97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0072 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0072  hypothetical protein  100 
 
 
380 aa  729    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484765  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2581  hypothetical protein  55.17 
 
 
388 aa  382  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.365833  normal  0.0605789 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0719  protein of unknown function DUF418  52.3 
 
 
405 aa  290  3e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.699875  normal  0.0836204 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8135  hypothetical protein  46.56 
 
 
397 aa  259  6e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026592  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3529  protein of unknown function DUF418  45.5 
 
 
398 aa  246  6e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.296308  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4741  hypothetical protein  44.65 
 
 
392 aa  226  5.0000000000000005e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.400946  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0622  hypothetical protein  42.5 
 
 
439 aa  212  9e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1668  protein of unknown function DUF418  40.56 
 
 
420 aa  209  5e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620816  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4293  protein of unknown function DUF418  43.68 
 
 
390 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1670  hypothetical protein  38.94 
 
 
405 aa  189  5.999999999999999e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.704713  normal  0.19338 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1063  protein of unknown function DUF405  40.41 
 
 
472 aa  189  8e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1416  protein of unknown function DUF405  39.74 
 
 
407 aa  188  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.548338  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3111  protein of unknown function DUF418  43.61 
 
 
443 aa  186  5e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414343  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3607  protein of unknown function DUF418  40.81 
 
 
407 aa  186  8e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.526186  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3780  hypothetical protein  38.42 
 
 
401 aa  184  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.769148 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1415  protein of unknown function DUF405  40.31 
 
 
399 aa  180  4e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.845184  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15990  predicted membrane protein  41.29 
 
 
414 aa  180  4e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.76161  normal  0.230384 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4159  hypothetical protein  39.75 
 
 
401 aa  179  5.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.776458  decreased coverage  0.000152397 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1461  hypothetical protein  39.45 
 
 
401 aa  176  5e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586682  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0035  hypothetical protein  39.22 
 
 
402 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2152  hypothetical protein  36.03 
 
 
393 aa  171  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.391046 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0984  protein of unknown function DUF418  40.21 
 
 
387 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0392587  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0505  protein of unknown function DUF418  37.69 
 
 
407 aa  160  4e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000344824 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24880  predicted membrane protein  38.1 
 
 
432 aa  158  1e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0615892  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1236  hypothetical protein  36.22 
 
 
399 aa  156  7e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1078  protein of unknown function DUF418  37.07 
 
 
384 aa  149  8e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07880  predicted membrane protein  36.88 
 
 
407 aa  126  5e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4423  hypothetical protein  27.8 
 
 
417 aa  89.7  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00407884  normal  0.808497 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4097  hypothetical protein  26.47 
 
 
399 aa  86.7  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2066  protein of unknown function DUF418  25.32 
 
 
404 aa  82.8  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0837783  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4804  transmembrane protein  23.16 
 
 
312 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000142062  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0455  hypothetical protein  25.8 
 
 
415 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.222068  hitchhiker  0.00425561 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5273  hypothetical protein  22.62 
 
 
312 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2799  hypothetical protein  26.87 
 
 
414 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1608  hypothetical protein  27.43 
 
 
430 aa  74.7  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0190  hypothetical protein  28.2 
 
 
428 aa  73.6  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.55784  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2752  hypothetical protein  27.64 
 
 
385 aa  73.6  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.915358  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1661  transport protein  26.7 
 
 
430 aa  73.6  0.000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.414626  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2882  hypothetical protein  26.87 
 
 
414 aa  72  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2840  hypothetical protein  30.03 
 
 
414 aa  71.6  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.110654 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3078  hypothetical protein  25.72 
 
 
411 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3087  hypothetical protein  25.43 
 
 
411 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30910  predicted membrane protein  30.63 
 
 
392 aa  69.3  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3230  hypothetical protein  25.43 
 
 
411 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2978  hypothetical protein  26.15 
 
 
414 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1289  protein of unknown function DUF405  25.43 
 
 
401 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.34904 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3043  hypothetical protein  25.65 
 
 
382 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1396  hypothetical protein  26.63 
 
