100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3767 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_3767  protease domain-containing protein  100 
 
 
1311 aa  2673    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000363962 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0797  protease domain-containing protein  56.04 
 
 
1393 aa  1364    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3141  protease domain-containing protein  55.25 
 
 
1393 aa  1348    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04140  metalloprotease, putative  36.55 
 
 
887 aa  275  6e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.700995  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2937  protease-associated PA  31.42 
 
 
730 aa  271  4e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3023  protease-associated PA domain protein  35.38 
 
 
730 aa  249  3e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0449431  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3130  peptidase M36 fungalysin  38.19 
 
 
730 aa  247  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146648  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04145  metalloprotease, putative  35.11 
 
 
935 aa  237  1.0000000000000001e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.18498  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02230  metalloprotease, putative  35.24 
 
 
927 aa  223  1.9999999999999999e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.493351  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5348  peptidase M36 fungalysin  34.62 
 
 
950 aa  189  4e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1217  metalloprotease, putative  26.43 
 
 
839 aa  100  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000727805  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3035  protease domain-containing protein  45.9 
 
 
1053 aa  95.1  7e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.559762  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3188  protease-associated PA  44.8 
 
 
567 aa  87  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3304  protease-associated PA domain protein  46.09 
 
 
567 aa  86.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150395  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1721  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.11 
 
 
1323 aa  86.7  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00699469  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01650  Extracellular elastinolytic metalloproteinase precursor, putative  38.17 
 
 
831 aa  85.9  0.000000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.462944  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3050  protease-associated PA  51.85 
 
 
1220 aa  84.7  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000558142  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2538  coagulation factor 5/8 type-like protein  29.72 
 
 
1043 aa  80.1  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0513  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  52.81 
 
 
1212 aa  79.7  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0825  protease domain-containing protein  42.97 
 
 
1258 aa  75.5  0.000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.184637  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0248  PKD domain-containing protein  40.78 
 
 
3278 aa  75.1  0.000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.748556 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0492  peptidase M36 fungalysin  44.04 
 
 
1147 aa  73.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.921805 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3909  serine protease  39.25 
 
 
1042 aa  72.8  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.634  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2222  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.09 
 
 
891 aa  70.5  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3800  serine protease  50.62 
 
 
1215 aa  69.7  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0669  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.05 
 
 
728 aa  68.6  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0832  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.24 
 
 
1292 aa  67.4  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1112  hypothetical protein  46.39 
 
 
901 aa  67  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0403332  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1180  hypothetical protein  46.99 
 
 
902 aa  65.5  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.15 
 
 
911 aa  65.1  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000289605 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1810  peptidase M36, fungalysin  29.41 
 
 
1146 aa  64.3  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0819  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.54 
 
 
1286 aa  63.9  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000454384 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3768  protease domain-containing protein  39.5 
 
 
1265 aa  63.9  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000500867  hitchhiker  0.00925065 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3708  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  49.4 
 
 
1212 aa  63.5  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.342982  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04637  PA and RING finger domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G02470)  32.63 
 
 
812 aa  62.8  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.633588  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3585  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  50.62 
 
 
1212 aa  62.8  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.591718  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2308  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.77 
 
 
1776 aa  62.4  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3517  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  50.62 
 
 
1212 aa  62  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.183545 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3266  peptidase M36 fungalysin  27.13 
 
 
1168 aa  60.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0508645  normal  0.0224871 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6125  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.4 
 
 
1212 aa  59.7  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.000714594  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0084  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  44.12 
 
 
860 aa  60.1  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000306364  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1809  putative protease  38.81 
 
 
656 aa  59.3  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.328878  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0846  subtilisin-like serine protease  35 
 
 
1618 aa  58.5  0.0000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4627  serine protease  40.82 
 
 
702 aa  58.2  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2343  Aminopeptidase Y  31.51 
 
 
512 aa  57.8  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.362822  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0781  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.39 
 
 
1283 aa  57.4  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.223596  hitchhiker  0.00753256 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.09 
 
 
913 aa  57  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_1118  predicted protein  31.58 
 
