286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3845 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



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E-value
Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3845  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 197 aa  409  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4127  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 181 aa  154  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1790  transcriptional regulator of TetR family protein  44.05 
 
 		 176 aa  143  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.127999 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4676  transcriptional regulator, TetR family  39.05 
 
 		 190 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3932  TetR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 179 aa  127  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324595  normal  0.0870807 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0061  TetR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 187 aa  126  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7851  transcriptional regulator, TetR family  39.88 
 
 		 165 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3547  regulatory protein, TetR  35.52 
 
 		 187 aa  118  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.473445  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0681  transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 		 167 aa  117  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0989844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1344  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 205 aa  115  5e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592645 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  36.93 
 
 		 193 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6780  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 196 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.188016 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1938  hypothetical protein  37.22 
 
 		 186 aa  111  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0884  transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 		 193 aa  111  9e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0708225  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1949  hypothetical protein  37.13 
 
 		 186 aa  110  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4040  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 191 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4313  TetR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 600 aa  110  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4262  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 196 aa  109  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2372  transcriptional regulator, TetR family  35.54 
 
 		 193 aa  109  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74201  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3482  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 191 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.342598  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1133  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 193 aa  108  3e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0059  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 186 aa  107  9.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1980  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 187 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07011  transcriptional regulator  36.59 
 
 		 189 aa  105  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1777  regulatory protein TetR  33.51 
 
 		 195 aa  102  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.731609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2113  transcriptional regulator, TetR family  33.69 
 
 		 194 aa  102  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.508898 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5603  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 188 aa  101  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1734  transcriptional regulator, TetR family  34.05 
 
 		 191 aa  101  7e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.390922 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 216 aa  100  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6911  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 187 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6861  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 187 aa  98.6  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4293  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 188 aa  98.6  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0268101  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4896  TetR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 187 aa  98.2  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0148  transcriptional regulator  34.48 
 
 		 179 aa  98.2  7e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3267  TetR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 187 aa  98.2  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4433  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 187 aa  97.8  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5390  TetR family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 189 aa  95.9  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4967  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 185 aa  95.5  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110994  normal  0.179343 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0839  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 196 aa  95.1  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2880  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 192 aa  94.7  7e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0587  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 198 aa  94.4  9e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1966  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 188 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.273818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1903  transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 192 aa  93.2  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0461172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2194  TetR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 188 aa  93.2  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.881672  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5956  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 188 aa  92.8  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  normal  0.49488 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4267  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 189 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5714  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 188 aa  91.3  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.297365 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6619  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 188 aa  89  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.634361  normal  0.119433 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5772  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 188 aa  89  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6137  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 188 aa  89  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.8739 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6065  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 188 aa  87  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2297  TetR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 195 aa  87.4  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.299638  hitchhiker  0.00738055 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1689  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 195 aa  86.7  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7671  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.403599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2163  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 201 aa  86.7  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0855716  normal  0.614843 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0424  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.652822  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0527  TetR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 198 aa  84.7  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18684  normal  0.990571 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3456  transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.659534  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4458  transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 		 195 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4291  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 189 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4909  TetR/AcrR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.194586  decreased coverage  0.000378041 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4685  transcriptional regulator, TetR family  24.18 
 
 		 189 aa  82  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.26494  hitchhiker  0.000674431 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3422  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4188  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 211 aa  81.3  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4614  transcriptional regulator, TetR family  26.16 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0834  transcriptional regulator  26.19 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0575081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0300  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000186865  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2506  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.733789  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  28.98 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2959  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177797 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4057  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5102  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  25.97 
 
 		 214 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  25.54 
 
 		 198 aa  53.1  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2242  TetR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 209 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.640782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2176  TetR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 209 aa  52.8  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000096918  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2162  TetR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 207 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2406  TetR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 209 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2423  transcriptional regulator, TetR family  27.2 
 
 		 207 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2219  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 198 aa  52.4  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 196 aa  52.4  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1329  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.851315 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1674  transcriptional regulator, TetR family  23.66 
 
 		 204 aa  52.4  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2441  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.21008  n/a   
 
 
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NC_007406  Nwi_3052  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 183 aa  52  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
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NC_012880  Dd703_1453  transcriptional regulator, TetR family  22.1 
 
 		 183 aa  52  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_2560  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 196 aa  51.6  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199189  normal  0.158626 
 
 
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NC_009457  VC0395_A1341  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 224 aa  51.6  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  23.26 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
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NC_009338  Mflv_1270  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0484434 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A2373  transcriptional regulator, TetR family  25.69 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010505  Mrad2831_0286  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 177 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.945519  normal  1 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_4476  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000182515 
 
 
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