165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1825 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  100 
 
 		 225 aa  455  1e-127  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  74.75 
 
 		 217 aa  304  8.000000000000001e-82  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  47.42 
 
 		 210 aa  174  9e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  47.18 
 
 		 210 aa  167  1e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  42.63 
 
 		 207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1198  proteasome endopeptidase complex  43.65 
 
 		 214 aa  160  2e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156853  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  44.1 
 
 		 211 aa  159  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  43.43 
 
 		 213 aa  156  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  43.08 
 
 		 211 aa  154  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  46.63 
 
 		 200 aa  153  2e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  41.79 
 
 		 217 aa  152  5e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  43.08 
 
 		 209 aa  149  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  40.18 
 
 		 219 aa  149  5e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  40.29 
 
 		 219 aa  146  3e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  40.29 
 
 		 219 aa  146  3e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  42.93 
 
 		 212 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  39.32 
 
 		 219 aa  142  3e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  37.93 
 
 		 203 aa  141  7e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0694  proteasome endopeptidase complex  37.57 
 
 		 198 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  35.27 
 
 		 203 aa  138  6e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.662481 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  40.21 
 
 		 196 aa  137  1e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  38.69 
 
 		 204 aa  135  5e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1307  proteasome endopeptidase complex  38.38 
 
 		 200 aa  134  8e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.644154  normal  0.454168 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  40.56 
 
 		 201 aa  134  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  34.78 
 
 		 203 aa  134  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  36.45 
 
 		 203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0608  20S proteasome A and B subunits  40 
 
 		 243 aa  132  6e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.109869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  40.44 
 
 		 201 aa  132  6e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  40.22 
 
 		 200 aa  131  9e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  38.78 
 
 		 202 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0458  proteasome endopeptidase complex  39.56 
 
 		 206 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.180759 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2268  proteasome endopeptidase complex  38.62 
 
 		 196 aa  124  1e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  36.47 
 
 		 210 aa  115  3.9999999999999997e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2664  Proteasome endopeptidase complex  36.06 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0514  20S proteasome A and B subunits  36.41 
 
 		 250 aa  103  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20007  predicted protein  33.15 
 
 		 283 aa  100  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3351  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  34.86 
 
 		 243 aa  99.8  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2272  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  34.46 
 
 		 237 aa  95.5  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02080  proteasome component pts1, putative  31.05 
 
 		 301 aa  93.6  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  33.54 
 
 		 259 aa  92  7e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1568  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  34.66 
 
 		 243 aa  91.7  9e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27330  predicted protein  31.52 
 
 		 297 aa  91.7  9e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00217957  normal  0.014135 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  34.76 
 
 		 259 aa  91.7  9e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  34.76 
 
 		 259 aa  90.9  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  34.76 
 
 		 259 aa  91.3  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36375  predicted protein  30.16 
 
 		 282 aa  90.9  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0018  Proteasome endopeptidase complex  35.26 
 
 		 237 aa  87.4  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.815812  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03932  proteasome component Pre2, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08310)  27.75 
 
 		 296 aa  87.4  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0019  proteasome subunit alpha  32.98 
 
 		 247 aa  87.4  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03530  proteasome subunit, beta type, 7, putative  30.73 
 
 		 303 aa  86.3  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2282  proteasome subunit alpha  30.06 
 
 		 239 aa  85.5  6e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41720  predicted protein  30.26 
 
 		 217 aa  85.1  7e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.484147  normal  0.352684 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1822  proteasome subunit alpha  31.21 
 
 		 240 aa  85.1  7e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0196  proteasome subunit alpha  32.75 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000616986  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_5128  predicted protein  33.15 
 
 		 197 aa  84.7  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.199024  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2503  proteasome subunit alpha  33.33 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.970556 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03756  putative proteasome core beta subunit (Eurofung)  31.47 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.866002 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02085  proteasome component Pup1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04910)  32.28 
 
 		 272 aa  81.6  0.000000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.217986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  30.49 
 
 		 271 aa  81.6  0.000000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43808  predicted protein  29.7 
 
 		 232 aa  81.6  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.963237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51691  proteasome beta subunit  27.89 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2526  proteasome subunit alpha  28.9 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.412053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2273  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  32.76 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2463  20S proteasome A and B subunits  37.93 
 
 		 292 aa  75.9  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0388178  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2426  20S proteasome A and B subunits  33.69 
 
 		 288 aa  75.5  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0167637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2442  20S proteasome A and B subunits  34.94 
 
 		 280 aa  75.5  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000142562  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1341  proteasome subunit alpha  25.99 
 
 		 272 aa  75.1  0.0000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20981  hitchhiker  0.00320062 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3313  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  29.82 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1678  proteasome subunit alpha  27.75 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2663  proteasome subunit alpha  28.66 
 
 		 245 aa  74.3  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1919  20S proteasome A and B subunits  32.65 
 
 		 273 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000109069 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2172  proteasome subunit alpha  28.72 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1790  proteasome subunit beta  33.02 
 
 		 282 aa  73.2  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.568871  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_6151  predicted protein  28.09 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.276783  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1488  20S proteasome A and B subunits  34.04 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82713  predicted protein  29.52 
 
 		 250 aa  72.8  0.000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0184174  normal  0.129752 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0910  20S proteasome A and B subunits  30.89 
 
 		 273 aa  72.8  0.000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.135813  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38885  predicted protein  27.09 
 
 		 242 aa  71.2  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1707  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  29.82 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2311  20S proteasome A and B subunits  29.95 
 
 		 284 aa  70.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000180719  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2627  proteasome subunit beta  30.46 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2159  20S proteasome A and B subunits  29.35 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22030  proteasome endopeptidase complex, beta component  34.33 
 
 		 289 aa  70.1  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00409578  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05784  putative proteasome core component, beta 6 subunit (Eurofung)  26.43 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.109693  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01360  proteasome subunit alpha type 5, putative  26.9 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.829356  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33268  predicted protein  27.75 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.994073 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0185  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  27.8 
 
 		 243 aa  69.7  0.00000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000839999  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1495  20S proteasome A and B subunits  31.91 
 
 		 280 aa  69.3  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0147086 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_5311  predicted protein  28.65 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00710268  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4461  20S proteasome A and B subunits  31.69 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.298053  normal  0.126997 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1204  20S proteasome A and B subunits  30.59 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.101422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0963  proteasome subunit alpha  29.29 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.270146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1188  proteasome subunit beta  28.57 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.846216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_65073  20S proteasome, regulatory subunit beta type PSMB7/PSMB10/PUP1  29.44 
 
 		 267 aa  67  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.197238 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3077  20S proteasome, A and B subunits  30.92 
 
 		 303 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.137735 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14571  predicted protein  28.79 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39514  predicted protein  24.74 
 
 		 246 aa  67  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2802  proteasome subunit alpha  27.54 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28202  proteasome subunit alpha  29.59 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1365  proteasome subunit alpha  28.07 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.800783  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>