More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0694 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0694  secretion protein HlyD  100 
 
 		 417 aa  839    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.459164  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1965  secretion protein HlyD  71.6 
 
 		 388 aa  450  1e-125  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.455875 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08701  membrane fusion protein  61.41 
 
 		 392 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0747  secretion protein HlyD  52.54 
 
 		 357 aa  362  5.0000000000000005e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.554021  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15871  membrane fusion protein  50.82 
 
 		 357 aa  362  8e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12131  membrane fusion protein  49.29 
 
 		 356 aa  344  2e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.502636 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13141  membrane fusion protein  39.15 
 
 		 353 aa  278  1e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13031  membrane fusion protein  40 
 
 		 353 aa  277  3e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1235  secretion protein HlyD  38.87 
 
 		 353 aa  275  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.681968  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13281  membrane fusion protein  38.76 
 
 		 353 aa  273  4.0000000000000004e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.403546  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0926  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.97 
 
 		 490 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.64 
 
 		 432 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0659148 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0553  secretion protein HlyD  44.33 
 
 		 450 aa  183  5.0000000000000004e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2825  RND family efflux transporter subunit MFP  30.26 
 
 		 500 aa  175  9.999999999999999e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.708608  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2861  secretion protein HlyD  52.97 
 
 		 489 aa  171  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1966  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.53 
 
 		 487 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1993  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.53 
 
 		 487 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.702751  normal  0.0246521 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.15 
 
 		 504 aa  152  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  38.57 
 
 		 517 aa  138  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.41 
 
 		 409 aa  119  9e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  28.08 
 
 		 400 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3643  RND family efflux transporter MFP subunit  28.48 
 
 		 455 aa  114  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.384349  normal  0.340778 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2920  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.29 
 
 		 505 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.214189 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2777  RND family efflux transporter MFP subunit  29.87 
 
 		 489 aa  107  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000975793  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0782  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.9 
 
 		 428 aa  107  4e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00204407  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0495  secretion protein HlyD  27.79 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0322  RND family efflux transporter MFP subunit  29.5 
 
 		 353 aa  104  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0619651 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0496  RND family efflux transporter MFP subunit  28.73 
 
 		 402 aa  103  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0505  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.55 
 
 		 349 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1515  RND family efflux transporter MFP subunit  26.2 
 
 		 405 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1814  RND family efflux transporter MFP subunit  31.12 
 
 		 432 aa  102  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0365  membrane-fusion protein  28.43 
 
 		 394 aa  101  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3883  secretion protein HlyD  28.47 
 
 		 424 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1059  macrolide transporter subunit MacA  26.46 
 
 		 372 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.75011  normal  0.992508 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.59 
 
 		 453 aa  101  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0976  macrolide transporter subunit MacA  26.46 
 
 		 372 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3127  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.74 
 
 		 416 aa  100  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1863  RND family efflux transporter MFP subunit  27.56 
 
 		 393 aa  100  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1039  macrolide transporter subunit MacA  26.46 
 
 		 372 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  28.61 
 
 		 429 aa  100  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1008  macrolide transporter subunit MacA  26.46 
 
 		 372 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.622007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0942  macrolide transporter subunit MacA  26.46 
 
 		 372 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0382  RND family efflux transporter MFP subunit  28.84 
 
 		 396 aa  100  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.410142  normal  0.745706 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2282  macrolide transporter subunit MacA  27.37 
 
 		 371 aa  99.8  9e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000339116  normal  0.0134871 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2764  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.37 
 
 		 371 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.161658  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2582  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.62 
 
 		 379 aa  99.4  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000306136  normal  0.19553 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1084  MacA  26.51 
 
 		 402 aa  99  1e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00883  macrolide transporter subunit, membrane fusion protein (MFP) component  27.37 
 
 		 371 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1161  RND family efflux transporter MFP subunit  29.11 
 
 		 404 aa  98.2  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0203325  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00889  hypothetical protein  27.37 
 
 		 371 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1161  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.67 
 
 		 376 aa  98.6  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.444348  normal  0.334679 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2451  macrolide transporter subunit MacA  27.37 
 
