More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0880 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_0880  OmpA/MotB  100 
 
 		 597 aa  1212    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270978  hitchhiker  0.000179778 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3990  OmpA/MotB  29.21 
 
 		 585 aa  223  8e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03624  OmpA/MotB  27.98 
 
 		 587 aa  212  2e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2205  hypothetical protein  28.91 
 
 		 438 aa  95.5  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.346566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3601  hypothetical protein  25 
 
 		 447 aa  87.4  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.413111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3825  OmpA/MotB domain-containing protein  33.62 
 
 		 729 aa  77.4  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263673  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  30.47 
 
 		 277 aa  73.9  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  44 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  32.26 
 
 		 316 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  33.33 
 
 		 694 aa  71.6  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2738  OmpA/MotB domain protein  35.96 
 
 		 241 aa  70.9  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00260572  hitchhiker  0.0000108242 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  29.84 
 
 		 310 aa  70.5  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  29.84 
 
 		 310 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0626  OmpA/MotB domain-containing protein  40.74 
 
 		 768 aa  70.1  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2828  OmpA domain-containing protein  29.84 
 
 		 310 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  29.84 
 
 		 310 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  29.84 
 
 		 310 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02290  hypothetical protein  23.44 
 
 		 268 aa  69.3  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1715  ompA family protein  29.84 
 
 		 310 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.706939  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0052  ompA family protein  29.84 
 
 		 310 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757478  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  43.06 
 
 		 620 aa  69.3  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  37.38 
 
 		 222 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  30.36 
 
 		 658 aa  68.2  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0418  OmpA/MotB domain-containing protein  31.45 
 
 		 316 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4416  OmpA/MotB domain-containing protein  35.51 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.632487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4333  porin  30.63 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  35.51 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  35.51 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  35.51 
 
 		 236 aa  67  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1164  ompA family protein  37.38 
 
 		 229 aa  67  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  34.58 
 
 		 237 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  33.64 
 
 		 321 aa  66.2  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0391  OmpA/MotB domain-containing protein  30.65 
 
 		 316 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908149  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  34.58 
 
 		 237 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  28.95 
 
 		 222 aa  65.9  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  27.35 
 
 		 241 aa  65.9  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  35.35 
 
 		 221 aa  65.9  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  35.19 
 
 		 229 aa  66.2  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  38.64 
 
 		 236 aa  65.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  29.03 
 
 		 311 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  32.43 
 
 		 217 aa  65.1  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1005  OmpA/MotB  35.51 
 
 		 229 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.558785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  43.66 
 
 		 463 aa  64.7  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0457  OmpA/MotB domain-containing protein  31.53 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  29.84 
 
 		 320 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  43.66 
 
 		 459 aa  64.3  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1489  OmpA/MotB domain protein  40.48 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00664745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0502  OmpA/MotB  42.25 
 
 		 463 aa  63.9  0.000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  33.64 
 
 		 223 aa  63.5  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3573  OmpA/MotB family outer membrane protein  32.11 
 
 		 320 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  34.69 
 
 		 243 aa  62.4  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  39.74 
 
 		 228 aa  62.4  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  41.1 
 
 		 240 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  40.28 
 
 		 263 aa  62.4  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1151  OmpA/MotB domain-containing protein  29.73 
 
 		 182 aa  62.4  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0745121  normal  0.85361 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  37.33 
 
 		 445 aa  62.4  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1877  OmpA/MotB  33.03 
 
 		 434 aa  62.4  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0777893 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0307  OmpA/MotB  38.46 
 
 		 533 aa  62.4  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  36.49 
 
 		 440 aa  62.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2622  OmpA/MotB  30.63 
 
 		 247 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  34.23 
 
 		 544 aa  62.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  32.52 
 
 		 210 aa  62  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  34.69 
 
 		 220 aa  62  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3649  OmpA/MotB domain-containing protein  34.58 
 
 		 218 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41140  OmpA family protein  32.43 
 
 		 222 aa  62.4  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  31.4 
 
 		 242 aa  62  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  37.5 
 
 		 230 aa  62  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  43.28 
 
 		 228 aa  62  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  28.15 
 
 		 525 aa  62.4  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2677  outer membrane protein  34.04 
 
 		 380 aa  62  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  29.17 
 
 		 707 aa  62  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  29.46 
 
 		 231 aa  62  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  36.49 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_008542  Bcen2424_0483  OmpA/MotB domain-containing protein  30.63 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2448  OmpA/MotB  38.89 
 
 		 221 aa  61.6  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0958  OmpA/MotB domain-containing protein  31.4 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  28.95 
 
 		 424 aa  61.6  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  36 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0218  OmpA/MotB domain-containing protein  30.09 
 
 		 642 aa  61.2  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  30.99 
 
 		 543 aa  61.2  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  36 
 
 		 440 aa  61.2  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  32.63 
 
 		 594 aa  61.2  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  30.41 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  33.64 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  30.63 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  31.71 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3536  outer membrane protein  28.95 
 
 		 505 aa  61.2  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0480  OmpA/MotB domain-containing protein  38.03 
 
 		 85 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0280  OmpA family outer membrane protein  38.46 
 
 		 533 aa  60.8  0.00000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2625  OmpA/MotB  38.03 
 
 		 85 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0109617  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  32.2 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  31.25 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  34.51 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  37.84 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  31.25 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  32.05 
 
 		 656 aa  60.5  0.00000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4178  OmpA/MotB domain-containing protein  36.36 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  30.83 
 
 		 219 aa  60.1  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  37.35 
 
 		 607 aa  59.7  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  31.06 
 
 		 244 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>