 
595 aa  56.2  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2139  hypothetical protein  36.45 
 
 
1011 aa  55.5  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000321254  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5001  hypothetical protein  28.57 
 
 
1407 aa  55.8  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5011  minor extracellular protease VPR  28.57 
 
 
1407 aa  55.5  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5031  subtilase domain-containing protein  28.57 
 
 
1407 aa  55.5  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2974  PKD domain-containing protein  40.66 
 
 
833 aa  55.5  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3313  cold-active alkaline serine protease  34.48 
 
 
514 aa  54.3  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4623  subtilisin-like serine protease  29.09 
 
 
1406 aa  54.3  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2313  leucine-rich repeat-containing protein  41.38 
 
 
450 aa  54.7  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  37.21 
 
 
855 aa  53.9  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0783  hypothetical protein  38.46 
 
 
528 aa  53.9  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.07808  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4740  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.11 
 
 
1217 aa  53.5  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.51333  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0555  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.57 
 
 
1399 aa  53.1  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0581373 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  37.37 
 
 
972 aa  53.1  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2849  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.28 
 
 
1160 aa  53.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00446023  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2053  serine protease  41.27 
 
 
1570 aa  53.1  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.322612  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1690  protease domain-containing protein  33.05 
 
 
1300 aa  52.4  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.983324  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01630  aminopeptidase Y  36 
 
 
509 aa  52.4  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.777606  normal  0.140751 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  34.45 
 
 
848 aa  52.4  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1915  serine protease  35.14 
 
 
1300 aa  51.2  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0715  aminopeptidase Y  29.7 
 
 
502 aa  51.2  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0168155 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0468  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  45.1 
 
 
860 aa  50.4  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0044  hypothetical protein  33.33 
 
 
568 aa  50.4  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000379088  hitchhiker  0.00388829 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2224  PKD domain-containing protein  37.89 
 
 
460 aa  50.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2871  cold-active alkaline serine protease  37.66 
 
 
789 aa  50.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1500  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.46 
 
 
1293 aa  50.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0423  hypothetical protein  43.42 
 
 
809 aa  50.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0917  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.84 
 
 
608 aa  50.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0197096  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0728  protease domain-containing protein  30.34 
 
 
1035 aa  49.7  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3147  Aminopeptidase Y  29.51 
 
 
513 aa  49.7  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.248558  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2223  putative aminopeptidase  37.76 
 
 
535 aa  49.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26020  putative aminopeptidase  37.76 
 
 
536 aa  49.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.394851 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2413  cold-active alkaline serine protease  38.67 
 
 
526 aa  49.3  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.733883 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0927  Aminopeptidase Y  36.96 
 
 
548 aa  48.9  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464767  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3882  leucine-rich repeat-containing protein  31.93 
 
 
816 aa  48.5  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1644  PKD domain containing protein  37.04 
 
 
820 aa  48.5  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  35.87 
 
 
868 aa  47.8  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0968  cell wall-associated serine proteinase, lactocepin precursor  32 
 
 
1570 aa  47.8  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1123  cell wall-associated serine proteinase  33 
 
 
1570 aa  48.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.677567  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  36.67 
 
 
848 aa  48.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  31.13 
 
 
869 aa  47.8  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  37.8 
 
 
1107 aa  47.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0141  Aminopeptidase Y  38.83 
 
 
506 aa  47.8  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16187  predicted protein  34.62 
 
 
501 aa  47  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.13333 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1876  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.91 
 
 
607 aa  46.2  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.747842  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0190  aminopeptidase Y  28.08 
 
 
510 aa  46.2  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10423  lipoprotein aminopeptidase lpqL  32.26 
 
 
500 aa  46.2  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0596975  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  34.78 
 
 
868 aa  46.2  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23940  subtilisin-like serine protease  31.58 
 
 
1809 aa  45.8  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  31.48 
 
 
746 aa  46.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2014  peptidase C25 gingipain  37.97 
 
 
994 aa  45.8  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0011841  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3246  aminopeptidase Y  28.65 
 
 
518 aa  45.4  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.765312  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2300  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.81 
 
 
606 aa  45.1  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>