More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0554 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0554  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 581 aa  1198    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2122  extracellular solute-binding protein  66.61 
 
 		 573 aa  769    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.973923 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0475  4-phytase  34.19 
 
 		 614 aa  339  9.999999999999999e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0460  4-phytase  34.13 
 
 		 615 aa  333  5e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0133  extracellular solute-binding protein  33.04 
 
 		 576 aa  324  3e-87  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04900  extracellular solute-binding protein family 5  35.06 
 
 		 601 aa  305  2.0000000000000002e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016301  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0348  extracellular solute-binding protein  31.2 
 
 		 617 aa  286  7e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.663793  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1575  extracellular solute-binding protein  30.72 
 
 		 617 aa  283  5.000000000000001e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000589717  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1849  extracellular solute-binding protein  31.23 
 
 		 614 aa  281  2e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000095247  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1729  extracellular solute-binding protein  29.95 
 
 		 615 aa  264  3e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000266848  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1255  extracellular solute-binding protein family 5  29.33 
 
 		 566 aa  223  6e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  26.97 
 
 		 515 aa  159  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  26.05 
 
 		 534 aa  152  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1671  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 		 538 aa  150  9e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  25.78 
 
 		 544 aa  141  3e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  24.91 
 
 		 535 aa  141  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 		 535 aa  137  4e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0067  extracellular solute-binding protein  24.34 
 
 		 542 aa  137  5e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1600  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 501 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  24.23 
 
 		 544 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  24.43 
 
 		 501 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  26.04 
 
 		 535 aa  134  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  26.04 
 
 		 535 aa  134  6e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  26.04 
 
 		 535 aa  134  6e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  26.04 
 
 		 535 aa  134  6e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  26.04 
 
 		 535 aa  134  6e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  26.04 
 
 		 535 aa  134  6e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  26.04 
 
 		 535 aa  134  6e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  25.61 
 
 		 535 aa  134  6e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  26.04 
 
 		 535 aa  134  6e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0114  extracellular solute-binding protein  24.82 
 
 		 530 aa  132  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3950  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  25.71 
 
 		 526 aa  131  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3906  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  25.71 
 
 		 526 aa  131  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3842  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  25.71 
 
 		 526 aa  131  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4010  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  25.52 
 
 		 526 aa  130  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2835  extracellular solute-binding protein  25.34 
 
 		 531 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.827526 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0183  extracellular solute-binding protein  25.34 
 
 		 532 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4405  extracellular solute-binding protein  27.17 
 
 		 532 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3828  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  25.52 
 
 		 526 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.808847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  23.01 
 
 		 532 aa  129  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4250  peptide ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.39 
 
 		 528 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.146199 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2972  extracellular solute-binding protein  25.34 
 
 		 531 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1781  extracellular solute-binding protein  25.77 
 
 		 501 aa  127  4.0000000000000003e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000533035  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1965  extracellular solute-binding protein family 5  25.67 
 
 		 556 aa  127  5e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0844  extracellular solute-binding protein  27.26 
 
 		 531 aa  127  6e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  23.16 
 
 		 532 aa  127  7e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0468  extracellular solute-binding protein family 5  25.39 
 
 		 528 aa  126  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3231  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  25 
 
 		 532 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.704667  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6266  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  26.06 
 
 		 531 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.857663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2309  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 		 534 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2923  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 		 534 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3969  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 532 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  24.15 
 
 		 526 aa  124  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3174  dipeptide ABC transporter substrate-binding protein  22.98 
 
 		 523 aa  124  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0381  extracellular solute-binding protein  25.72 
 
 		 531 aa  124  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.265556 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2938  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 		 531 aa  124  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5193  extracellular solute-binding protein  26.82 
 
 		 529 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0587295  normal  0.27415 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  22.49 
 
 		 541 aa  123  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0187  extracellular solute-binding protein  26.49 
 
 		 529 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000120375 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2532  extracellular solute-binding protein family 5  25.62 
 
 		 525 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4296  extracellular solute-binding protein  25.88 
 
 		 531 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0329  extracellular solute-binding protein  23.5 
 
 		 531 aa  122  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  0.0616043 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4098  extracellular solute-binding protein family 5  25.7 
 
 		 535 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0925  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 		 536 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4075  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  24.34 
 
 		 535 aa  121  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0088  4-phytase  24.34 
 
 		 535 aa  121  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4056  periplasmic dipeptide transport protein  24.34 
 
 		 535 aa  121  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  22.37 
 
 		 528 aa  120  9e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3431  extracellular solute-binding protein  25.47 
 
 		 531 aa  119  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000878954 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0925  extracellular solute-binding protein family 5  26.42 
 
 		 523 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.30323 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  24.5 
 
 		 520 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0049  extracellular solute-binding protein family 5  23.77 
 
 		 535 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.46848  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0044  extracellular solute-binding protein family 5  23.55 
 
 		 535 aa  118  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1248  extracellular solute-binding protein  24.65 
 
 		 537 aa  117  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.710714 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2678  extracellular solute-binding protein  24.43 
 
 		 500 aa  117  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00233729  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0882  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  25.7 
 
 		 544 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0921  extracellular solute-binding protein  25.7 
 
 		 536 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.776476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2065  extracellular solute-binding protein family 5  23.04 
 
 		 543 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  25.34 
 
 		 495 aa  116  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58360  putative binding protein component of ABC transpor  25.34 
 
 		 532 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0138  extracellular solute-binding protein  23.58 
 
 		 535 aa  116  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01730  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.27 
 
 		 560 aa  116  1.0000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48060  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 		 525 aa  115  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  23.14 
 
 		 521 aa  114  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0584  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.53 
 
 		 528 aa  115  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.542939  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5110  ABC transporter periplasmic binding protein  25.69 
 
 		 537 aa  114  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.321263  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  23.34 
 
 		 521 aa  114  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.34 
 
 		 521 aa  114  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  23.34 
 
 		 521 aa  114  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  23.34 
 
 		 521 aa  114  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1531  extracellular solute-binding protein family 5  24.96 
 
 		 531 aa  114  5e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3706  extracellular solute-binding protein family 5  25.56 
 
 		 533 aa  114  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2356  extracellular solute-binding protein  25.95 
 
 		 529 aa  114  7.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.458822  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2197  extracellular solute-binding protein family 5  24.55 
 
 		 556 aa  113  7.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1799  extracellular solute-binding protein family 5  24.04 
 
 		 531 aa  113  8.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0907769  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0422  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.34 
 
 		 528 aa  113  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.537378  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0402  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.34 
 
 		 528 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.882442  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0181  ABC dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  25.47 
 
 		 547 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2005  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.34 
 
 		 528 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2283  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.34 
 
 		 528 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0708849  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>