More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1575 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1575  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 617 aa  1261    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000589717  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0348  extracellular solute-binding protein  51.7 
 
 		 617 aa  679    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.663793  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0475  4-phytase  57.65 
 
 		 614 aa  736    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0460  4-phytase  57.72 
 
 		 615 aa  733    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1849  extracellular solute-binding protein  55.7 
 
 		 614 aa  695    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000095247  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1729  extracellular solute-binding protein  48.54 
 
 		 615 aa  625  1e-178  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000266848  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04900  extracellular solute-binding protein family 5  45.1 
 
 		 601 aa  536  1e-151  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016301  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0133  extracellular solute-binding protein  34.91 
 
 		 576 aa  422  1e-117  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2122  extracellular solute-binding protein  32.56 
 
 		 573 aa  300  4e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.973923 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0554  extracellular solute-binding protein  31.21 
 
 		 581 aa  279  1e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1255  extracellular solute-binding protein family 5  28.17 
 
 		 566 aa  213  1e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  24.72 
 
 		 515 aa  157  4e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  26.85 
 
 		 532 aa  154  5e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2203  extracellular solute-binding protein  25.36 
 
 		 872 aa  152  2e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000826446 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2532  extracellular solute-binding protein family 5  26.17 
 
 		 525 aa  149  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1248  extracellular solute-binding protein  23.34 
 
 		 537 aa  139  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.710714 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3888  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  25.17 
 
 		 550 aa  136  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.799639  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2326  extracellular solute-binding protein  25.37 
 
 		 546 aa  135  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.294702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1906  extracellular solute-binding protein  25.21 
 
 		 543 aa  135  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0377443  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2465  extracellular solute-binding protein  25.94 
 
 		 529 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.352303 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2047  extracellular solute-binding protein  27.19 
 
 		 529 aa  131  4.0000000000000003e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.101703  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  24.35 
 
 		 521 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.35 
 
 		 521 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  24.35 
 
 		 521 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  24.35 
 
 		 521 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0925  extracellular solute-binding protein family 5  25.61 
 
 		 523 aa  129  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.30323 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7644  extracellular solute-binding protein  24.96 
 
 		 528 aa  128  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.938913  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  24.52 
 
 		 521 aa  127  6e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0038  extracellular solute-binding protein  24.14 
 
 		 532 aa  127  7e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.216937  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0389  extracellular solute-binding protein  26.03 
 
 		 527 aa  124  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000716553  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0807  ABC dipeptide transporter, substrate-binding subunit DdpA  26.11 
 
 		 538 aa  123  9e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123514  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1917  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 518 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2347  extracellular solute-binding protein  24.55 
 
 		 516 aa  122  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0372  extracellular solute-binding protein  25.43 
 
 		 529 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.132597  normal  0.149219 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0480  extracellular solute-binding protein family 5  25.21 
 
 		 569 aa  121  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105843  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  24.49 
 
 		 532 aa  120  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3829  extracellular solute-binding protein  24.27 
 
 		 569 aa  119  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.847313 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  23.89 
 
 		 544 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  24.62 
 
 		 535 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  23.47 
 
 		 541 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3371  extracellular solute-binding protein family 5  23.77 
 
 		 536 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  23.72 
 
 		 544 aa  118  3.9999999999999997e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4180  extracellular solute-binding protein family 5  24.16 
 
 		 547 aa  117  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  23.82 
 
 		 520 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  24.53 
 
 		 534 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  25.21 
 
 		 538 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3852  extracellular solute-binding protein family 5  24.16 
 
 		 547 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2998  extracellular solute-binding protein family 5  24.19 
 
 		 610 aa  114  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.869563  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  24.15 
 
 		 509 aa  114  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6149  extracellular solute-binding protein family 5  25.74 
 
 		 566 aa  114  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.784749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6301  extracellular solute-binding protein family 5  25.51 
 
 		 535 aa  113  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4118  family 1 extracellular solute-binding protein  24.78 
 
 		 543 aa  113  9e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.794373  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1600  extracellular solute-binding protein  23.47 
 
 		 501 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3537  extracellular solute-binding protein  24.96 
 
 		 556 aa  113  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3088  extracellular solute-binding protein  24.18 
 
 		 538 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.902972  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4004  extracellular solute-binding protein  25.51 
 
 		 535 aa  112  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4044  extracellular solute-binding protein family 5  22.91 
 
 		 536 aa  111  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  24.49 
 
 		 539 aa  112  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  22.76 
 
 		 501 aa  112  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3867  extracellular solute-binding protein family 5  23.08 
 
 		 536 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0562  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  24.2 
 
 		 518 aa  111  5e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3906  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  21.92 
 
 		 526 aa  110  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3950  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  21.92 
 
 		 526 aa  110  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3842  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  21.92 
 
 		 526 aa  110  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.62 
 
 		 566 aa  110  7.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.70881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1878  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 		 536 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2113  putative ABC transporter substrate-binding protein  25.2 
 
 		 539 aa  110  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  21.66 
 
 		 535 aa  110  9.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4010  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  21.92 
 
 		 526 aa  110  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0699  extracellular solute-binding protein family 5  23.97 
 
 		 590 aa  109  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  24.78 
 
 		 540 aa  109  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  22.85 
 
 		 505 aa  110  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3777  extracellular solute-binding protein  26.9 
 
 		 533 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0244  extracellular solute-binding protein family 5  24.29 
 
 		 575 aa  110  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.794885  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4591  extracellular solute-binding protein  26.9 
 
 		 533 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0197  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.34 
 
 		 535 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.415604  normal  0.0839796 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2713  extracellular solute-binding protein  24.83 
 
 		 529 aa  109  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3828  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  21.76 
 
 		 526 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.808847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5714  extracellular solute-binding protein  26.73 
 
 		 533 aa  108  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0573169 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2385  extracellular solute-binding protein family 5  23.01 
 
 		 594 aa  107  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1361  extracellular solute-binding protein family 5  23.48 
 
 		 516 aa  107  5e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000166548  normal  0.279813 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3102  extracellular solute-binding protein  25.6 
 
 		 549 aa  107  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.522775  hitchhiker  0.0000411022 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4017  extracellular solute-binding protein  27 
 
 		 533 aa  107  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0465332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  23.63 
 
 		 510 aa  107  7e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  24.46 
 
 		 565 aa  107  8e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  24.74 
 
 		 540 aa  107  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  22.76 
 
 		 526 aa  107  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  24.74 
 
 		 540 aa  107  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  21.34 
 
 		 535 aa  106  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  21.34 
 
 		 535 aa  106  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  21.34 
 
 		 535 aa  106  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4479  extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 		 533 aa  106  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.027731  normal  0.668994 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  21.34 
 
 		 535 aa  106  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18790  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  23.61 
 
 		 540 aa  106  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00232176  normal  0.206883 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  21.34 
 
 		 535 aa  106  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  21.34 
 
 		 535 aa  106  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  21.34 
 
 		 535 aa  106  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2170  extracellular solute-binding protein  23.18 
 
 		 516 aa  105  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.233404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  21.24 
 
 		 535 aa  105  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  21.81 
 
 		 520 aa  105  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>