More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0156 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0156  bioH protein  100 
 
 		 256 aa  521  1e-147  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0176  carboxylesterase  74.8 
 
 		 264 aa  409  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3882  bioH protein  71.03 
 
 		 264 aa  373  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4010  bioH protein  71.03 
 
 		 264 aa  374  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3806  bioH protein  70.47 
 
 		 264 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.1902 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4331  bioH protein  69.72 
 
 		 264 aa  364  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4127  bioH protein  69.32 
 
 		 264 aa  362  4e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4199  bioH protein  69.32 
 
 		 264 aa  361  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3630  bioH protein  65.61 
 
 		 259 aa  355  2.9999999999999997e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0140  bioH protein  69.49 
 
 		 240 aa  342  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4013  bioH protein  66.01 
 
 		 255 aa  341  5e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3801  bioH protein  69.07 
 
 		 240 aa  341  7e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4626  bioH protein  70.74 
 
 		 230 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3505  bioH protein  62.99 
 
 		 260 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3530  bioH protein  60.08 
 
 		 260 aa  328  4e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0242  bioH protein  56.82 
 
 		 268 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0199  carboxylesterase BioH  49.22 
 
 		 261 aa  247  1e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001876  biotin synthesis protein BioH  47.64 
 
 		 261 aa  233  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3693  carboxylesterase BioH  47.56 
 
 		 256 aa  230  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0301  bioH protein  48.13 
 
 		 256 aa  229  3e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.100907  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03264  carboxylesterase of pimeloyl-CoA synthesis  48.13 
 
 		 256 aa  229  4e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0414554  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3609  carboxylesterase BioH  48.13 
 
 		 256 aa  229  4e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03216  hypothetical protein  48.13 
 
 		 256 aa  229  4e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0353415  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0301  carboxylesterase BioH  48.13 
 
 		 256 aa  229  4e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.151878  normal  0.0475202 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0318  bioH protein  46.27 
 
 		 259 aa  228  5e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3887  carboxylesterase BioH  48.13 
 
 		 256 aa  228  8e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.840174  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3793  carboxylesterase BioH  48.13 
 
 		 256 aa  227  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4719  carboxylesterase BioH  47.72 
 
 		 256 aa  226  3e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3825  bioH protein  46.03 
 
 		 257 aa  226  4e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3879  carboxylesterase BioH  45.31 
 
 		 256 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3817  carboxylesterase BioH  45.31 
 
 		 256 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.979411 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3783  carboxylesterase BioH  44.9 
 
 		 256 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3711  carboxylesterase BioH  45.31 
 
 		 256 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4632  bioH protein  45.12 
 
 		 264 aa  222  4.9999999999999996e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0236  bioH protein  45.49 
 
 		 261 aa  221  8e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00616  biotin biosynthesis protein BioH  46.96 
 
 		 254 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3924  bioH protein  45.53 
 
 		 255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2290  bioH protein  45.35 
 
 		 268 aa  220  1.9999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3708  carboxylesterase BioH  45.11 
 
 		 240 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4117  bioH protein  44.72 
 
 		 255 aa  218  7e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03993  putative bioH protein  48.95 
 
 		 269 aa  211  1e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.39714  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3748  carboxylesterase bioH  43.03 
 
 		 258 aa  207  1e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3988  carboxylesterase bioH  43.03 
 
 		 258 aa  207  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0165  bioH protein  43.03 
 
 		 258 aa  207  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4230  bioH protein  43.46 
 
 		 258 aa  203  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.763657  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0217  bioH protein  42.13 
 
 		 273 aa  196  4.0000000000000005e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.59691  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3200  bioH protein  37.2 
 
 		 259 aa  177  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.111327  normal  0.0170475 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3829  bioH protein  41.11 
 
 		 259 aa  172  5.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03628  putative pimeloyl-BioC--CoA transferase BioH  39.92 
 
 		 275 aa  168  9e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0627  bioH protein  39.69 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0709  biotin biosynthesis protein  38.91 
 
 		 255 aa  166  5e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2162  bioH protein  36.05 
 
 		 266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2099  biotin biosynthesis protein, BioH  38.82 
 
 		 255 aa  159  3e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1554  biotin biosynthesis protein BioH  35.46 
 
 		 239 aa  157  1e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1430  biotin biosynthesis protein BioH  35.06 
 
 		 239 aa  156  3e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1131  bioH protein  33.72 
 
 		 263 aa  154  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0485  bioH protein  35.27 
 
 		 253 aa  143  3e-33  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.361568  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1127  BioH protein  33.33 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0321  BioH  35.78 
 
 		 247 aa  121  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.026043 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3014  putative pimeloyl-BioC--CoA transferase BioH  36.21 
 
 		 246 aa  120  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2898  alpha/beta fold hydrolase  34.27 
 
 		 237 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0883577 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1664  biotin biosynthesis protein  31.76 
 
 		 266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000138969  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1980  Alpha/beta hydrolase fold  31.6 
 
 		 277 aa  108  9.000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  30.65 
 
 		 266 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0420  bioH protein  35.08 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355399 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0244  bioH protein  35.08 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  29.72 
 
 		 270 aa  104  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4838  carboxylesterase  30.28 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.665163 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0364  carboxylesterase  29.88 
 
 		 243 aa  101  9e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5174  Alpha/beta hydrolase fold  33.92 
 
 		 243 aa  101  9e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.152016  normal  0.266185 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0602  putative biotin biosynthesis protein bioH  33.5 
 
 		 240 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06530  putative biotin biosynthesis protein bioH  33.5 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.355424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0394  carboxylesterase  30.28 
 
 		 243 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.307136  normal  0.471303 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2434  alpha/beta hydrolase fold  35.83 
 
 		 253 aa  99.4  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0989494 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0390  carboxylesterase  29.48 
 
 		 243 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.968879 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4685  bioH protein  31.51 
 
 		 243 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 		 271 aa  95.1  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0496  bioH protein  30.64 
 
 		 243 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06000  biotin biosynthesis protein BioH  32 
 
 		 240 aa  92.4  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0935  putative carboxylesterase BioH  26.48 
 
 		 234 aa  90.1  3e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1042  carboxylesterase  26.48 
 
 		 234 aa  90.1  3e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.763205  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3855  alpha/beta hydrolase fold  30.53 
 
 		 270 aa  89  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2092  alpha/beta hydrolase fold  28.08 
 
 		 275 aa  89  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.168465  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 272 aa  85.9  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3455  carboxylesterase  25.93 
 
 		 267 aa  84.3  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.862488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0156  Carboxylesterase  34.15 
 
 		 248 aa  84.3  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4086  carboxylesterase  30.96 
 
 		 241 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  28.19 
 
 		 273 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0806  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1704  alpha/beta hydrolase fold protein  29.49 
 
 		 216 aa  77.8  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  27.88 
 
 		 558 aa  77.4  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2561  alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0975578  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0011  alpha/beta hydrolase fold protein  27.65 
 
 		 278 aa  73.2  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4453  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  23.37 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2427  alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 		 278 aa  71.6  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  29.26 
 
 		 284 aa  70.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0961  alpha/beta hydrolase fold  34.62 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0214674  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3779  cyclic nucleotide-binding protein  25.19 
 
 		 453 aa  68.6  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0440455  normal  0.0476196 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0487  alpha/beta hydrolase fold  26.72 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>