More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0982 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0982  ABC transporter related protein  100 
 
 		 220 aa  438  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.452379 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2735  ABC transporter related  67.13 
 
 		 223 aa  286  1e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.31749  normal  0.728727 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0759  hypothetical protein  62.67 
 
 		 231 aa  281  4.0000000000000003e-75  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08621  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  64.32 
 
 		 222 aa  280  1e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3012  ABC transporter related  59.53 
 
 		 217 aa  276  2e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.134737 
 
 
-
 
NC_002950  PG1692  ABC transporter, ATP-binding protein  59.91 
 
 		 219 aa  273  1.0000000000000001e-72  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.623229 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2233  ABC-type lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  63.5 
 
 		 201 aa  272  3e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.991286 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0341  ABC transporter related  59.26 
 
 		 226 aa  270  1e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6890  ABC transporter related  61.03 
 
 		 226 aa  268  4e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0759  ABC transporter related  52.02 
 
 		 230 aa  242  3e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0004925  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2358  ABC transporter-related protein  54.55 
 
 		 225 aa  242  3e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.816057 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  52.73 
 
 		 224 aa  242  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  51.82 
 
 		 224 aa  240  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1796  ABC transporter related protein  58.18 
 
 		 229 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1577  ABC transporter related  55.61 
 
 		 226 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.039457 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2269  ABC transporter, ATP-binding protein  50.91 
 
 		 224 aa  230  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.96 
 
 		 233 aa  226  3e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.03 
 
 		 238 aa  225  4e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.82 
 
 		 239 aa  224  6e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3016  ABC transporter related  50.9 
 
 		 227 aa  224  8e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3973  ABC transporter related protein  55.22 
 
 		 275 aa  224  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1677  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52 
 
 		 233 aa  223  2e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000705959  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3238  ABC transporter related  49.55 
 
 		 223 aa  223  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0758948  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2258  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  46.58 
 
 		 230 aa  222  3e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3744  ABC transporter related  54.19 
 
 		 230 aa  221  4.9999999999999996e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.319618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2286  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.66 
 
 		 253 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00104581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1333  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  47.96 
 
 		 229 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0369942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1480  ATPase  50 
 
 		 235 aa  219  1.9999999999999999e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1733  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.66 
 
 		 253 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000305672  normal  0.724903 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1813  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.66 
 
 		 253 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0357978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0860  ABC transporter-related protein  52.17 
 
 		 228 aa  219  3e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0674344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2830  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.91 
 
 		 231 aa  218  3.9999999999999997e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0931795  normal  0.0149457 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2845  ABC transporter-related protein  53.96 
 
 		 246 aa  218  5e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.66 
 
 		 231 aa  217  1e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.263413  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  51.58 
 
 		 715 aa  217  1e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1685  ABC transporter related  52.44 
 
 		 237 aa  217  1e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000384234  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1810  putative ATP-binding component of ABC transporter  46.15 
 
 		 228 aa  214  5.9999999999999996e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.512088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  47.95 
 
 		 223 aa  214  9e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3219  ABC transporter, ATP-binding protein  47.51 
 
 		 248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.568851  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2670  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.77 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1866  ABC transporter related  50.67 
 
 		 231 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02358  ABC transporter ATP-binding subunit  46.73 
 
 		 242 aa  213  2.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000106167  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  49.11 
 
 		 646 aa  212  2.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  49.1 
 
 		 226 aa  212  2.9999999999999995e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2202  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.12 
 
 		 227 aa  212  3.9999999999999995e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.15426 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  51.82 
 
 		 648 aa  211  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  51.82 
 
 		 648 aa  211  5.999999999999999e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  51.82 
 
 		 648 aa  211  5.999999999999999e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1250  putative ATP-binding component of a transport system  53.03 
 
 		 227 aa  211  5.999999999999999e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.40949e-21  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  51.82 
 
 		 648 aa  211  7e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  51.82 
 
 		 648 aa  211  7e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2392  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.66 
 
 		 231 aa  211  7e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000179176  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2450  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  51.82 
 
 		 648 aa  211  7e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0569677  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  51.82 
 
 		 648 aa  211  7e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2508  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.66 
 
 		 231 aa  211  7e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.214498  normal  0.0731118 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1955  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.66 
 
 		 231 aa  211  7e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00212141  normal  0.0513198 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  51.82 
 
 		 648 aa  211  7e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2403  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.66 
 
 		 231 aa  211  7e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.017802  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003991  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  47.75 
 
 		 235 aa  210  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1366  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51 
 
 		 230 aa  210  1e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  48.4 
 
 		 225 aa  209  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01531  hypothetical protein  47.3 
 
 		 235 aa  209  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  49.11 
 
 		 224 aa  209  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0264  ATPase  50.25 
 
 		 246 aa  209  3e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  48.67 
 
 		 657 aa  209  3e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  46.15 
 
 		 238 aa  208  4e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  49.32 
 
 		 234 aa  208  4e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0473  ABC transporter related  47.76 
 
 		 238 aa  209  4e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0481  ABC transporter related  49.25 
 
 		 241 aa  208  5e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1701  ATPase  49.25 
 
 		 240 aa  208  6e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.620814 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1814  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.81 
 
 		 236 aa  208  6e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0451036  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2847  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.8 
 
 		 227 aa  208  7e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0355331  normal  0.014272 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  48.64 
 
 		 234 aa  207  8e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  48.64 
 
 		 234 aa  207  8e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2361  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.05 
 
 		 227 aa  207  9e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0014315  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2018  ABC transporter related  48.26 
 
 		 238 aa  207  1e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  47.37 
 
 		 227 aa  206  2e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0979  ATPase  56.1 
 
 		 241 aa  206  2e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.103912  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1564  ABC transporter related protein  47.98 
 
 		 226 aa  206  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0461  ABC transporter-related protein  47.87 
 
 		 227 aa  206  3e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.880159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  46.15 
 
 		 240 aa  205  4e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  49.09 
 
 		 648 aa  204  6e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1473  ABC transporter, ATP-binding protein  45.5 
 
 		 228 aa  204  8e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0769  ABC transporter related  50.23 
 
 		 650 aa  203  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  48.86 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0483  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein LolD  48.51 
 
 		 231 aa  204  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0642  ABC transporter related  48.51 
 
 		 231 aa  204  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  47.06 
 
 		 653 aa  203  2e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2508  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.36 
 
 		 225 aa  203  2e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711904  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  48.43 
 
 		 682 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00596  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.76 
 
 		 236 aa  202  3e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.820221  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  45.21 
 
 		 222 aa  202  3e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  48.39 
 
 		 247 aa  202  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1377  ABC transporter related  48.86 
 
 		 229 aa  202  3e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0531793  normal  0.0760119 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  46.12 
 
 		 229 aa  202  3e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1760  ABC transporter related  45.79 
 
 		 250 aa  202  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2454  ABC transporter related  62.5 
 
 		 292 aa  202  3e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.368798  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2150  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.58 
 
 		 233 aa  202  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  hitchhiker  0.000506788 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1318  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.58 
 
 		 233 aa  202  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.113611  hitchhiker  0.00161216 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1333  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.58 
 
 		 233 aa  202  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479967 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>