More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11711 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3507  DNA repair protein RecN  70.69 
 
 		 598 aa  746    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0691312 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2949  DNA repair protein RecN  70.41 
 
 		 590 aa  709    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2964  DNA repair protein RecN  70.77 
 
 		 587 aa  710    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11711  DNA repair protein recN  100 
 
 		 587 aa  1129    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.31285  normal  0.395213 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2993  DNA repair protein RecN  70.41 
 
 		 590 aa  709    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311205  normal  0.473383 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3288  DNA repair protein RecN  72.06 
 
 		 591 aa  754    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2381  DNA repair protein RecN  57.6 
 
 		 590 aa  563  1.0000000000000001e-159  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25450  DNA replication and repair protein RecN  55.67 
 
 		 593 aa  559  1e-158  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2826  DNA repair protein RecN  52.52 
 
 		 590 aa  537  1e-151  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.327916  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5439  DNA repair protein RecN  53.54 
 
 		 592 aa  505  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1913  DNA repair protein RecN  50 
 
 		 585 aa  433  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0988612  normal  0.166083 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1904  DNA repair protein RecN  49.25 
 
 		 585 aa  432  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641483  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4072  DNA repair protein RecN  49.23 
 
 		 588 aa  423  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0367674  normal  0.136098 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6056  DNA repair and genetic recombination  46.21 
 
 		 570 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2171  DNA repair protein RecN  48.32 
 
 		 575 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00879264  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4437  DNA repair protein RecN  47.79 
 
 		 583 aa  392  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297367  normal  0.304528 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2032  DNA repair protein RecN  45.55 
 
 		 567 aa  388  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1126  DNA repair protein RecN  44.63 
 
 		 577 aa  383  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3025  DNA repair protein RecN  45.88 
 
 		 569 aa  380  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.185029 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1342  DNA repair protein RecN  44.97 
 
 		 574 aa  380  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2482  DNA repair protein RecN  45.95 
 
 		 584 aa  373  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.315988  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2011  DNA repair protein RecN  48.11 
 
 		 580 aa  370  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  0.0516704 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3158  DNA repair protein RecN  44.25 
 
 		 584 aa  369  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0998846  normal  0.788962 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3010  DNA repair protein RecN  46.73 
 
 		 610 aa  362  9e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1518  DNA repair protein RecN  44.07 
 
 		 579 aa  360  3e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.301856  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5429  DNA repair protein RecN  43.73 
 
 		 580 aa  358  9.999999999999999e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.477052 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1517  DNA repair protein RecN  43.22 
 
 		 579 aa  355  1e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000776355 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1753  DNA repair protein RecN  44.48 
 
 		 583 aa  353  4e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.391848  hitchhiker  0.000930146 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22130  DNA replication and repair protein RecN  44.13 
 
 		 583 aa  352  1e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120117  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1659  DNA repair protein RecN  46.39 
 
 		 578 aa  347  3e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0674828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3147  DNA repair protein RecN  45.26 
 
 		 611 aa  342  1e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0041532  normal  0.691504 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14210  DNA repair protein RecN  44.5 
 
 		 580 aa  329  1.0000000000000001e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0453265  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1245  DNA repair protein RecN  44.56 
 
 		 592 aa  320  6e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.790366 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2355  DNA repair protein RecN  43.08 
 
 		 612 aa  303  6.000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.887863  hitchhiker  0.00822868 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13670  DNA repair protein RecN  41.2 
 
 		 590 aa  296  8e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.325794  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  31.07 
 
 		 573 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0681  DNA repair protein RecN  33.78 
 
 		 594 aa  275  1.0000000000000001e-72  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  33.67 
 
 		 577 aa  272  1e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  32.32 
 
 		 573 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  31.52 
 
 		 552 aa  266  1e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  31.76 
 
 		 559 aa  259  1e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0793  DNA repair ATPase  36.32 
 
 		 608 aa  258  2e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2627  DNA repair protein RecN  28.86 
 
