More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1446 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1446  response regulator receiver protein  100 
 
 		 209 aa  409  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0167897  normal  0.0778626 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  58.65 
 
 		 227 aa  231  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0553  response regulator receiver protein  60.95 
 
 		 213 aa  229  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1532  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.37 
 
 		 220 aa  212  2.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0114765  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1435  two component LuxR family transcriptional regulator  50.48 
 
 		 218 aa  202  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5375  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.19 
 
 		 218 aa  200  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3409  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.7 
 
 		 221 aa  195  3e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000306896  hitchhiker  0.000114505 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3835  two component LuxR family transcriptional regulator  50.96 
 
 		 217 aa  191  9e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.760782  normal  0.0940778 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.86 
 
 		 222 aa  175  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4902  response regulator receiver  44.08 
 
 		 216 aa  174  8e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.443208  normal  0.676579 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.54 
 
 		 241 aa  173  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.5 
 
 		 216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2037  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.33 
 
 		 225 aa  172  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 219 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.7 
 
 		 220 aa  171  7.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 216 aa  170  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3326  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.21 
 
 		 223 aa  169  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.14 
 
 		 226 aa  169  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4064  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.89 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 216 aa  169  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.08 
 
 		 217 aa  169  4e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0315  two component LuxR family transcriptional regulator  43.13 
 
 		 214 aa  168  4e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0084678 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.54 
 
 		 224 aa  168  5e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.33 
 
 		 217 aa  167  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1929  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.87 
 
 		 209 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  44.02 
 
 		 207 aa  164  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1998  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.66 
 
 		 225 aa  164  8e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.12496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00210  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  43.72 
 
 		 221 aa  164  8e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.133182 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1099  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.59 
 
 		 213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  45.54 
 
 		 220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3249  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.78 
 
 		 211 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.558116 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04459  two-component system regulatory protein  42.13 
 
 		 213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8793  response regulator receiver protein  44.65 
 
 		 221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1071  two component LuxR family transcriptional regulator  45.93 
 
 		 209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1051  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.71 
 
 		 211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1198  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.86 
 
 		 225 aa  162  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3519  response regulator receiver protein  45.93 
 
 		 220 aa  162  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0074  response regulator receiver protein  46.15 
 
 		 207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4132  response regulator receiver  40.65 
 
 		 235 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 223 aa  162  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2171  two component LuxR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 218 aa  162  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0762379  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  42.08 
 
 		 226 aa  161  5.0000000000000005e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0480  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.54 
 
 		 214 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.29 
 
 		 222 aa  161  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25060  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  43.72 
 
 		 222 aa  161  6e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.444591  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  41.04 
 
 		 215 aa  161  7e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4946  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.12 
 
 		 224 aa  160  9e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2656  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.98 
 
 		 226 aa  160  9e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.04 
 
 		 228 aa  160  9e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  41.04 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  41.04 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  41.04 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  41.04 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1523  response regulator receiver protein  42.99 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.0152488 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0938  two component LuxR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 242 aa  160  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  41.04 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0102  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.46 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0637251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 222 aa  160  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  41.04 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.38 
 
 		 213 aa  160  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.86 
 
 		 216 aa  159  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1346  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.27 
 
 		 236 aa  159  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.361751  hitchhiker  0.00000337078 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  40.09 
 
 		 215 aa  159  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1049  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.58 
 
 		 222 aa  159  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.661499  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1030  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.34 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1984  two component LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 220 aa  159  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.123783 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 213 aa  159  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1403  LuxR response regulator receiver  43.26 
 
 		 214 aa  159  4e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.676683  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 212 aa  159  4e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0717  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.23 
 
 		 209 aa  158  4e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.854815  normal  0.189113 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2943  two component LuxR family transcriptional regulator  44.66 
 
 		 215 aa  159  4e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1579  two component LuxR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 242 aa  159  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.72 
 
 		 224 aa  158  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2293  LuxR family DNA-binding response regulator  41.83 
 
 		 211 aa  158  5e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26840  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  41.59 
 
 		 239 aa  158  6e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274056  normal  0.228776 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8243  response regulator receiver protein  43.81 
 
 		 217 aa  158  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.931194  normal  0.230681 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  40.09 
 
 		 215 aa  158  6e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4922  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.02 
 
 		 206 aa  158  6e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0302523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2245  DNA-binding response regulator, LuxR family  42.03 
 
 		 213 aa  158  6e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.19 
 
 		 225 aa  157  8e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1321  response regulator  37.75 
 
 		 210 aa  157  8e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000332221  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1940  LuxR response regulator receiver  42.58 
 
 		 222 aa  157  9e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.95717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 221 aa  157  9e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  41.63 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1311  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.5 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.165019  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3601  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.37 
 
 		 222 aa  157  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.324048  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  42.72 
 
 		 221 aa  156  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  41.9 
 
 		 242 aa  156  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.71 
 
 		 210 aa  156  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11600  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  45.33 
 
 		 225 aa  156  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00120804  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 215 aa  156  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.64 
 
 		 226 aa  157  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  44.98 
 
 		 213 aa  156  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 237 aa  156  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  41.9 
 
 		 218 aa  156  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  42.4 
 
 		 226 aa  155  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3262  two component LuxR family transcriptional regulator  42.79 
 
 		 222 aa  155  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.764026 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1971  two component LuxR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 216 aa  155  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.356635  normal  0.773651 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3849  DNA-binding response regulator  37.25 
 
 		 210 aa  155  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000308683  hitchhiker  0.000000000350245 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>