More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2765 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  75.32 
 
 
548 aa  804    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  100 
 
 
543 aa  1079    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  48.35 
 
 
548 aa  448  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34970  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  46.64 
 
 
541 aa  405  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134464  normal  0.645084 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22680  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  45.22 
 
 
543 aa  362  8e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1096  Amidohydrolase 3  42.65 
 
 
525 aa  328  1.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  30.76 
 
 
539 aa  280  3e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  35.7 
 
 
541 aa  272  9e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  36.28 
 
 
553 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2329  Amidohydrolase 3  36.66 
 
 
530 aa  265  2e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.108595 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  33.21 
 
 
543 aa  259  9e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  33.09 
 
 
549 aa  253  4.0000000000000004e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  33.39 
 
 
545 aa  253  6e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  33.27 
 
 
546 aa  253  9.000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  32.67 
 
 
543 aa  250  4e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  32.66 
 
 
539 aa  248  2e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  35.57 
 
 
583 aa  243  5e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  32.56 
 
 
564 aa  242  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  30.71 
 
 
556 aa  235  1.0000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  33.76 
 
 
538 aa  230  4e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  31.62 
 
 
520 aa  230  5e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  34.25 
 
 
527 aa  226  1e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  33.95 
 
 
532 aa  219  7e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  31.34 
 
 
557 aa  219  8.999999999999998e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  29.3 
 
 
520 aa  218  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1491  Amidohydrolase 3  34.18 
 
 
537 aa  218  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  33.94 
 
 
549 aa  216  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  35.99 
 
 
537 aa  213  5.999999999999999e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  29.14 
 
 
553 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  29.63 
 
 
550 aa  211  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  32.41 
 
 
530 aa  212  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1793  hypothetical protein  34 
 
 
539 aa  209  1e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  31.54 
 
 
546 aa  209  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4035  Amidohydrolase 3  32.61 
 
 
556 aa  209  1e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787006  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  31.84 
 
 
565 aa  205  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  29.47 
 
 
522 aa  204  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  33.6 
 
 
560 aa  202  9e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  34.99 
 
 
540 aa  202  9.999999999999999e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  29.28 
 
 
522 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  31.49 
 
 
556 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  28.92 
 
 
522 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  29.36 
 
 
533 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  29.1 
 
 
522 aa  201  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  29.1 
 
 
522 aa  201  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  29.28 
 
 
522 aa  201  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4766  amidohydrolase 3  32.37 
 
 
545 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  32.38 
 
 
543 aa  200  6e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  29.4 
 
 
552 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  26.99 
 
 
557 aa  199  1.0000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  27.45 
 
 
522 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  29.04 
 
 
556 aa  197  3e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  28.77 
 
 
522 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  28.55 
 
 
522 aa  197  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  30.16 
 
 
619 aa  196  9e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  32.03 
 
 
584 aa  196  9e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  28.36 
 
 
522 aa  196  9e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  34.07 
 
 
522 aa  194  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  32.43 
 
 
542 aa  194  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  31.33 
 
 
564 aa  193  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  28.23 
 
 
548 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  29.65 
 
 
543 aa  187  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2408  Amidohydrolase 3  32.88 
 
 
520 aa  186  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  31.04 
 
 
575 aa  182  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  31.04 
 
 
575 aa  182  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  27.5 
 
 
574 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  27.74 
 
 
544 aa  178  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3865  Amidohydrolase 3  33.21 
 
 
535 aa  177  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0333  Amidohydrolase 3  26.79 
 
 
526 aa  178  3e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  33.04 
 
 
545 aa  178  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0160  Amidohydrolase 3  33.81 
 
 
512 aa  177  3e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0108  Amidohydrolase 3  31.27 
 
 
547 aa  177  6e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134206  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2396  amidohydrolase 3  33.27 
 
 
565 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1932  amidohydrolase 3  27.73 
 
 
522 aa  175  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  29.57 
 
 
583 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2050  Amidohydrolase 3  33.45 
 
 
536 aa  174  5e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  28.15 
 
 
540 aa  174  5e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0032  Amidohydrolase 3  26.91 
 
 
527 aa  173  7.999999999999999e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1844  amidohydrolase 3  33 
 
 
554 aa  173  9e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0501  Amidohydrolase 3  30.3 
 
 
537 aa  172  1e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00372928  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0134  amidohydrolase-like  32.2 
 
 
547 aa  171  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.900918  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2185  Amidohydrolase 3  27.11 
 
 
563 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2928  Amidohydrolase 3  31.07 
 
 
562 aa  167  5e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.548866  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  28.99 
 
 
541 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2120  Amidohydrolase 3  34.73 
 
 
536 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0885752  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  31.48 
 
 
537 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0654  Amidohydrolase 3  31.94 
 
 
540 aa  164  3e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.214598 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  32.41 
 
 
539 aa  164  6e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1274  amidohydrolase 3  29.8 
 
 
658 aa  163  6e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  30.16 
 
 
569 aa  162  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3458  hypothetical protein  31.57 
 
 
601 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55725  normal  0.0698709 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  28.86 
 
 
563 aa  161  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  30.84 
 
 
544 aa  160  4e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  30.63 
 
 
579 aa  160  5e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3346  amidohydrolase family  27.16 
 
 
568 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4359  Amidohydrolase 3  28.29 
 
 
552 aa  159  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.747715 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1693  hypothetical protein  29.94 
 
 
533 aa  159  1e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2742  hypothetical protein  28.52 
 
 
531 aa  158  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.166091  hitchhiker  0.000567669 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7627  amidohydrolase-like  29.46 
 
 
555 aa  159  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.137819 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5757  amidohydrolase:amidohydrolase-like  31.28 
 
 
547 aa  157  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1810  amidohydrolase 3  34.18 
 
 
532 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.295245  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>