157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0166 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0166  geranylgeranyl reductase  100 
 
 		 453 aa  931    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0681  geranylgeranyl reductase  67.99 
 
 		 453 aa  669    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00166018  hitchhiker  0.00000684168 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1073  geranylgeranyl reductase  35.38 
 
 		 452 aa  299  7e-80  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1347  geranylgeranyl reductase  36 
 
 		 453 aa  298  2e-79  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0129504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1696  geranylgeranyl reductase  38.02 
 
 		 459 aa  290  4e-77  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0938  geranylgeranyl reductase  36.08 
 
 		 453 aa  289  9e-77  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.129052 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0811  geranylgeranyl reductase  34.66 
 
 		 453 aa  271  1e-71  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1514  geranylgeranyl reductase  27.64 
 
 		 485 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00785047 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  30.75 
 
 		 395 aa  136  6.0000000000000005e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0668  geranylgeranyl reductase  26.54 
 
 		 458 aa  122  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.159483  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1523  geranylgeranyl reductase  25.91 
 
 		 495 aa  120  6e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.545892  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  26.21 
 
 		 391 aa  120  7e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1377  geranylgeranyl reductase  26.49 
 
 		 467 aa  119  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1413  geranylgeranyl reductase  26.68 
 
 		 456 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.145276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0881  geranylgeranyl reductase  26.78 
 
 		 455 aa  114  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170951  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2954  geranylgeranyl reductase  25.54 
 
 		 457 aa  114  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3127  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 458 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.541663  normal  0.393865 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2778  geranylgeranyl reductase  25.83 
 
 		 471 aa  107  5e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  27.51 
 
 		 399 aa  101  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  24.59 
 
 		 406 aa  97.4  5e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0431  PUA domain-containing protein  28.7 
 
 		 397 aa  95.1  3e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0506  geranylgeranyl reductase  26.9 
 
 		 398 aa  93.2  9e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  24.11 
 
 		 387 aa  92.8  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1945  geranylgeranyl reductase  27.35 
 
 		 398 aa  92.4  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  22.91 
 
 		 408 aa  89  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  26.4 
 
 		 391 aa  82  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1123  geranylgeranyl reductase  26.28 
 
 		 402 aa  79.7  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  25.95 
 
 		 407 aa  77.8  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  25.84 
 
 		 430 aa  77.8  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  25.99 
 
 		 390 aa  76.3  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  28.57 
 
 		 409 aa  74.7  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  25.67 
 
 		 390 aa  74.3  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  23.65 
 
 		 396 aa  71.2  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  25.75 
 
 		 390 aa  71.6  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  26.1 
 
 		 384 aa  71.2  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  25.93 
 
 		 423 aa  70.1  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  25.65 
 
 		 393 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  25.43 
 
 		 413 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  22.64 
 
 		 425 aa  68.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  27.7 
 
 		 376 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  25.57 
 
 		 393 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  25.27 
 
 		 390 aa  68.2  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0840  monooxygenase FAD-binding  25.07 
 
 		 401 aa  66.6  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.634419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  23.53 
 
 		 375 aa  65.1  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  24.46 
 
 		 365 aa  64.3  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  25.87 
 
 		 400 aa  63.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2206  FAD dependent oxidoreductase  24.15 
 
 		 410 aa  63.2  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.685598 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2717  geranylgeranyl reductase  24.3 
 
 		 443 aa  62.4  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  24.86 
 
 		 435 aa  62.4  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  24.29 
 
 		 418 aa  62.4  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  23.72 
 
 		 402 aa  62.4  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1294  geranylgeranyl reductase  24.93 
 
 		 420 aa  60.8  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.730528  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  23.34 
 
 		 431 aa  60.8  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  24.61 
 
 		 348 aa  60.5  0.00000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3091  FAD dependent oxidoreductase  25.54 
 
 		 410 aa  59.7  0.00000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.275239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2205  geranylgeranyl reductase  23.27 
 
 		 363 aa  58.9  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2826  geranylgeranyl reductase  27.24 
 
 		 443 aa  58.2  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0858816 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1825  FAD dependent oxidoreductase  22.47 
 
 		 455 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133963  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  22.99 
 
 		 424 aa  57.8  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  23.48 
 
 		 434 aa  57  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1955  hypothetical protein  22.71 
 
 		 405 aa  57  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  25.66 
 
 		 430 aa  57  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0313  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  25.27 
 
 		 430 aa  55.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.800751  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  26.61 
 
 		 380 aa  56.2  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  20.82 
 
 		 396 aa  56.2  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000799674  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1027  FAD dependent oxidoreductase  25.54 
 
 		 430 aa  56.2  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  22.37 
 
 		 399 aa  55.5  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  24.2 
 
 		 411 aa  55.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  25.38 
 
 		 394 aa  55.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  23.12 
 
 		 431 aa  54.7  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  25.38 
 
 		 394 aa  55.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1220  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  21.21 
 
 		 378 aa  54.7  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  24.48 
 
 		 421 aa  53.5  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  22.47 
 
 		 445 aa  52.4  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  24.34 
 
 		 423 aa  53.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  23.24 
 
 		 378 aa  52.4  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1330  geranylgeranyl reductase  25.55 
 
 		 376 aa  52.4  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0362  geranylgeranyl reductase  22.13 
 
 		 436 aa  52.4  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.495463  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1774  FAD dependent oxidoreductase  33.04 
 
 		 369 aa  52  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.496071 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  24.32 
 
 		 379 aa  52  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0714  geranylgeranyl reductase  20.94 
 
 		 386 aa  51.2  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  26.13 
 
 		 394 aa  51.6  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6424  geranylgeranyl reductase  23.12 
 
 		 403 aa  51.6  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5969  geranylgeranyl reductase  24.92 
 
 		 409 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.365894  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  23.75 
 
 		 380 aa  51.2  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  22.22 
 
 		 434 aa  50.4  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0810  geranylgeranyl reductase  21.51 
 
 		 384 aa  50.1  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0236364  normal  0.332437 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1653  FAD-binding monooxygenase  24.71 
 
 		 404 aa  50.1  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0114  FAD dependent oxidoreductase  24.2 
 
 		 399 aa  50.1  0.00009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00154267  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0315  tryptophan halogenase  22.26 
 
 		 420 aa  49.7  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4606  tryptophan halogenase  24.23 
 
 		 420 aa  49.7  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0643  geranylgeranyl reductase  21.05 
 
 		 360 aa  49.7  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770726  normal  0.124546 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1304  geranylgeranyl reductase  25.93 
 
 		 400 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  21.6 
 
 		 382 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0926  FAD dependent oxidoreductase  22.71 
 
 		 411 aa  48.5  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.609885  hitchhiker  0.00113671 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3460  geranylgeranyl reductase  22.73 
 
 		 362 aa  48.9  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3712  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 402 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.407055  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3686  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  24.53 
 
 		 553 aa  48.5  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.708418  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  29.91 
 
 		 387 aa  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1429  hypothetical protein  22.64 
 
 		 395 aa  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0716636 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>