31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3601 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3601  hypothetical protein  100 
 
 		 447 aa  893    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.413111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2205  hypothetical protein  60.63 
 
 		 438 aa  457  1e-127  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.346566  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02290  hypothetical protein  31.1 
 
 		 268 aa  119  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03624  OmpA/MotB  25.86 
 
 		 587 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3990  OmpA/MotB  25.18 
 
 		 585 aa  107  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0880  OmpA/MotB  25.52 
 
 		 597 aa  86.7  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270978  hitchhiker  0.000179778 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 356 aa  61.2  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  60.66 
 
 		 1394 aa  60.5  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  60.94 
 
 		 914 aa  58.9  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  30.39 
 
 		 433 aa  55.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4228  hypothetical protein  38.57 
 
 		 653 aa  51.2  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1632  chitin-binding domain-containing protein  67.57 
 
 		 338 aa  50.4  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0331  hypothetical protein  52.73 
 
 		 476 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.638038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  56.14 
 
 		 846 aa  47.4  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1612  Pectate lyase/Amb allergen  38.33 
 
 		 1409 aa  47.4  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0830  redoxin domain-containing protein  41.25 
 
 		 329 aa  47.4  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  51.79 
 
 		 1281 aa  47  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  47.06 
 
 		 916 aa  47  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2289  peptidase M23B  27.5 
 
 		 457 aa  46.6  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000911471  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  44.62 
 
 		 671 aa  46.6  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  46.32 
 
 		 830 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4504  PT repeat-containing protein  58.33 
 
 		 456 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1281  hypothetical protein  65 
 
 		 430 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.197658 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0140  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  45.28 
 
 		 451 aa  44.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  57.14 
 
 		 453 aa  44.3  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1812  protein-export membrane protein SecD  40.74 
 
 		 666 aa  44.7  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.279659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2810  serine/threonine kinase protein  64.1 
 
 		 1034 aa  44.3  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.855533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0098  hypothetical protein  61.82 
 
 		 605 aa  43.9  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0997115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  42.86 
 
 		 455 aa  43.9  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.07 
 
 		 257 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0451  hypothetical protein  50 
 
 		 682 aa  43.5  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.935118  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>