More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2203 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_2203  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 872 aa  1741    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000826446 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04900  extracellular solute-binding protein family 5  26.32 
 
 		 601 aa  176  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016301  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1849  extracellular solute-binding protein  26.71 
 
 		 614 aa  162  2e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000095247  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0133  extracellular solute-binding protein  25.6 
 
 		 576 aa  157  6e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1729  extracellular solute-binding protein  25.94 
 
 		 615 aa  154  5.9999999999999996e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000266848  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1575  extracellular solute-binding protein  25.36 
 
 		 617 aa  152  3e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000589717  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0475  4-phytase  25.15 
 
 		 614 aa  144  7e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0460  4-phytase  25.27 
 
 		 615 aa  143  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0348  extracellular solute-binding protein  26.12 
 
 		 617 aa  140  1e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.663793  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2122  extracellular solute-binding protein  24.24 
 
 		 573 aa  120  7.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.973923 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0418  extracellular solute-binding protein family 5  23.7 
 
 		 622 aa  107  9e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0554  extracellular solute-binding protein  23.44 
 
 		 581 aa  103  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0699  extracellular solute-binding protein family 5  24.87 
 
 		 590 aa  101  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1255  extracellular solute-binding protein family 5  25.13 
 
 		 566 aa  97.8  7e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_932  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  23.51 
 
 		 558 aa  92.4  4e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000268358  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0925  extracellular solute-binding protein family 5  25.56 
 
 		 523 aa  88.2  6e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.30323 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2532  extracellular solute-binding protein family 5  24.69 
 
 		 525 aa  88.2  7e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0943  extracellular solute-binding protein  22.33 
 
 		 558 aa  85.1  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0446161  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0389  extracellular solute-binding protein  20.76 
 
 		 527 aa  84  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000716553  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2385  extracellular solute-binding protein family 5  22.74 
 
 		 594 aa  80.9  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0547  extracellular solute-binding protein  23.83 
 
 		 531 aa  80.5  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2247  extracellular solute-binding protein  23.13 
 
 		 535 aa  79.7  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0125251  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5634  hypothetical protein  23.89 
 
 		 568 aa  79.7  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00869862  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1046  extracellular solute-binding protein  28.16 
 
 		 675 aa  80.1  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0422  extracellular solute-binding protein  25.05 
 
 		 525 aa  79.7  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1494  extracellular solute-binding protein  25.09 
 
 		 526 aa  79.3  0.0000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.69615 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2713  extracellular solute-binding protein  26.5 
 
 		 529 aa  77.8  0.0000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0359  extracellular solute-binding protein family 5  25.96 
 
 		 607 aa  75.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0366  extracellular solute-binding protein family 5  25.96 
 
 		 607 aa  75.5  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3088  extracellular solute-binding protein  23.2 
 
 		 538 aa  75.1  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.902972  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0753  extracellular solute-binding protein family 5  40.78 
 
 		 685 aa  74.3  0.000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.371532  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1169  oligopeptide-binding protein of oligopeptide ABC transporter  30.26 
 
 		 587 aa  72  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.317639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3103  extracellular solute-binding protein family 5  22.46 
 
 		 526 aa  71.6  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.529212  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2000  extracellular solute-binding protein  22.49 
 
 		 550 aa  71.6  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2834  extracellular solute-binding protein family 5  22.98 
 
 		 526 aa  71.2  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.360597 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  21.42 
 
 		 538 aa  71.2  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_512  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, periplasmic component  23.97 
 
 		 530 aa  71.2  0.00000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.135113  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1172  family 1 extracellular solute-binding protein  27.02 
 
 		 594 aa  70.9  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  23.78 
 
 		 510 aa  70.5  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0799  extracellular solute-binding protein  22.06 
 
 		 531 aa  70.1  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.162067  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2012  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  21.98 
 
 		 545 aa  69.7  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0602  extracellular solute-binding protein  23.89 
 
 		 545 aa  69.7  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.497567  hitchhiker  0.000000266408 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1906  extracellular solute-binding protein  24.64 
 
 		 543 aa  69.3  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0377443  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1810  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 		 595 aa  69.7  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0337  extracellular solute-binding protein family 5  23.37 
 
 		 581 aa  69.3  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4719  extracellular solute-binding protein  27.73 
 
 		 591 aa  69.3  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  23.27 
 
 		 512 aa  68.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0866  twin-arginine translocation pathway signal  24.04 
 
