More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1884 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1884  ApbE family lipoprotein  100 
 
 		 300 aa  620  1e-177  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.717042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2151  ApbE family lipoprotein  92.33 
 
 		 300 aa  577  1e-164  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0607428  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1826  ApbE family lipoprotein  92 
 
 		 300 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000850306  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2103  apbE family protein  87.64 
 
 		 275 aa  499  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1893  ApbE family lipoprotein  75.51 
 
 		 301 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000770435  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1919  ApbE family lipoprotein  75.51 
 
 		 301 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000213083  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2400  ApbE family lipoprotein  75.51 
 
 		 302 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00541927  hitchhiker  0.00229612 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1926  ApbE family lipoprotein  75.17 
 
 		 301 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0099815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2084  ApbE family lipoprotein  74.18 
 
 		 275 aa  421  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107249  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3816  ApbE family lipoprotein  66.67 
 
 		 304 aa  394  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039468 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1127  ApbE family lipoprotein  61.89 
 
 		 298 aa  369  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.390448  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3407  ApbE family lipoprotein  58.11 
 
 		 297 aa  365  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.935025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1898  ApbE family lipoprotein  47.97 
 
 		 330 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0683316 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0574  ApbE-like lipoprotein  49.45 
 
 		 279 aa  264  1e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.963363  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1651  ApbE family lipoprotein  47.9 
 
 		 306 aa  245  6e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2787  apbE family protein  43.97 
 
 		 305 aa  243  3e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.778889  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1683  ApbE family lipoprotein  48.25 
 
 		 304 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000335311  normal  0.588824 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1178  ApbE family protein  39.6 
 
 		 299 aa  235  7e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023385 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2333  ApbE family lipoprotein  39.19 
 
 		 319 aa  211  9e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00261528  normal  0.177607 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1563  carboxynorspermidine decarboxylase  38.21 
 
 		 312 aa  190  2.9999999999999997e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2411  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE, putative  38.83 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.39462  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1569  ApbE family protein  39.49 
 
 		 306 aa  175  7e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.339212  normal  0.0160978 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1225  ApbE-like lipoprotein  36.76 
 
 		 322 aa  169  5e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.65797  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1611  ApbE family lipoprotein  36.03 
 
 		 331 aa  154  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  33.94 
 
 		 353 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  32.82 
 
 		 336 aa  144  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  35.02 
 
 		 349 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  34.6 
 
 		 349 aa  139  7e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  31.74 
 
 		 339 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  33.93 
 
 		 317 aa  136  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.82 
 
 		 363 aa  132  6.999999999999999e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  33.83 
 
 		 328 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1461  ApbE family lipoprotein  34.14 
 
 		 345 aa  130  3e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2533  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  33.33 
 
 		 341 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  31.29 
 
 		 309 aa  129  5.0000000000000004e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  31.58 
 
 		 360 aa  129  7.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0988  ApbE-like lipoprotein  33.86 
 
 		 370 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151305  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  34.04 
 
 		 348 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3360  ApbE family lipoprotein  34.7 
 
 		 348 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00766501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0930  ApbE family lipoprotein  34.7 
 
 		 348 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.67844  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3432  ApbE family lipoprotein  34.7 
 
 		 348 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0771789  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3557  ApbE family lipoprotein  34.7 
 
 		 348 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0055272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  30.91 
 
 		 335 aa  124  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  30.61 
 
 		 350 aa  123  4e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0982  ApbE family lipoprotein  33.2 
 
 		 353 aa  122  5e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0264  ApbE family lipoprotein  34.84 
 
 		 320 aa  123  5e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.398879  normal  0.351019 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  33.33 
 
 		 355 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  33.46 
 
 		 350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0980  ApbE family lipoprotein  31.17 
 
 		 374 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.84365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  28.89 
 
 		 345 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2166  putative lipoprotein  35.16 
 
 		 342 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  34.36 
 
 		 308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000198345  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1717  ApbE family lipoprotein  31.15 
 
 		 337 aa  119  4.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.0292335 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0946  ApbE family lipoprotein  33.49 
 
 		 347 aa  119  7e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0942  ApbE family lipoprotein  30.77 
 
 		 374 aa  119  9e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.324541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0944  ApbE family lipoprotein  31.02 
 
 		 374 aa  119  9e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3233  ApbE family lipoprotein  32.17 
 
 		 344 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000188784  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5765  ApbE family lipoprotein  29.43 
 
 		 315 aa  118  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.734986 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1803  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.93 
 
 		 349 aa  118  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1878  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  33.07 
 
 		 367 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25360  putative thiamine biosynthesis lipoprotein  35.16 
 
 		 342 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0458  ApbE-like lipoprotein  33.94 
 
 		 341 aa  117  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3611  ApbE family lipoprotein  31.17 
 
 		 338 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2654  ApbE family lipoprotein  33.2 
 
 		 326 aa  116  3.9999999999999997e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.131589 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14650  thiamine biosynthesis lipoprotein  31.97 
 
 		 337 aa  116  5e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05200  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.39 
 
 		 332 aa  116  5e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.666118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  30.35 
 
 		 381 aa  115  6e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1597  ApbE family lipoprotein  32.25 
 
 		 308 aa  115  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1109  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  31.05 
 
 		 347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3097  ApbE family lipoprotein  33.49 
 
 		 338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5637  ApbE-like lipoprotein, membrane-associated lipoprotein involved in thiamine biosynthesis  35.27 
 
 		 337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3758  ApbE family lipoprotein  27.86 
 
 		 316 aa  114  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.390614  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3425  ApbE family lipoprotein  30.77 
 
 		 338 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00751  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  32.74 
 
 		 350 aa  112  7.000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.182367  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  32.92 
 
 		 366 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2606  ApbE family lipoprotein  32.73 
 
 		 323 aa  112  9e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.636226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  28.98 
 
 		 380 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3418  ApbE-like lipoprotein  33.05 
 
 		 343 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.999205 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0955  ApbE family lipoprotein  30.28 
 
 		 337 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0462769  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0280  nosX protein  33.33 
 
 		 330 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0129  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  31.05 
 
 		 361 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.791974  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5212  ApbE-like lipoprotein  37.98 
 
 		 335 aa  109  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0541  ApbE family lipoprotein  30.54 
 
 		 343 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0309  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  35.38 
 
 		 337 aa  108  8.000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.912952 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  30.77 
 
 		 371 aa  108  1e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2875  ApbE family lipoprotein  29.28 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21260  thiamine biosynthesis lipoprotein  30.77 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  32.39 
 
 		 386 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  32 
 
 		 344 aa  108  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0009  ApbE-like lipoprotein  33.07 
 
 		 346 aa  107  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109653  normal  0.0510654 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3299  ApbE family lipoprotein  30.61 
 
 		 359 aa  106  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.753835  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3160  putative thiamine biosynthesis lipoprotein apbE  30.61 
 
 		 345 aa  106  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3311  thiamine biosynthesis lipoprotein  30.61 
 
 		 331 aa  106  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.465607  hitchhiker  0.00000384441 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0609  ApbE family lipoprotein  32.48 
 
 		 316 aa  106  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0104099 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2878  ApbE family lipoprotein  34.6 
 
 		 348 aa  105  7e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2563  ApbE family lipoprotein  28.09 
 
 		 329 aa  105  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3727  thiamine biosynthesis protein  32.28 
 
 		 345 aa  105  7e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1086  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  29.24 
 
 		 343 aa  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2624  ApbE family lipoprotein  27.95 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3196  ApbE-like lipoprotein  32.77 
 
 		 344 aa  105  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>