More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0628 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0628  transcriptional regulator protein  100 
 
 		 207 aa  394  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0311  GntR family transcriptional regulator  71.43 
 
 		 202 aa  251  7e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2935  transcriptional regulator, GntR family  47.62 
 
 		 223 aa  142  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000424024  hitchhiker  0.000467948 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4755  transcriptional regulator, GntR family  39.41 
 
 		 227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3559  transcriptional regulator, GntR family  38.19 
 
 		 232 aa  102  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.925316 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4143  GntR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 230 aa  102  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0561  transcriptional regulator, GntR family  34.78 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.818378 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2145  transcriptional regulator, GntR family  36.14 
 
 		 254 aa  96.3  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1913  transcriptional regulator, GntR family  34.65 
 
 		 223 aa  93.6  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 217 aa  93.2  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1095  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 253 aa  88.2  7e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5625  transcriptional regulator, GntR family  35.68 
 
 		 240 aa  87.8  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.489538  decreased coverage  0.00304331 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  33.82 
 
 		 233 aa  85.9  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 229 aa  85.5  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 242 aa  84.7  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2681  transcriptional regulator, GntR family  35.18 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 242 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1538  transcriptional regulator, GntR family  33.51 
 
 		 242 aa  82  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0494418 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2008  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 232 aa  80.9  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3215  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 224 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5228  transcriptional regulator, GntR family  29.38 
 
 		 262 aa  78.6  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6337  GntR domain-containing protein  36.74 
 
 		 226 aa  78.6  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0092025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  31.07 
 
 		 223 aa  78.2  0.00000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4083  GntR domain protein  31.18 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2798  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  24.39 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3469  transcriptional regulator, GntR family  41.46 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5027  transcriptional regulator, GntR family  33.93 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  34.01 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2549  GntR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000803432  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5984  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0745493  normal  0.107513 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3515  GntR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.715745  normal  0.6161 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1964  transcriptional regulator, GntR family  33.84 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.117742 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3350  transcriptional regulator, GntR family  29.84 
 
 		 234 aa  72  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.398966  normal  0.021988 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2531  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 242 aa  72  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3144  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 242 aa  72  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0537  transcriptional regulator, GntR family  35.84 
 
 		 245 aa  72  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0745569  normal  0.0258493 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6120  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  normal  0.0219652 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2490  transcriptional regulator, GntR family  32.14 
 
 		 240 aa  71.6  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 230 aa  71.2  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5342  transcriptional regulator, GntR family  32.83 
 
 		 233 aa  71.2  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.912563 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 262 aa  71.2  0.000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2643  GntR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.577807 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 265 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3541  GntR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4855  GntR domain-containing protein  32.83 
 
 		 233 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5376  transcriptional regulator, GntR family  31.71 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0423654  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0495  transcriptional regulator GntR  33.95 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3295  transcriptional regulator, GntR family  32.08 
 
 		 232 aa  70.1  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0318  GntR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4989  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0874  GntR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.366821  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3219  GntR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0764465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  34.27 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3518  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0673  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.990367 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1313  regulatory protein GntR, HTH  33.33 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.568761  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  29.13 
 
 		 258 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  41 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1252  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.148319  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 262 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 262 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4090  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 224 aa  67  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2447  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 222 aa  67  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3560  transcriptional regulator, GntR family  33.73 
 
 		 236 aa  67  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.798269  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  34.25 
 
 		 238 aa  67  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2536  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 242 aa  67  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00251581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 222 aa  67  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 255 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  32.11 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3422  GntR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 255 aa  67  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  32.85 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3301  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4345  GntR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08590  transcriptional regulator  33.17 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.713725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2079  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.420159  normal  0.766393 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 267 aa  65.9  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6333  transcriptional regulator, GntR family  28.23 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  29.91 
 
 		 239 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5853  transcriptional regulator GntR family  31.54 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110749  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4086  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297751  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>