More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_15720 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  100 
 
 		 208 aa  414  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  63.08 
 
 		 215 aa  242  3e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  62.76 
 
 		 202 aa  239  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  65.8 
 
 		 199 aa  238  5.999999999999999e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  63.4 
 
 		 202 aa  236  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5219  riboflavin synthase, alpha subunit  65.67 
 
 		 212 aa  227  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0860  riboflavin synthase, alpha subunit  59.9 
 
 		 210 aa  223  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  0.0432562 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3721  riboflavin synthase subunit alpha  60.62 
 
 		 203 aa  219  3e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2693  riboflavin synthase subunit alpha  61.14 
 
 		 205 aa  218  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2979  riboflavin synthase, alpha subunit  61.5 
 
 		 209 aa  216  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.209687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  56.77 
 
 		 193 aa  215  2.9999999999999998e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  60.91 
 
 		 220 aa  214  5.9999999999999996e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  59.9 
 
 		 205 aa  213  9.999999999999999e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  57.29 
 
 		 217 aa  210  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  54.82 
 
 		 223 aa  209  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  60.71 
 
 		 200 aa  207  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11441  riboflavin synthase subunit alpha  58.16 
 
 		 201 aa  207  1e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.370285 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  58.55 
 
 		 221 aa  206  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2562  riboflavin synthase, alpha subunit  55.5 
 
 		 207 aa  206  2e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01560  riboflavin synthase, alpha subunit  55.28 
 
 		 204 aa  200  9.999999999999999e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.913253 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1859  riboflavin synthase, alpha subunit  57.79 
 
 		 204 aa  199  3e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  0.387572 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2436  riboflavin synthase subunit alpha  56.78 
 
 		 203 aa  197  9e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2389  riboflavin synthase subunit alpha  56.78 
 
 		 203 aa  197  9e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160272  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2430  riboflavin synthase subunit alpha  56.28 
 
 		 203 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  48.44 
 
 		 215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  47.42 
 
 		 214 aa  193  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  52.26 
 
 		 223 aa  192  3e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  48.76 
 
 		 214 aa  192  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3707  riboflavin synthase, alpha subunit  55.1 
 
 		 196 aa  192  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  47.92 
 
 		 214 aa  192  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  52.06 
 
 		 216 aa  191  5e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  47.42 
 
 		 218 aa  191  8e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00070  riboflavin synthase, alpha subunit  55.33 
 
 		 204 aa  190  1e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  47.92 
 
 		 214 aa  190  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  50.52 
 
 		 215 aa  189  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3112  riboflavin synthase, alpha subunit  53.2 
 
 		 208 aa  187  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  47.4 
 
 		 217 aa  186  3e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  51.04 
 
 		 215 aa  185  4e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  47.4 
 
 		 217 aa  184  7e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0747  riboflavin synthase subunit alpha  46.91 
 
 		 216 aa  184  8e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1765  riboflavin synthase, alpha subunit  55.44 
 
 		 214 aa  184  8e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  47.4 
 
 		 221 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  49.48 
 
 		 217 aa  182  3e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1304  riboflavin synthase, alpha subunit  50.78 
 
 		 216 aa  179  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.851086  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2883  riboflavin synthase subunit alpha  46.39 
 
 		 215 aa  180  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.34702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1723  riboflavin synthase subunit alpha  50.23 
 
 		 227 aa  179  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516188  hitchhiker  0.00196087 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  50.26 
 
 		 219 aa  179  4e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  45.83 
 
 		 218 aa  178  5.999999999999999e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2602  riboflavin synthase, alpha subunit  48.77 
 
 		 205 aa  177  8e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4180  riboflavin synthase subunit alpha  46 
 
 		 214 aa  176  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3942  riboflavin synthase subunit alpha  45.5 
 
 		 214 aa  176  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  48.44 
 
 		 217 aa  176  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4244  riboflavin synthase subunit alpha  46 
 
 		 214 aa  176  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  48.21 
 
 		 216 aa  176  3e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2766  riboflavin synthase, alpha subunit  53.12 
 
 		 201 aa  176  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.210112  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  48.44 
 
 		 217 aa  174  6e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4152  riboflavin synthase, alpha subunit  50 
 
 		 233 aa  174  9e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0119358  hitchhiker  0.00855213 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0553  riboflavin synthase subunit alpha  50.78 
 
 		 192 aa  174  9e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4019  riboflavin synthase subunit alpha  47.4 
 
 		 214 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3852  riboflavin synthase subunit alpha  47.4 
 
 		 214 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3866  riboflavin synthase subunit alpha  47.4 
 
 		 214 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  47.96 
 
 		 213 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4332  riboflavin synthase subunit alpha  47.4 
 
 		 214 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4134  riboflavin synthase subunit alpha  47.4 
 
 		 214 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1273  riboflavin synthase subunit alpha  51 
 
 		 251 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.373271  normal  0.402844 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  48.96 
 
 		 214 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1670  riboflavin synthase subunit alpha  51.52 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57182e-16 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3187  riboflavin synthase subunit alpha  48.68 
 
 		 238 aa  172  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00151033  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  45.31 
 
 		 207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2730  riboflavin synthase subunit alpha  47.44 
 
 		 215 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.964623 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  44.33 
 
 		 226 aa  172  5e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1675  riboflavin synthase subunit alpha  52.24 
 
 		 222 aa  171  5e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.420891  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1727  riboflavin synthase, alpha subunit  56.41 
 
 		 202 aa  171  5.999999999999999e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0379376  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  46.88 
 
 		 216 aa  171  5.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  45.6 
 
 		 216 aa  170  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10000  riboflavin synthase, alpha subunit  48.68 
 
 		 215 aa  170  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0969  riboflavin synthase subunit alpha  50.52 
 
 		 203 aa  170  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.833075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1624  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 		 219 aa  169  3e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.137296  normal  0.0697591 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2063  riboflavin synthase, alpha subunit  49.21 
 
 		 212 aa  168  4e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.282558  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  44.39 
 
 		 239 aa  168  5e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3261  riboflavin synthase, alpha subunit  50.77 
 
 		 201 aa  168  5e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3463  hypothetical protein  50.52 
 
 		 199 aa  168  5e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  49.74 
 
 		 221 aa  167  7e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  46.63 
 
 		 220 aa  167  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  44.56 
 
 		 220 aa  166  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  47.92 
 
 		 217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  48.19 
 
 		 227 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2925  riboflavin synthase subunit alpha  49.23 
 
 		 215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2833  riboflavin synthase subunit alpha  49.23 
 
 		 215 aa  165  4e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2640  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 		 203 aa  165  5e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.461604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1403  riboflavin synthase, alpha subunit  49.25 
 
 		 208 aa  164  5.9999999999999996e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  46.63 
 
 		 221 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3865  riboflavin synthase, alpha subunit  47.94 
 
 		 198 aa  164  6.9999999999999995e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478326 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  45.08 
 
 		 220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  46.11 
 
 		 217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1160  riboflavin synthase, alpha subunit  43.92 
 
 		 204 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  46.97 
 
 		 216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  46.11 
 
 		 219 aa  162  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_972  riboflavin synthase, alpha subunit  44.04 
 
 		 205 aa  162  3e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0666054  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  46.63 
 
 		 219 aa  162  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>