63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03624 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03624  OmpA/MotB  100 
 
 		 587 aa  1185    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3990  OmpA/MotB  38.14 
 
 		 585 aa  372  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0880  OmpA/MotB  27.98 
 
 		 597 aa  212  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270978  hitchhiker  0.000179778 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3601  hypothetical protein  28.82 
 
 		 447 aa  110  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.413111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2205  hypothetical protein  29.07 
 
 		 438 aa  100  7e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.346566  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02290  hypothetical protein  26.84 
 
 		 268 aa  67  0.0000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1128  OmpA/MotB domain protein  37.7 
 
 		 212 aa  53.1  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  35.42 
 
 		 374 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2163  outer membrane protein A  38.64 
 
 		 358 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1469  outer membrane protein A  37.5 
 
 		 351 aa  49.3  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000845833  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2686  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  38.64 
 
 		 346 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000993272  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1066  outer membrane protein A  38.64 
 
 		 346 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.14063e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1071  outer membrane protein A  38.64 
 
 		 350 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2639  outer membrane protein A  38.64 
 
 		 365 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000698773  unclonable  0.0000000277772 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2359  outer membrane protein A  38.64 
 
 		 346 aa  49.3  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000044176  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1111  outer membrane protein A  39.77 
 
 		 358 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000109909  hitchhiker  0.00334653 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1179  outer membrane protein A  39.77 
 
 		 358 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000188951  normal  0.637141 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1133  outer membrane protein A  39.77 
 
 		 369 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000533703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1028  outer membrane protein A  39.77 
 
 		 371 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000286695  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1145  outer membrane protein A  39.77 
 
 		 369 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00470585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1121  outer membrane protein A  38.64 
 
 		 354 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116879  normal  0.89417 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00968  hypothetical protein  38.64 
 
 		 346 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000788885  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00961  outer membrane protein A (3a;II*;G;d)  38.64 
 
 		 346 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000050212  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1212  ompA family protein  34.09 
 
 		 316 aa  49.3  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1035  hemagglutinin antigen  33.06 
 
 		 355 aa  48.9  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000658717  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0858  OmpA/MotB domain-containing protein  35.23 
 
 		 214 aa  48.5  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  34.09 
 
 		 215 aa  48.5  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  34.09 
 
 		 215 aa  48.5  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  34.09 
 
 		 215 aa  48.5  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  34.09 
 
 		 215 aa  48.5  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  34.09 
 
 		 215 aa  48.5  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  34.09 
 
 		 215 aa  48.5  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 466 aa  47.8  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  35 
 
 		 468 aa  47.8  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0857  ompA family protein  34.09 
 
 		 261 aa  47.4  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1825  OmpA/MotB  34.09 
 
 		 215 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000764276  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2436  OmpA/MotB domain-containing protein  34.09 
 
 		 215 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140056  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  30.48 
 
 		 525 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  31.4 
 
 		 227 aa  47  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2923  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 590 aa  47  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2441  OmpA/MotB domain-containing protein  34.09 
 
 		 215 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000422184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  37.08 
 
 		 544 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  35.96 
 
 		 542 aa  45.4  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  40.62 
 
 		 364 aa  45.1  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  28.47 
 
 		 631 aa  45.4  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5767  OmpA/MotB family protein  34.09 
 
 		 214 aa  45.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00312455  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  51.06 
 
 		 277 aa  44.7  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  28.77 
 
 		 381 aa  45.1  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  35.96 
 
 		 543 aa  44.7  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4052  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 180 aa  44.7  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  37.36 
 
 		 228 aa  44.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3164  OmpA/MotB domain protein  32.56 
 
 		 486 aa  44.7  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2349  OmpA/MotB domain-containing protein  34.09 
 
 		 215 aa  44.3  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0905515  normal  0.139964 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  32.05 
 
 		 330 aa  44.3  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0114  outer membrane protein A  35.56 
 
 		 342 aa  44.3  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.394411  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1164  ompA family protein  34.57 
 
 		 229 aa  44.3  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  33.7 
 
 		 318 aa  44.3  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2483  OmpA/MotB domain-containing protein  34.09 
 
 		 232 aa  44.3  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421874  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3025  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 208 aa  43.9  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.970815  normal  0.30495 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1452  cysteine-rich repeat protein  28.87 
 
 		 1793 aa  44.3  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  34.09 
 
 		 229 aa  43.9  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1276  outer membrane protein  34.18 
 
 		 205 aa  43.9  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  30.39 
 
 		 239 aa  43.9  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>