 		 574 aa  258  2e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.434189  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  31.03 
 
 		 561 aa  254  3e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2472  DNA repair protein RecN  34.19 
 
 		 605 aa  254  4.0000000000000004e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.400775 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0832  DNA repair protein RecN  36.16 
 
 		 554 aa  252  1e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.013795  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0903  DNA repair protein RecN  36.33 
 
 		 554 aa  252  1e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  31.67 
 
 		 555 aa  251  3e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  33.9 
 
 		 558 aa  249  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  34.01 
 
 		 578 aa  248  2e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  29.92 
 
 		 565 aa  245  1.9999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0594  DNA repair protein RecN  31.1 
 
 		 569 aa  244  3.9999999999999997e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  34.8 
 
 		 554 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  29.58 
 
 		 580 aa  244  3.9999999999999997e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  30.9 
 
 		 556 aa  243  5e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  29.34 
 
 		 559 aa  243  6e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  29.34 
 
 		 559 aa  243  6e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  28.21 
 
 		 579 aa  243  6e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  28.31 
 
 		 579 aa  243  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  28.14 
 
 		 583 aa  242  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  28.31 
 
 		 579 aa  242  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  28.14 
 
 		 579 aa  242  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  28.14 
 
 		 579 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  31.88 
 
 		 555 aa  242  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  28.14 
 
 		 579 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  30.64 
 
 		 608 aa  241  2e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  28.55 
 
 		 579 aa  241  2e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  28.19 
 
 		 583 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0623  DNA repair protein RecN  32.94 
 
 		 568 aa  241  2.9999999999999997e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.72171  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  30.34 
 
 		 556 aa  241  2.9999999999999997e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  27.97 
 
 		 579 aa  241  4e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1325  DNA repair protein RecN  36.68 
 
 		 529 aa  240  4e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.11608  normal  0.581272 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  27.97 
 
 		 579 aa  240  5e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0934  DNA repair protein RecN  30.83 
 
 		 588 aa  240  5.999999999999999e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.590863  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1301  DNA repair protein RecN  34.4 
 
 		 547 aa  240  5.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0361  DNA repair protein RecN  35.76 
 
 		 601 aa  239  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00213355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  34.06 
 
 		 572 aa  239  1e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  32.46 
 
 		 556 aa  238  2e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  33.16 
 
 		 560 aa  238  3e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2096  DNA repair protein RecN  34.77 
 
 		 523 aa  238  3e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3397  DNA repair protein RecN  32.28 
 
 		 586 aa  238  3e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00306133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_923  DNA repair protein  31.74 
 
 		 588 aa  237  4e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0553147  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  33.56 
 
 		 554 aa  237  4e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1652  DNA repair protein RecN  34.8 
 
 		 558 aa  237  4e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  29.27 
 
 		 555 aa  237  4e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0474  DNA repair protein RecN  34 
 
 		 543 aa  237  6e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.51796 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  30.12 
 
 		 567 aa  236  9e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3856  recombination and repair protein  31.86 
 
 		 553 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00344363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  27.38 
 
 		 566 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1059  DNA repair protein RecN  31.69 
 
 		 553 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0987529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2774  recombination and repair protein  31.69 
 
 		 553 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103072  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0119  DNA repair protein RecN  35.51 
 
 		 599 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1068  recombination and repair protein  31.69 
 
 		 553 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0569436  normal  0.137036 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02504  recombination and repair protein  31.69 
 
 		 553 aa  234  3e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0788874  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  31.74 
 
 		 559 aa  234  3e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  32.38 
 
 		 574 aa  234  3e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02468  hypothetical protein  31.69 
 
 		 553 aa  234  3e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116899  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1453  DNA repair protein RecN  36.84 
 
 		 557 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0975706  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2900  recombination and repair protein  31.52 
 
 		 553 aa  233  6e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004413  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1055  DNA repair protein RecN  32.26 
 
 		 588 aa  233  9e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>