tonB-dependent receptor protein  28.38 
 
 		 804 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2186  TonB-dependent siderophore receptor  28.84 
 
 		 772 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1108  TonB-dependent siderophore receptor  28.9 
 
 		 761 aa  222  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.441045 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4052  TonB-dependent siderophore receptor  29.05 
 
 		 839 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2590  outer membrane ferric siderophore receptor  29.84 
 
 		 771 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.238925 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3757  TonB-dependent siderophore receptor  29.05 
 
 		 851 aa  221  3e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0566087 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2394  TonB-dependent siderophore receptor  28.09 
 
 		 729 aa  221  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3029  TonB-dependent siderophore receptor  27.5 
 
 		 718 aa  220  5e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1088  TonB-dependent siderophore receptor  28.23 
 
 		 737 aa  218  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0225  TonB-dependent siderophore receptor  29.13 
 
 		 707 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2858  TonB-dependent siderophore receptor  28.92 
 
 		 756 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578501  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3575  TonB-dependent siderophore receptor  27.92 
 
 		 801 aa  217  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3527  TonB-dependent siderophore receptor  30.22 
 
 		 761 aa  217  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2864  TonB-dependent siderophore receptor  28.83 
 
 		 707 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0243  TonB-dependent siderophore receptor  28.83 
 
 		 707 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2196  TonB-dependent siderophore receptor  27.77 
 
 		 801 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02105  hypothetical protein  28.39 
 
 		 730 aa  214  4.9999999999999996e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0434  TonB-dependent siderophore receptor  28.35 
 
 		 753 aa  214  5.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3007  TonB-dependent siderophore receptor  29.51 
 
 		 730 aa  213  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796938 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3462  TonB-dependent siderophore receptor  28.26 
 
 		 728 aa  212  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3864  TonB-dependent siderophore receptor  26.42 
 
 		 811 aa  212  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.952597 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2049  TonB-dependent siderophore receptor  29.77 
 
 		 764 aa  212  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379645  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2064  TonB-dependent siderophore receptor  29.94 
 
 		 734 aa  212  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000430928 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3345  TonB-dependent siderophore receptor  28.53 
 
 		 738 aa  211  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3798  TonB-dependent siderophore receptor  28.45 
 
 		 809 aa  211  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2237  TonB-dependent siderophore receptor  26.92 
 
 		 777 aa  211  5e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4128  TonB-dependent siderophore receptor  25.57 
 
 		 811 aa  210  7e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3243  TonB-dependent siderophore receptor  28.22 
 
 		 728 aa  210  9e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.181533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0629  putative ferric siderophore receptor protein  29.76 
 
 		 700 aa  209  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.466758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4403  TonB-dependent siderophore receptor  28.39 
 
 		 773 aa  206  9e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.109366 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3905  TonB-dependent siderophore receptor  29.61 
 
 		 731 aa  204  4e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6957  TonB-dependent siderophore receptor  28.38 
 
 		 749 aa  204  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3719  TonB-dependent siderophore receptor  27.7 
 
 		 753 aa  204  4e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525992  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2469  TonB-dependent siderophore receptor  27.52 
 
 		 768 aa  204  5e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000279609  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0531  TonB-dependent siderophore receptor  26.44 
 
 		 727 aa  204  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.45334 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2373  ferrichrome receptor FcuA  27.52 
 
 		 763 aa  204  5e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000216306  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1656  ferrichrome receptor FcuA  27.43 
 
 		 720 aa  203  9.999999999999999e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000210688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4079  TonB-dependent siderophore receptor  26.32 
 
 		 727 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1714  TonB-dependent siderophore receptor  26.69 
 
 		 729 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.666149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2068  TonB-dependent siderophore receptor  28.06 
 
 		 729 aa  201  3e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.839532  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1736  TonB-dependent receptor protein  27.74 
 
 		 737 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00567556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4079  TonB-dependent siderophore receptor  29.39 
 
 		 729 aa  201  5e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.502501  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3800  TonB-dependent siderophore receptor  28.86 
 
 		 712 aa  200  6e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.647138 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5451  TonB-dependent siderophore receptor  28.49 
 
 		 823 aa  200  9e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.877438 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4363  TonB-dependent siderophore receptor  26.77 
 
 		 706 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000323777  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4307  TonB-dependent siderophore receptor  26.77 
 
 		 706 aa  198  3e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000234699  hitchhiker  0.000000000225287 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1625  TonB-dependent siderophore receptor  26.53 
 
 		 746 aa  197  5.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.930758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2620  TonB-dependent siderophore receptor  28.39 
 
 		 770 aa  197  7e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526793  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2294  TonB-dependent siderophore receptor  27.95 
 
 		 773 aa  196  8.000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1183  TonB-dependent siderophore receptor  27.3 
 
 		 757 aa  196  8.000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4362  TonB-dependent siderophore receptor  26.13 
 
 		 706 aa  193  7e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000023504  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0859  TonB-dependent siderophore receptor  26.43 
 
 		 716 aa  193  9e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308459  normal  0.654986 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>