211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3990 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3990  OmpA/MotB  100 
 
 		 585 aa  1197    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03624  OmpA/MotB  38.14 
 
 		 587 aa  372  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0880  OmpA/MotB  29.21 
 
 		 597 aa  223  7e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270978  hitchhiker  0.000179778 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2205  hypothetical protein  28.19 
 
 		 438 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.346566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3601  hypothetical protein  25.18 
 
 		 447 aa  109  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.413111  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02290  hypothetical protein  23.62 
 
 		 268 aa  76.3  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  40.91 
 
 		 218 aa  56.2  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2163  outer membrane protein A  34.69 
 
 		 358 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  29.94 
 
 		 244 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1411  OmpA/MotB domain-containing protein  33.7 
 
 		 326 aa  55.1  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.271833  normal  0.902662 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  32.73 
 
 		 367 aa  55.1  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2639  outer membrane protein A  34.69 
 
 		 365 aa  54.7  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000698773  unclonable  0.0000000277772 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2560  OmpA/MotB domain protein  38.78 
 
 		 355 aa  54.3  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.293745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1145  outer membrane protein A  36.73 
 
 		 369 aa  54.3  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00470585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1121  outer membrane protein A  34.69 
 
 		 354 aa  54.3  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116879  normal  0.89417 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00961  outer membrane protein A (3a;II*;G;d)  34.69 
 
 		 346 aa  53.9  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000050212  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2686  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  34.69 
 
 		 346 aa  53.9  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000993272  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2359  outer membrane protein A  34.69 
 
 		 346 aa  53.9  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000044176  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00968  hypothetical protein  34.69 
 
 		 346 aa  53.9  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000788885  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1028  outer membrane protein A  36.73 
 
 		 371 aa  54.3  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000286695  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1111  outer membrane protein A  35.92 
 
 		 358 aa  53.9  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000109909  hitchhiker  0.00334653 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1179  outer membrane protein A  35.92 
 
 		 358 aa  53.9  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000188951  normal  0.637141 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1071  outer membrane protein A  34.69 
 
 		 350 aa  53.9  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1066  outer membrane protein A  34.69 
 
 		 346 aa  53.9  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.14063e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2246  OmpA/MotB domain-containing protein  31.52 
 
 		 407 aa  53.9  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.14079  decreased coverage  0.00792288 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1133  outer membrane protein A  35.71 
 
 		 369 aa  53.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000533703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0736  OmpA/MotB domain-containing protein  36.84 
 
 		 497 aa  52.8  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02232  hypothetical protein  27.14 
 
 		 284 aa  52.8  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1209  outer membrane protein A  32.99 
 
 		 355 aa  53.1  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000342607  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3033  OmpA/MotB domain-containing protein  30.43 
 
 		 269 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0106321 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2698  outer membrane protein A  31.96 
 
 		 354 aa  52  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000118487  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5762  OmpA/MotB domain-containing protein  34.75 
 
 		 420 aa  52.4  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4347  OmpA/MotB domain protein  40.21 
 
 		 206 aa  52  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4325  OmpA/MotB domain protein  40.21 
 
 		 206 aa  51.6  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0632  OmpA/MotB domain-containing protein  31.07 
 
 		 481 aa  51.6  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1754  outer membrane protein A  34.44 
 
 		 358 aa  51.2  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000540093  decreased coverage  0.000000507763 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003529  outer membrane protein  27.14 
 
 		 272 aa  50.8  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1334  OmpA/MotB domain protein  35.63 
 
 		 178 aa  51.2  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.471341  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1848  NAD-dependent DNA ligase  34.34 
 
 		 195 aa  50.4  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.449373  normal  0.815473 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0909  OmpA/MotB domain-containing protein  29.01 
 
 		 227 aa  50.4  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  35.96 
 
 		 215 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  35.96 
 
 		 215 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  35.96 
 
 		 215 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  35.96 
 
 		 215 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  35.96 
 
 		 215 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  35.96 
 
 		 215 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1469  outer membrane protein A  32.58 
 
 		 351 aa  50.1  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000845833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0239  OmpA/MotB domain-containing protein  37.8 
 
 		 317 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  37.78 
 
 		 321 aa  49.7  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2862  OmpA/MotB domain-containing protein  36.89 
 
 		 203 aa  50.1  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2858  outer membrane protein A  47.06 
 
