More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0753 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0753  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
685 aa  1365    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.371532  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1046  extracellular solute-binding protein  77.35 
 
 
675 aa  977    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1328  extracellular solute-binding protein  32.39 
 
 
734 aa  271  4e-71  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0036093  normal  0.504414 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0429  extracellular solute-binding protein family 5  33.89 
 
 
726 aa  269  2e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.585941  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1255  extracellular solute-binding protein family 5  28.12 
 
 
566 aa  145  2e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  25.29 
 
 
521 aa  120  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  25.29 
 
 
521 aa  120  7e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.29 
 
 
521 aa  120  7e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  25.29 
 
 
521 aa  120  7e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  25.29 
 
 
521 aa  120  7e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04900  extracellular solute-binding protein family 5  24.17 
 
 
601 aa  110  8.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016301  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  22.22 
 
 
515 aa  109  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  24.36 
 
 
544 aa  105  3e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  21.12 
 
 
541 aa  105  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2122  extracellular solute-binding protein  22.4 
 
 
573 aa  105  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.973923 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  23.75 
 
 
544 aa  102  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  21.68 
 
 
535 aa  99.8  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  22.15 
 
 
540 aa  100  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  21.84 
 
 
540 aa  96.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  22.15 
 
 
540 aa  97.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  22.85 
 
 
528 aa  97.1  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1849  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 
614 aa  96.3  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000095247  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  24.36 
 
 
565 aa  95.1  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  20.68 
 
 
534 aa  94  8e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1000  glutathione-binding protein GsiB  25.77 
 
 
512 aa  93.2  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  25.77 
 
 
512 aa  93.2  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  23.62 
 
 
516 aa  92.4  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  25.53 
 
 
512 aa  92.8  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0979  glutathione-binding protein GsiB  25.53 
 
 
512 aa  92.8  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  25.53 
 
 
512 aa  92.8  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0460  4-phytase  22.67 
 
 
615 aa  91.7  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  24.77 
 
 
512 aa  91.3  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  24.77 
 
 
512 aa  91.3  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  24.77 
 
 
512 aa  91.3  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0475  4-phytase  22.69 
 
 
614 aa  91.3  5e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  24.77 
 
 
512 aa  90.9  7e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2347  extracellular solute-binding protein  23.49 
 
 
516 aa  90.1  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33855  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3888  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  23.55 
 
 
550 aa  89.7  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.799639  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  24.77 
 
 
512 aa  89.7  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1324  extracellular solute-binding protein  25.43 
 
 
512 aa  89.4  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.725738 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  24.54 
 
 
512 aa  88.6  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  24.54 
 
 
512 aa  88.6  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3133  twin-arginine translocation pathway signal  24.69 
 
 
529 aa  88.2  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.362143 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00797  predicted peptide transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  24.54 
 
 
493 aa  88.2  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2497  extracellular solute-binding protein family 5  22.25 
 
 
528 aa  88.2  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0778602 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1600  extracellular solute-binding protein  25.35 
 
 
501 aa  86.7  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2170  extracellular solute-binding protein  22.07 
 
 
516 aa  87  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.233404  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0554  extracellular solute-binding protein  22.33 
 
 
581 aa  87  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2713  extracellular solute-binding protein  23.17 
 
 
529 aa  86.7  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2099  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  22.07 
 
 
516 aa  87  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  24.07 
 
 
529 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01445  D-ala-D-a la transporter subunit  22.07 
 
 
516 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2160  extracellular solute-binding protein family 5  22.07 
 
 
516 aa  86.3  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0024579  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  24.54 
 
 
512 aa  86.3  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  23.04 
 
 
538 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1686  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  22.07 
 
 
516 aa  86.3  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  24.06 
 
 
539 aa  86.3  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1729  extracellular solute-binding protein  21.32 
 
 
615 aa  85.9  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000266848  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1182  extracellular solute-binding protein family 5  23.96 
 
 
581 aa  85.1  0.000000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  24.87 
 
 
538 aa  85.1  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1572  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  21.83 
 
 
516 aa  85.1  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2377  extracellular solute-binding protein  26.26 
 
 
552 aa  84.3  0.000000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000449683  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  24.65 
 
 
501 aa  84  0.000000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4405  extracellular solute-binding protein  22.55 
 
 
532 aa  84  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1750  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  21.83 
 
 
516 aa  84  0.000000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.843018  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3308  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
528 aa  83.2  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.705056 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  23.08 
 
 
520 aa  83.6  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2491  extracellular solute-binding protein family 5  31.48 
 
 
593 aa  83.2  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000117082  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5235  extracellular solute-binding protein family 5  22.06 
 
 
522 aa  82.8  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2107  extracellular solute-binding protein  23 
 
 
532 aa  83.2  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.4 
 
 
520 aa  82  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2658  extracellular solute-binding protein family 5  23.25 
 
 
529 aa  82  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293814 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0547  extracellular solute-binding protein  23.47 
 
 
531 aa  82.4  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  23.06 
 
 
532 aa  81.3  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  23.46 
 
 
520 aa  81.6  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2309  extracellular solute-binding protein  22.49 
 
 
534 aa  81.3  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2923  extracellular solute-binding protein  22.49 
 
 
534 aa  81.3  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2938  extracellular solute-binding protein  22.49 
 
 
531 aa  80.9  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  22.71 
 
 
524 aa  80.9  0.00000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6266  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  22.22 
 
 
531 aa  80.9  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.857663  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  23.93 
 
 
546 aa  80.9  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  20.25 
 
 
509 aa  80.5  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0365  extracellular solute-binding protein family 5  23.6 
 
 
517 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2482  extracellular solute-binding protein  25.49 
 
 
582 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0259131  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.65 
 
 
525 aa  79.3  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1878  extracellular solute-binding protein  22.33 
 
 
536 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0426  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 
522 aa  79.7  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133353  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4052  extracellular solute-binding protein  22.64 
 
 
520 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544759  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  24.09 
 
 
565 aa  79.7  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3571  extracellular solute-binding protein  22.64 
 
 
520 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57508  normal  0.258108 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0329  extracellular solute-binding protein  22.43 
 
 
531 aa  79  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  0.0616043 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4075  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  22.95 
 
 
535 aa  79  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2056  periplasmic dipeptide transport protein precursor  23.16 
 
 
532 aa  79  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184376  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2657  extracellular solute-binding protein  31.91 
 
 
617 aa  78.6  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000297428  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3490  extracellular solute-binding protein  24.81 
 
 
529 aa  79  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0088  4-phytase  22.95 
 
 
535 aa  79  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  24.1 
 
 
520 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1538  extracellular solute-binding protein family 5  26.15 
 
 
563 aa  79  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000498479  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4056  periplasmic dipeptide transport protein  22.95 
 
 
535 aa  79  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0133  extracellular solute-binding protein  20.79 
 
 
576 aa  78.6  0.0000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>