More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3430 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3430  pteridine reductase  100 
 
 
245 aa  496  1e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.425485  decreased coverage  0.00917749 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0800  pteridine reductase  61.22 
 
 
245 aa  308  4e-83  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0711  pteridine reductase  60.82 
 
 
245 aa  306  2.0000000000000002e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04308  pteridine reductase  63.67 
 
 
260 aa  298  4e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0336  pteridine reductase  49.79 
 
 
246 aa  244  6e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0229  pteridine reductase  48.56 
 
 
250 aa  238  8e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.597283 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2986  pteridine reductase  50.84 
 
 
251 aa  232  3e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02487  pteridine reductase  45.9 
 
 
249 aa  231  1e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0328  pteridine reductase  49.16 
 
 
252 aa  228  7e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0726  pteridine reductase  46.53 
 
 
246 aa  227  1e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.47 
 
 
247 aa  223  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2701  pteridine reductase  46.44 
 
 
246 aa  219  3e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.685419  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1369  pteridine reductase  44.66 
 
 
267 aa  212  2.9999999999999995e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000175176  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2265  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.11 
 
 
245 aa  211  7e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00032435  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.21 
 
 
246 aa  206  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0129  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  45.12 
 
 
246 aa  205  4e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.933318  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.12 
 
 
246 aa  205  4e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000612243 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0995  pteridine reductase  44.35 
 
 
267 aa  205  5e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0277156  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2921  pteridine reductase  43.98 
 
 
259 aa  195  5.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2775  pteridine reductase  43.98 
 
 
259 aa  194  1e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.98 
 
 
253 aa  192  4e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.317588 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0696  pteridine reductase  45.71 
 
 
255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.454716  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1764  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.71 
 
 
252 aa  171  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.749088  normal  0.0259189 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2919  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.6 
 
 
237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.82 
 
 
248 aa  151  8e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0985311  hitchhiker  0.000033531 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
264 aa  151  8e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.67622  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1660  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.08 
 
 
367 aa  149  5e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.75 
 
 
242 aa  146  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.605305  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2697  putative short-chain type dehydrogenase/reductase  41.37 
 
 
247 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0752  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.98 
 
 
241 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3477  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.72 
 
 
233 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.89 
 
 
233 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.39 
 
 
251 aa  137  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3561  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.3 
 
 
233 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.888825  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0924  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.981045  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.78 
 
 
255 aa  135  4e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0742579  normal  0.257249 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3588  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.25 
 
 
235 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143564 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1863  glucose 1-dehydrogenase  35.46 
 
 
269 aa  134  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0103  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.98 
 
 
270 aa  134  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000861363 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.1 
 
 
245 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200768  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2218  short chain dehydrogenase  40.34 
 
 
268 aa  133  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.43112  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 
246 aa  132  3.9999999999999996e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0163129  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0052  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.94 
 
 
267 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0063  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.94 
 
 
267 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.233488  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.94 
 
 
267 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1548  pteridine reductase 1  41.94 
 
 
267 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3155  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.92 
 
 
249 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1195  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.94 
 
 
267 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.350594  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1479  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.94 
 
 
267 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
257 aa  132  3.9999999999999996e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02553  hypothetical protein  36.21 
 
 
244 aa  132  5e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.86 
 
 
246 aa  132  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1465  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.18 
 
 
290 aa  132  6e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3759  oxidoreductase  37.94 
 
 
257 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.108381  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.11 
 
 
266 aa  132  6.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1536  oxidoreductase  37.16 
 
 
257 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.328678 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.75 
 
 
250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.13 
 
 
263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4257  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.23 
 
 
262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2002  oxidoreductase  37.55 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.193457  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 
255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 
260 aa  129  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.071685 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.87 
 
 
249 aa  130  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0050  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.34 
 
 
267 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2577  short chain dehydrogenase  37.76 
 
 
240 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.126054  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.18 
 
 
245 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0050  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.18 
 
 
245 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.795595  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 
246 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.41824  normal  0.505447 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.27 
 
 
255 aa  129  5.0000000000000004e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1228  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.98 
 
 
272 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.178031  hitchhiker  0.00135629 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1904  oxidoreductase  38.37 
 
 
255 aa  129  6e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
262 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3274  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.11 
 
 
273 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.68 
 
 
246 aa  128  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.596846  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2698  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 
253 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16282  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 
255 aa  128  9.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.41021  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1670  oxidoreductase  37.15 
 
 
272 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0171077  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 
255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0228145  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6322  putative short-chain dehydrogenase  38.08 
 
 
252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72840  putative short-chain dehydrogenase  38.08 
 
 
252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118155  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.67 
 
 
262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.11 
 
 
279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229534  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.5 
 
 
248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5132  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.717411  normal  0.457646 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1577  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.839848  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1250  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 
261 aa  126  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.22 
 
 
263 aa  126  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2036  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
258 aa  126  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1563  oxidoreductase  36.8 
 
 
257 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.256146 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 
262 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2903  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.57 
 
 
273 aa  125  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.412046  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.06 
 
 
248 aa  125  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3414  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 
247 aa  125  8.000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.46 
 
 
263 aa  124  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2270  short chain dehydrogenase  37.5 
 
 
240 aa  124  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0552  putative oxidoreductase protein  40.49 
 
 
259 aa  124  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.404038 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1004  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.71 
 
 
234 aa  124  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.159825  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3809  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  36.8 
 
 
241 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.998121  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0264  putative short-chain dehydrogenase  38.96 
 
 
262 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>