 		 371 aa  98.2  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00913289  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2718  macrolide transporter subunit MacA  27.37 
 
 		 371 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0982  macrolide transporter subunit MacA  27.37 
 
 		 371 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.44834  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1039  macrolide transporter subunit MacA  27.37 
 
 		 371 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.184306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0257  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.5 
 
 		 376 aa  98.2  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0635655  hitchhiker  0.00588714 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0951  macrolide transporter subunit MacA  27.37 
 
 		 371 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557503  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4363  RND efflux system membrane fusion protein  26.87 
 
 		 467 aa  98.6  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3351  RND family efflux transporter MFP subunit  27.57 
 
 		 367 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4941  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.65 
 
 		 419 aa  96.7  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.321445  normal  0.921537 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1666  RND family efflux transporter MFP subunit  29.13 
 
 		 418 aa  95.9  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0907  RND efflux membrane fusion protein-related protein  28.66 
 
 		 406 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3038  secretion protein HlyD  26.18 
 
 		 403 aa  95.1  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167095  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1892  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.58 
 
 		 430 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1621  secretion protein HlyD  24.42 
 
 		 407 aa  95.1  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03344  acriflavin resistance protein  26.39 
 
 		 417 aa  95.1  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3548  RND family efflux transporter MFP subunit  27.96 
 
 		 442 aa  94.7  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1791  secretion protein HlyD  27.95 
 
 		 402 aa  94  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2355  secretion protein HlyD  24.01 
 
 		 509 aa  93.6  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0694634 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1673  secretion protein HlyD  28.02 
 
 		 396 aa  93.2  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.801945 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0975  RND family efflux transporter MFP subunit  29.73 
 
 		 382 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0109715 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3265  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.75 
 
 		 404 aa  92.4  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2865  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.36 
 
 		 478 aa  92.8  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0716848 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4943  RND efflux membrane fusion protein precursor  28.45 
 
 		 375 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0946  RND family efflux transporter MFP subunit  28.66 
 
 		 382 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1166  secretion protein HlyD  26.57 
 
 		 412 aa  92  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.912906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1209  RND family efflux transporter MFP subunit  26.63 
 
 		 381 aa  92  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.421019  normal  0.31825 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  27.04 
 
 		 335 aa  91.7  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2615  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.87 
 
 		 380 aa  91.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.909785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3595  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.64 
 
 		 404 aa  91.7  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0852698  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1706  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.95 
 
 		 430 aa  91.3  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.353178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56880  putative membrane fusion protein  27.7 
 
 		 376 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0631  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.73 
 
 		 432 aa  90.5  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.137352 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.27 
 
 		 432 aa  90.5  5e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5559  secretion protein HlyD  28.05 
 
 		 366 aa  90.1  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1469  secretion protein HlyD  27.58 
 
 		 421 aa  90.1  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.910926 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1617  secretion protein HlyD  26.51 
 
 		 408 aa  90.1  6e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0160623  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.94 
 
 		 397 aa  90.1  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1414  secretion protein HlyD  29.79 
 
 		 430 aa  89.7  9e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0986  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.78 
 
 		 405 aa  89.7  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.831389 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1637  RND family efflux transporter MFP subunit  27.97 
 
 		 465 aa  89  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1671  HlyD family secretion protein  26.51 
 
 		 408 aa  89.4  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1178  RND family efflux transporter MFP subunit  25.99 
 
 		 390 aa  89.4  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1122  RND family efflux transporter MFP subunit  28.52 
 
 		 366 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4014  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26 
 
 		 362 aa  89.4  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0181773  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0769  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.86 
 
 		 322 aa  89  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.100875  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2024  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.27 
 
 		 419 aa  89.4  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000305818 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1392  RND efflux system membrane fusion protein  27.36 
 
 		 419 aa  89  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0449025  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1749  secretion protein HlyD  24.76 
 
 		 398 aa  89.4  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.145441 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1101  RND family efflux transporter MFP subunit  25.61 
 
 		 414 aa  88.6  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402678  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>