More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2256 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_2256  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
159 aa  321  2e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  2.54584e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2089  transcriptional regulator, MarR family  99.37 
 
 
159 aa  319  9e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  3.54665e-07  normal  0.0829013 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2101  MarR family transcriptional regulator  96.03 
 
 
168 aa  293  9e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2373  MarR family transcriptional regulator  96.23 
 
 
154 aa  281  3e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000204338  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2099  MarR family transcriptional regulator  94.44 
 
 
149 aa  278  2e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00262035  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2046  MarR family transcriptional regulator  91.55 
 
 
153 aa  268  2e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1869  MarR family transcriptional regulator  83.65 
 
 
153 aa  257  5e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0125341  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2230  MarR family transcriptional regulator  83.65 
 
 
153 aa  257  5e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00353505  normal  0.420745 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2105  MarR family transcriptional regulator  83.65 
 
 
153 aa  257  5e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.81628  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  70.07 
 
 
139 aa  201  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  68.61 
 
 
139 aa  199  1e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  66.42 
 
 
139 aa  191  3e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  61.36 
 
 
138 aa  170  8e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  59.85 
 
 
138 aa  170  8e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  62.12 
 
 
137 aa  169  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2518  transcriptional regulator, MarR family protein  56.72 
 
 
135 aa  160  7e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.319242  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  52.27 
 
 
138 aa  153  8e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  50.78 
 
 
140 aa  129  1e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  54.62 
 
 
138 aa  125  2e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  46.21 
 
 
142 aa  125  2e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0456  MarR family transcriptional regulator  42.4 
 
 
137 aa  92  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1347  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 
142 aa  84.3  6e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0186903  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0452  transcriptional regulator, MarR family  39.52 
 
 
139 aa  81.3  5e-15  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.110741 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1135  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 
154 aa  75.9  2e-13  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.46809  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1323  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 
154 aa  73.6  1e-12  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1959  transcriptional regulator, MarR family  30.34 
 
 
156 aa  71.2  6e-12  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  26.62 
 
 
157 aa  69.7  1e-11  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  33.03 
 
 
156 aa  67  1e-10  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
146 aa  63.5  1e-09  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2042  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 
220 aa  61.2  6e-09  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.612375  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  36.71 
 
 
151 aa  60.1  1e-08  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  36.71 
 
 
151 aa  60.1  1e-08  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  36.71 
 
 
151 aa  60.1  1e-08  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
152 aa  58.9  2e-08  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  42.68 
 
 
172 aa  58.9  3e-08  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1594  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 
156 aa  58.2  5e-08  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  5.49688e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  26.96 
 
 
147 aa  57.8  6e-08  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
144 aa  57.4  7e-08  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11170  transcriptional regulator  30.77 
 
 
161 aa  57.4  9e-08  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
177 aa  57  1e-07  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1200  MarR family transcriptional regulator  33.7 
 
 
176 aa  55.8  2e-07  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1680  MarR family transcriptional regulator  33.7 
 
 
176 aa  55.8  2e-07  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.32582  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2751  transcriptional regulator, MarR family  27.22 
 
 
147 aa  55.8  2e-07  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0087  transcriptional regulator, MarR family  33.7 
 
 
166 aa  56.2  2e-07  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1206  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 
220 aa  55.8  2e-07  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 
143 aa  56.2  2e-07  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
152 aa  55.1  4e-07  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  1.49259e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0069  transcriptional regulator, MarR family  29.71 
 
 
166 aa  55.1  4e-07  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0659  MarR family transcriptional regulator  30.86 
 
 
153 aa  54.7  5e-07  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2469  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 
150 aa  54.7  6e-07  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  32.99 
 
 
176 aa  54.3  6e-07  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2756  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 
151 aa  54.3  7e-07  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1721  transcriptional regulator, MarR family  34.44 
 
 
160 aa  54.3  7e-07  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  31.01 
 
 
142 aa  53.9  9e-07  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4810  MarR family transcriptional regulator  36.9 
 
 
143 aa  53.9  9e-07  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
152 aa  53.5  1e-06  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  3.83532e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 
152 aa  53.5  1e-06  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
152 aa  53.5  1e-06  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  7.63093e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 
137 aa  53.5  1e-06  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
152 aa  53.5  1e-06  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  5.90636e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 
136 aa  53.5  1e-06  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  32.38 
 
 
153 aa  53.5  1e-06  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  32.17 
 
 
157 aa  53.5  1e-06  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2070  transcriptional regulator, MarR family  30.25 
 
 
163 aa  52.8  2e-06  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
172 aa  52.8  2e-06  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 
152 aa  52.4  2e-06  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
152 aa  52.8  2e-06  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  28.71 
 
 
141 aa  52.8  2e-06  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 
152 aa  53.1  2e-06  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.07079e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1451  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 
161 aa  53.1  2e-06  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
172 aa  52.8  2e-06  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
172 aa  52.8  2e-06  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  33.85 
 
 
189 aa  52  3e-06  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
148 aa  52  3e-06  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3341  transcriptional regulator, MarR family  30.09 
 
 
158 aa  52.4  3e-06  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.401369  normal  0.309729 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0814  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
146 aa  51.6  4e-06  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.392859  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1998  DNA-binding transcriptional repressor MarR  37.5 
 
 
144 aa  52  4e-06  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1790  MarR family transcriptional regulator  26.6 
 
 
165 aa  52  4e-06  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.167735  hitchhiker  1.30168e-07 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4833  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
171 aa  51.6  4e-06  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0190752 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5228  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 
143 aa  51.6  4e-06  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
152 aa  52  4e-06  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2484  transcriptional regulator, MarR family  32.32 
 
 
163 aa  51.6  4e-06  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105548  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
151 aa  51.2  5e-06  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 
146 aa  51.2  5e-06  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  29.35 
 
 
157 aa  51.2  5e-06  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0651  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 
146 aa  51.6  5e-06  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.243525  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1197  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
182 aa  51.6  5e-06  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308102  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0899  transcriptional regulator, MarR family  25.69 
 
 
153 aa  51.6  5e-06  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1113  transcriptional regulator, MarR family  26.89 
 
 
161 aa  50.8  6e-06  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4818e-10 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1035  MarR family transcriptional regulator  26.89 
 
 
161 aa  50.8  6e-06  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00309796  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3915  MarR family transcriptional regulator  34.34 
 
 
154 aa  51.2  6e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263248  normal  0.0186939 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0968  MarR family transcriptional regulator  26.89 
 
 
161 aa  50.8  6e-06  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  1.01536e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0701  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 
148 aa  51.2  6e-06  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255287  normal  0.732921 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  34.29 
 
 
152 aa  51.2  6e-06  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  2.97134e-09  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0946  MarR family transcriptional regulator  26.89 
 
 
161 aa  51.2  6e-06  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  3.41948e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
146 aa  50.8  7e-06  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  27.36 
 
 
147 aa  50.8  7e-06  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
147 aa  50.8  7e-06  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 
172 aa  50.8  7e-06  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 
172 aa  50.8  7e-06  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>