More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0354 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0354  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 315 aa  617  1e-176  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.322397 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2453  sodium-type flagellar protein MotY, putative  28.4 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.230815  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0965  ompA family protein  33.33 
 
 		 562 aa  60.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3825  OmpA/MotB domain-containing protein  38.61 
 
 		 729 aa  58.9  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2186  OmpA/MotB  31.82 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.813055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1398  OmpA/MotB  24.62 
 
 		 289 aa  57  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  34.34 
 
 		 224 aa  55.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  33.65 
 
 		 352 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0858  OmpA/MotB domain-containing protein  33.65 
 
 		 214 aa  53.9  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  27.31 
 
 		 537 aa  53.5  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1825  OmpA/MotB  34.62 
 
 		 215 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000764276  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2441  OmpA/MotB domain-containing protein  34.62 
 
 		 215 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000422184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2436  OmpA/MotB domain-containing protein  34.62 
 
 		 215 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140056  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  34.62 
 
 		 330 aa  53.5  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1412  OmpA/MotB domain-containing protein  38.89 
 
 		 321 aa  53.1  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.166227  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3893  OmpA/MotB  24.81 
 
 		 300 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1457  OmpA/MotB domain-containing protein  24.46 
 
 		 289 aa  52.8  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.298949  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3328  OmpA/MotB  34.58 
 
 		 273 aa  52.4  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2427  putative outer membrane protein  23.86 
 
 		 322 aa  52.4  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.831688 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0626  OmpA/MotB domain-containing protein  28.47 
 
 		 768 aa  52.4  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  33.66 
 
 		 412 aa  52.4  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49900  hypothetical protein  36.27 
 
 		 168 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.482093 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1164  ompA family protein  29.2 
 
 		 229 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0821  ompA family protein  34.31 
 
 		 168 aa  52  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4703  OmpA/MotB  30.39 
 
 		 237 aa  52  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0558247 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  33.65 
 
 		 220 aa  52  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15220  outer membrane protein, OmpA/MotB family  39.81 
 
 		 270 aa  52.4  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5767  OmpA/MotB family protein  33.65 
 
 		 214 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00312455  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3488  ompA family protein  34.31 
 
 		 168 aa  52  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3617  OmpA/MotB domain-containing protein  34.31 
 
 		 168 aa  52  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0553  OmpA/MotB domain-containing protein  37.84 
 
 		 224 aa  52  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41140  OmpA family protein  30.71 
 
 		 222 aa  51.6  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  30.3 
 
 		 277 aa  51.6  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2189  ompA family protein  36.89 
 
 		 271 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  32.67 
 
 		 364 aa  51.6  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08396  OmpA/MotB  30.97 
 
 		 424 aa  51.6  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2092  OmpA/MotB  23.85 
 
 		 289 aa  51.2  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000014464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3649  OmpA/MotB domain-containing protein  29.2 
 
 		 218 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  33.96 
 
 		 205 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  36.27 
 
 		 216 aa  51.6  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0175  OmpA/MotB family outer membrane protein  30.34 
 
 		 584 aa  51.6  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2677  outer membrane protein  32.99 
 
 		 380 aa  51.6  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  34.29 
 
 		 670 aa  51.2  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1601  OmpA/MotB domain-containing protein  24.03 
 
 		 289 aa  51.6  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000019607  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  36.27 
 
 		 216 aa  51.6  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3761  OmpA/MotB domain protein  28.28 
 
 		 584 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  33.02 
 
 		 220 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3499  OmpA/MotB  36.47 
 
 		 194 aa  50.4  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0685  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.26 
 
 		 173 aa  50.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163413  normal  0.289483 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1811  OmpA/MotB domain-containing protein  30.17 
 
 		 322 aa  50.8  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000728339  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  33.02 
 
 		 220 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  33.02 
 
 		 220 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  33.02 
 
 		 220 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0853  OmpA/MotB domain-containing protein  36.45 
 
 		 373 aa  50.8  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.452526 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  33.02 
 
 		 220 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  24.03 
 
 		 290 aa  50.8  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000819929  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1406  OmpA/MotB domain protein  33.65 
 
 		 194 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.975063 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2085  OmpA/MotB domain protein  35.48 
 
 		 204 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.370022 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1736  OmpA/MotB domain-containing protein  24.38 
 
 		 289 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000267219  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1521  OmpA/MotB domain-containing protein  22.91 
 
 		 286 aa  50.4  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.227378  normal  0.710419 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2278  OmpA/MotB domain-containing protein  33.64 
 
 		 373 aa  50.4  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  31.53 
 
 		 727 aa  50.4  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1848  NAD-dependent DNA ligase  34.65 
 
 		 195 aa  50.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.449373  normal  0.815473 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5155  OmpA/MotB domain protein  42.17 
 
 		 187 aa  50.4  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1779  OmpA/MotB domain-containing protein  24.38 
 
 		 289 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000149804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2544  OmpA/MotB domain protein  24.38 
 
 		 289 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000320218  hitchhiker  0.000000131905 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0062  putative outer membrane lipoprotein  32.69 
 
 		 220 aa  50.4  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1740  OmpA/MotB domain-containing protein  24.38 
 
 		 289 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000240538  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1005  OmpA/MotB  30.09 
 
 		 229 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.558785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1908  OmpA/MotB domain protein  33 
 
 		 519 aa  50.1  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.533887  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0391  OmpA/MotB domain-containing protein  31.11 
 
 		 316 aa  50.1  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908149  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  32.71 
 
 		 219 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  33.02 
 
 		 219 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  35 
 
 		 333 aa  49.7  0.00006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  32.71 
 
 		 219 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  33.02 
 
 		 219 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  33.02 
 
 		 219 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  34.31 
 
 		 334 aa  49.7  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  33.02 
 
 		 219 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  33.02 
 
 		 219 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  33.02 
 
 		 219 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  33.08 
 
 		 310 aa  49.7  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  32.84 
 
 		 310 aa  49.7  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  33.02 
 
 		 219 aa  49.7  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  36.89 
 
 		 270 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.578444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5762  OmpA/MotB domain-containing protein  34.29 
 
 		 420 aa  49.7  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4198  OmpA/MotB domain protein  36.89 
 
 		 270 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0736  peptidoglycan-associated lipoprotein precursor  35.19 
 
 		 172 aa  49.3  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.947366 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3984  ompA family protein  37.14 
 
 		 278 aa  49.3  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.25861  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1655  OmpA/MotB domain-containing protein  36.89 
 
 		 270 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  33.04 
 
 		 320 aa  49.3  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0418  OmpA/MotB domain-containing protein  31.3 
 
 		 316 aa  49.3  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1537  OmpA/MotB domain protein  35.42 
 
 		 229 aa  49.3  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3990  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 585 aa  49.3  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0052  ompA family protein  32.84 
 
 		 310 aa  49.3  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757478  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2828  OmpA domain-containing protein  32.84 
 
 		 310 aa  49.3  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1715  ompA family protein  32.84 
 
 		 310 aa  49.3  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.706939  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  33.08 
 
 		 310 aa  49.3  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  32.84 
 
 		 310 aa  49.3  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  36.63 
 
 		 266 aa  48.9  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>