More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3152 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  100 
 
 
260 aa  535  1e-151  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  5.93074e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  77.08 
 
 
265 aa  412  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  2.16134e-08 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  76.47 
 
 
264 aa  412  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  75.1 
 
 
265 aa  394  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  8.04744e-07  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  59.16 
 
 
270 aa  323  1e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2872  rare lipoprotein A  58.16 
 
 
281 aa  323  2e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  2.32155e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3456  rare lipoprotein A  55.76 
 
 
277 aa  318  7e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  9.68437e-06  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3278  rare lipoprotein A  56.12 
 
 
277 aa  318  7e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  3.96769e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1089  rare lipoprotein A  55.76 
 
 
277 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  4.93551e-07  hitchhiker  7.47193e-06 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1053  rare lipoprotein A  56.12 
 
 
280 aa  316  2e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  5.68388e-07  hitchhiker  0.00641376 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0988  rare lipoprotein A  56.12 
 
 
280 aa  316  2e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  3.65675e-09  normal  0.010381 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3320  rare lipoprotein A  55.76 
 
 
277 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.03615e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0992  rare lipoprotein A  62.08 
 
 
280 aa  314  7e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  2.57721e-07  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  54.68 
 
 
297 aa  313  2e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  5.69682e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1165  rare lipoprotein A  61.67 
 
 
283 aa  310  1e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  56.23 
 
 
278 aa  304  1e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  54.29 
 
 
263 aa  264  9e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  4.20345e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  51.33 
 
 
267 aa  262  4e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  3.35471e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  50 
 
 
260 aa  254  1e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  49.05 
 
 
267 aa  251  7e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  47.52 
 
 
293 aa  247  2e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0983  rare lipoprotein A  49.17 
 
 
269 aa  242  4e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  46.13 
 
 
322 aa  241  7e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  46.04 
 
 
311 aa  226  3e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  9.26657e-06  hitchhiker  4.3303e-06 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  42.02 
 
 
321 aa  224  8e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  3.68198e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1548  rare lipoprotein A  42.18 
 
 
290 aa  218  7e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2411  rare lipoprotein A  41.22 
 
 
295 aa  204  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  44.21 
 
 
285 aa  203  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  39.8 
 
 
297 aa  199  3e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  2.4991e-05  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  43.51 
 
 
324 aa  194  1e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  50 
 
 
323 aa  187  1e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1518  hypothetical protein  44.64 
 
 
273 aa  186  3e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  44.7 
 
 
286 aa  186  3e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1465  hypothetical protein  44.21 
 
 
273 aa  182  3e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2496  rare lipoprotein A  38.33 
 
 
310 aa  176  4e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  46.52 
 
 
342 aa  175  7e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1386  rare lipoprotein A  57.04 
 
 
415 aa  175  7e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.166682  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1316  rare lipoprotein A  57.04 
 
 
417 aa  175  8e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250086  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2633  rare lipoprotein A  40.99 
 
 
257 aa  174  1e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  46.09 
 
 
342 aa  173  3e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  59.46 
 
 
325 aa  171  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1060  rare lipoprotein A  38.04 
 
 
265 aa  170  2e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0952  rare lipoprotein A family protein  38.25 
 
 
261 aa  169  3e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  41.55 
 
 
243 aa  170  3e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  58.45 
 
 
341 aa  169  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  51.35 
 
 
335 aa  169  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3447  rare lipoprotein A  52.73 
 
 
423 aa  167  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.340294 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  51.32 
 
 
333 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  57.75 
 
 
342 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  42.72 
 
 
259 aa  166  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  57.72 
 
 
332 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1268  rare lipoprotein A  34.64 
 
 
284 aa  165  5e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  57.72 
 
 
333 aa  165  6e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  50.26 
 
 
333 aa  165  8e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  57.04 
 
 
337 aa  162  4e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  40.81 
 
 
246 aa  162  6e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0111  rare lipoprotein A  35.64 
 
 
333 aa  160  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04283  rare lipoprotein A  44.22 
 
 
471 aa  159  4e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5161  rare lipoprotein A  50 
 
 
391 aa  159  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1011  rare lipoprotein A  50 
 
 
352 aa  156  3e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0315  rare lipoprotein A  44.02 
 
 
394 aa  156  3e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3528  putative lipoprotein  49.66 
 
 
331 aa  154  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.257959 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1244  rare lipoprotein A  50.37 
 
 
409 aa  152  4e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.069168 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2968  rare lipoprotein A  49.11 
 
 
258 aa  150  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  50.75 
 
 
381 aa  149  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  37.4 
 
 
254 aa  149  4e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  39.62 
 
 
238 aa  147  1e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  36.99 
 
 
249 aa  145  5e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  56.69 
 
 
270 aa  145  6e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0662  rare lipoprotein A  38.22 
 
 
264 aa  145  7e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1988  drug/metabolite exporter (DME) family protein  62.16 
 
 
286 aa  145  9e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0655  rare lipoprotein A  48.6 
 
 
279 aa  143  3e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0270867  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  34.82 
 
 
282 aa  142  5e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2701  rare lipoprotein A  45.4 
 
 
312 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3152  rare lipoprotein A  41.67 
 
 
370 aa  142  7e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00554597  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4106  hypothetical protein  45.98 
 
 
283 aa  141  9e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322542  normal  0.202617 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3390  rare lipoprotein A  51.67 
 
 
474 aa  141  9e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.728179 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1179  rare lipoprotein A  41.9 
 
 
375 aa  141  1e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00815633  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3699  rare lipoprotein A  51.67 
 
 
455 aa  141  1e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2012  rare lipoprotein A  43.59 
 
 
312 aa  140  2e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127741  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3581  rare lipoprotein A  51.67 
 
 
468 aa  140  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0743436  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  36.07 
 
 
259 aa  140  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2712  rare lipoprotein A  42.21 
 
 
314 aa  139  4e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.824805 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2153  rare lipoprotein A  52.71 
 
 
382 aa  139  4e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1081  rare lipoprotein A  46.82 
 
 
270 aa  139  4e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.95704  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2322  rare lipoprotein A  33.58 
 
 
255 aa  139  4e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.260351  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3111  rare lipoprotein A  45.18 
 
 
315 aa  139  5e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  34.8 
 
 
249 aa  139  5e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2676  rare lipoprotein A  45.45 
 
 
314 aa  138  8e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.36166  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  54.14 
 
 
275 aa  137  2e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  54.14 
 
 
275 aa  137  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  54.14 
 
 
266 aa  137  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1466  rare lipoprotein A  46.47 
 
 
279 aa  136  3e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  39.81 
 
 
322 aa  136  4e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1506  rare lipoprotein A  50 
 
 
442 aa  135  7e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0428333  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4323  rare lipoprotein A  52.42 
 
 
314 aa  135  9e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6276  rare lipoprotein A  46.51 
 
 
394 aa  134  1e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.314639 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3341  putative lipoprotein  50.41 
 
 
230 aa  134  2e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0362998  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  58.41 
 
 
239 aa  133  3e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2966  rare lipoprotein A  38.37 
 
 
381 aa  132  4e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.508447  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>