 
399 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0683  protein of unknown function DUF405  24.24 
 
 
387 aa  67  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2327  hypothetical protein  31.06 
 
 
388 aa  66.2  0.0000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2885  protein of unknown function DUF405  27.7 
 
 
414 aa  63.9  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.802913  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1119  protein of unknown function DUF405  28.43 
 
 
381 aa  63.5  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0820  hypothetical protein  28.8 
 
 
365 aa  63.2  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1203  hypothetical protein  25.99 
 
 
398 aa  62.8  0.000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2290  protein of unknown function DUF405  24.93 
 
 
391 aa  61.6  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.578329  normal  0.0235381 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2355  protein of unknown function DUF405  30.42 
 
 
364 aa  60.5  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4881  hypothetical protein  21.72 
 
 
390 aa  60.5  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00420784  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00200  predicted membrane protein  28.13 
 
 
397 aa  60.5  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.220914 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0045  hypothetical protein  21.99 
 
 
389 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000457904  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0746  protein of unknown function DUF405  31.11 
 
 
204 aa  58.5  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.685935 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0285  protein of unknown function DUF418  23.91 
 
 
409 aa  58.5  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1942  hypothetical protein  24.04 
 
 
391 aa  57.8  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.235403  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1171  protein of unknown function DUF418  26.67 
 
 
394 aa  57.8  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0117  membrane protein  23.08 
 
 
381 aa  57  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000725343  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0775  hypothetical protein  24.2 
 
 
401 aa  56.2  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0095945  normal  0.285929 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3571  protein of unknown function DUF418  26.84 
 
 
405 aa  56.2  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.983337  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2404  hypothetical protein  33.83 
 
 
382 aa  52.8  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.334101  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3565  protein of unknown function DUF418  32.35 
 
 
431 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.708888  normal  0.443247 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0015  hypothetical protein  22.83 
 
 
381 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.428508  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2115  protein of unknown function DUF418  21.11 
 
 
412 aa  51.2  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1561  hypothetical protein  33.06 
 
 
393 aa  51.2  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3566  protein of unknown function DUF418  28.48 
 
 
459 aa  50.1  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.726105 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2305  hypothetical protein  25.64 
 
 
391 aa  49.3  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1066  hypothetical protein  29.6 
 
 
401 aa  49.3  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1818  hypothetical protein  24.79 
 
 
415 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3067  hypothetical protein  28.25 
 
 
404 aa  48.5  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1198  hypothetical protein  25.17 
 
 
399 aa  48.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0179  hypothetical protein  23.15 
 
 
381 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000571802  hitchhiker  1.74871e-35 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2447  hypothetical protein  32.09 
 
 
385 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2299  hypothetical protein  32.61 
 
 
385 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383736 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1671  hypothetical protein  28.68 
 
 
395 aa  46.6  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219787  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0252  protein of unknown function DUF405  29.38 
 
 
410 aa  46.2  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.680617 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01909  transport protein  33.33 
 
 
409 aa  46.2  0.0009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.694528  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02081  conserved inner membrane protein  32.61 
 
 
385 aa  45.8  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.452541  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4860  hypothetical protein  27.75 
 
 
387 aa  45.8  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138362  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2286  hypothetical protein  32.61 
 
 
385 aa  46.2  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1496  hypothetical protein  32.61 
 
 
385 aa  45.8  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0814  hypothetical protein  32.61 
 
 
385 aa  45.8  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3286  hypothetical protein  32.61 
 
 
385 aa  45.8  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.385085  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1506  protein of unknown function DUF418  32.61 
 
 
385 aa  45.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.253618  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3717  hypothetical protein  23.1 
 
 
387 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2541  hypothetical protein  29.73 
 
 
380 aa  43.5  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0379465  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2338  hypothetical protein  29.73 
 
 
380 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.890901  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2427  hypothetical protein  29.73 
 
 
380 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.901091 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2383  hypothetical protein  29.73 
 
 
380 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.76362 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2201  hypothetical protein  29.81 
 
 
416 aa  43.1  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.964455  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0691  hypothetical protein  26.57 
 
 
381 aa  42.7  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>