 		 361 aa  49.7  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000165079  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1314  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.44 
 
 		 165 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1212  ompA family protein  35.96 
 
 		 316 aa  49.7  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0354  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 315 aa  49.3  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.322397 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  35.35 
 
 		 227 aa  49.3  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5618  OmpA/MotB  36.84 
 
 		 220 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.271834  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5982  OmpA/MotB domain-containing protein  36.84 
 
 		 220 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.078439  hitchhiker  0.000830094 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2459  OmpA/MotB domain-containing protein  33.71 
 
 		 197 aa  49.3  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.467218 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02741  sodium-type flagellar protein MotY  23.56 
 
 		 290 aa  49.3  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6475  OmpA/MotB domain-containing protein  36.84 
 
 		 220 aa  48.5  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.133518 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2714  OmpA/MotB  32.22 
 
 		 167 aa  48.5  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.358472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5389  peptidoglycan-associated lipoprotein  32.22 
 
 		 170 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  32.22 
 
 		 352 aa  48.5  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0857  ompA family protein  35.96 
 
 		 261 aa  48.5  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4193  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.73 
 
 		 248 aa  48.9  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3509  OmpA/MotB  27.52 
 
 		 164 aa  48.9  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.140214  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2549  outer membrane protein A  47.06 
 
 		 366 aa  48.5  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000121755  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0951  OmpA/MotB domain-containing protein  32.05 
 
 		 485 aa  48.5  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.212652 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0594  OmpA/MotB domain-containing protein  37.21 
 
 		 479 aa  48.9  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.867579  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0835  OmpA/MotB domain-containing protein  36.26 
 
 		 213 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  31.76 
 
 		 345 aa  48.9  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  32.17 
 
 		 296 aa  48.9  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  35.35 
 
 		 216 aa  48.5  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1323  OmpA/SmpA/OmlA family outer membrane lipoprotein  36.23 
 
 		 271 aa  48.1  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.393015  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2507  OmpA family protein  36.23 
 
 		 252 aa  48.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.135453  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  34.48 
 
 		 228 aa  48.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  35.79 
 
 		 261 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2483  OmpA/MotB domain-containing protein  37.08 
 
 		 232 aa  48.1  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421874  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0305  OmpA/SmpA/OmlA family outer membrane lipoprotein  31.91 
 
 		 276 aa  48.1  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519947  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0581  OmpA/SmpA/OmlA family outer membrane lipoprotein  31.91 
 
 		 276 aa  48.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  34.48 
 
 		 228 aa  48.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1321  ompA family protein  31.91 
 
 		 276 aa  48.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0590791  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0621  putative outer membrane protein, OmpA family  31.62 
 
 		 185 aa  48.1  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1248  ompA family protein  31.91 
 
 		 276 aa  48.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0986  OmpA/SmpA/OmlA family outer membrane lipoprotein  31.91 
 
 		 276 aa  48.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6878  Outer membrane lipoprotein omp16 precursor (peptidoglycan-associated lipoprotein)  34.44 
 
 		 149 aa  48.5  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.401181  normal  0.0290754 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  44.83 
 
 		 364 aa  48.1  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  36.47 
 
 		 318 aa  47.8  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2349  OmpA/MotB domain-containing protein  37.08 
 
 		 215 aa  48.1  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0905515  normal  0.139964 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  30.68 
 
 		 333 aa  48.1  0.0005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  35.79 
 
 		 261 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0698  Outer membrane protein-related peptidoglycan-associated (lipo)protein  31.33 
 
 		 481 aa  48.1  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5311  peptidoglycan-associated lipoprotein  32.22 
 
 		 170 aa  47.8  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0858  OmpA/MotB domain-containing protein  37.08 
 
 		 214 aa  48.1  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4843  peptidoglycan-associated lipoprotein  32.22 
 
 		 170 aa  47.8  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.678153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2186  OmpA/MotB  32 
 
 		 261 aa  47.8  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.813055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0763  OmpA/MotB domain-containing protein  37 
 
 		 189 aa  47.8  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000067511  unclonable  1.30394e-19 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2314  OmpA/MotB domain protein  32.95 
 
 		 278 aa  47.8  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.104336  normal  0.160283 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0992  OmpA/MotB domain-containing protein  30.93 
 
 		 190 aa  47.4  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  34.38 
 
 		 228 aa  47.4  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>