 		 573 aa  68.9  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  23.27 
 
 		 512 aa  68.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  23.27 
 
 		 512 aa  68.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2944  extracellular solute-binding protein family 5  23.76 
 
 		 587 aa  68.6  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0305195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2124  hypothetical protein  22.31 
 
 		 566 aa  68.6  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.415891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3888  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  21.96 
 
 		 550 aa  68.6  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.799639  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1328  extracellular solute-binding protein  25.82 
 
 		 734 aa  68.2  0.0000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0036093  normal  0.504414 
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B15  oligopeptide ABC transporter OppAIV  22.78 
 
 		 530 aa  67  0.000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.470524  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3842  extracellular solute-binding protein family 5  22.28 
 
 		 535 aa  67.4  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.298652  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  24.64 
 
 		 540 aa  67.8  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1427  solute-binding family 5 protein  24.59 
 
 		 533 aa  67.4  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0573  oligopeptide-binding protein, putative  22.15 
 
 		 530 aa  66.6  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3512  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  21.72 
 
 		 568 aa  67  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321069  normal  0.988555 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3016  extracellular solute-binding protein family 5  21.75 
 
 		 545 aa  65.9  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0925  extracellular solute-binding protein  20.1 
 
 		 536 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3528  extracellular solute-binding protein  21.93 
 
 		 564 aa  65.9  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.61993  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7015  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  22.1 
 
 		 528 aa  65.9  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0208042  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0626  extracellular solute-binding protein  24.28 
 
 		 510 aa  65.9  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.797506  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1649  extracellular solute-binding protein family 5  25.45 
 
 		 584 aa  65.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2916  4-phytase  23.9 
 
 		 522 aa  65.9  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  21.68 
 
 		 544 aa  65.9  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0232  solute-binding family 5 protein  23.42 
 
 		 530 aa  66.2  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.79785  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  24.64 
 
 		 540 aa  65.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  22.14 
 
 		 534 aa  65.5  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0407  extracellular solute-binding protein family 5  24.04 
 
 		 528 aa  65.9  0.000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00229954  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0477  extracellular solute-binding protein family 5  23.4 
 
 		 573 aa  65.5  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1329  solute-binding family 5 protein  23.42 
 
 		 530 aa  65.5  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492206  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1261  solute-binding family 5 protein  23.42 
 
 		 530 aa  65.5  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.24251  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2574  solute-binding family 5 protein  23.42 
 
 		 530 aa  65.5  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2047  extracellular solute-binding protein  26.73 
 
 		 529 aa  65.1  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.101703  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  21.31 
 
 		 544 aa  65.1  0.000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  22.63 
 
 		 510 aa  65.1  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3971  extracellular solute-binding protein family 5  24.91 
 
 		 518 aa  65.1  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1065  solute-binding family 5 protein  23.42 
 
 		 530 aa  65.5  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0504  solute-binding family 5 protein  23.42 
 
 		 530 aa  65.5  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1832  extracellular solute-binding protein family 5  26.98 
 
 		 587 aa  65.1  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4787  extracellular solute-binding protein family 5  22.94 
 
 		 532 aa  64.7  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.690041 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4557  extracellular solute-binding protein family 5  24.45 
 
 		 570 aa  64.7  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  23.89 
 
 		 540 aa  64.7  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1483  extracellular solute-binding protein  22.65 
 
 		 542 aa  64.7  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2848  4-phytase  21.73 
 
 		 563 aa  63.5  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.540815  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0135  extracellular solute-binding protein family 5  24.18 
 
 		 531 aa  63.2  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58360  putative binding protein component of ABC transpor  22.24 
 
 		 532 aa  63.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  22.14 
 
 		 516 aa  63.2  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1917  extracellular solute-binding protein  22.11 
 
 		 518 aa  62.4  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3028  twin-arginine translocation pathway signal  21.89 
 
 		 562 aa  62.8  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000374916  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1750  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  22.31 
 
 		 516 aa  62.4  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.843018  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1821  putative peptide transport system substrate-binding protein  22.95 
 
 		 587 aa  62  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0546  4-phytase  21.01 
 
 		 552 aa  62.4  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.633185  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5111  ABC transporter periplasmic binding protein  22.24 
 
 		 532 aa  62  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.914948  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0623  4-phytase  21.01 
 
 		 552 aa  62.4  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000146122  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1410  solute-binding family 5 protein  23.28 
 
 		 530 aa  62.4  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139309  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4041  extracellular solute-binding protein family 5  21.49 
 
 		 543 aa  61.6  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.457031  normal  0.172562 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>