More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2744 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2744  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 701 aa  1441    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  35.91 
 
 		 679 aa  367  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1231  TonB-dependent receptor  35.01 
 
 		 678 aa  330  8e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1115  TonB-dependent receptor  35.13 
 
 		 649 aa  321  3e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.95294  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1014  TonB-dependent receptor-related protein  34.95 
 
 		 647 aa  318  2e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1142  TonB-dependent receptor-related protein  35.78 
 
 		 650 aa  303  1e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.22175  normal  0.0805488 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0028  TonB-dependent receptor  33.89 
 
 		 641 aa  298  2e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1262  TonB-dependent receptor  34.81 
 
 		 651 aa  298  3e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.612585  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1519  TonB-dependent receptor  34.31 
 
 		 657 aa  291  4e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.148558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1064  TonB-dependent receptor  33.68 
 
 		 661 aa  280  7e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00188221  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5752  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 746 aa  210  6e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0523831  hitchhiker  0.0000000000276247 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1274  TonB-dependent receptor plug  27.68 
 
 		 861 aa  196  1e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5364  TonB-dependent receptor plug  26.51 
 
 		 729 aa  181  4.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1321  TonB-dependent receptor  32.43 
 
 		 724 aa  178  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  27.49 
 
 		 769 aa  174  5e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 635 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  26.72 
 
 		 641 aa  137  9e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  26.48 
 
 		 659 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  27.59 
 
 		 639 aa  135  3e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  26.58 
 
 		 663 aa  135  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  26.58 
 
 		 663 aa  134  5e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  26.58 
 
 		 663 aa  134  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  26.58 
 
 		 663 aa  134  5e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  26.58 
 
 		 663 aa  134  5e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  26.58 
 
 		 663 aa  134  5e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 634 aa  134  6.999999999999999e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  25.96 
 
 		 656 aa  132  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 613 aa  132  2.0000000000000002e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  25.28 
 
 		 650 aa  132  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 653 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  25.14 
 
 		 650 aa  128  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  25 
 
 		 650 aa  128  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  24.89 
 
 		 650 aa  127  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  24.75 
 
 		 650 aa  126  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1502  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 613 aa  120  6e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4368  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 799 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3815  TonB-dependent receptor  24.3 
 
 		 658 aa  119  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  25.37 
 
 		 666 aa  118  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0448  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  35.71 
 
 		 271 aa  118  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0483  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  35.71 
 
 		 271 aa  118  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00522803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 642 aa  118  3.9999999999999997e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4161  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 799 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 698 aa  116  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 681 aa  116  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  25.49 
 
 		 653 aa  114  6e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4233  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 799 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  24.52 
 
 		 646 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  25.64 
 
 		 666 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  25.64 
 
 		 666 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  25.64 
 
 		 666 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  25.27 
 
 		 665 aa  112  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  25.89 
 
 		 666 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 649 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  24.6 
 
 		 663 aa  111  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  29.18 
 
 		 1023 aa  110  6e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  25 
 
 		 640 aa  110  9.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0654  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 638 aa  109  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561107  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  25.64 
 
 		 633 aa  109  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1301  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 634 aa  108  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1926  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 627 aa  108  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.201933  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 602 aa  108  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  25.68 
 
 		 656 aa  107  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 705 aa  107  6e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  24.54 
 
 		 663 aa  106  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3795  TonB-dependent receptor  24.47 
 
 		 740 aa  106  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 726 aa  105  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 652 aa  104  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03647  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 640 aa  104  5e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00288042  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2030  TonB-dependent receptor, plug  24.51 
 
 		 668 aa  104  6e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0570  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  26.36 
 
 		 675 aa  103  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.168599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  24.7 
 
 		 655 aa  102  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5430  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.55 
 
 		 614 aa  102  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0043717  normal  0.0207602 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1648  ferric receptor CfrA  25.05 
 
 		 696 aa  103  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1522  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4413  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.26 
 
 		 614 aa  102  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000903793  hitchhiker  0.00898611 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  24.81 
 
 		 732 aa  100  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01120  iron-regulated outer membrane virulence protein  26.88 
 
 		 572 aa  100  7e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4507  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.96 
 
 		 614 aa  100  7e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000315572  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1803  ribosome-binding factor A  25.74 
 
 		 656 aa  100  9e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4020  TonB-dependent vitamin B12 receptor  24.96 
 
 		 614 aa  100  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348064  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  27.79 
 
 		 700 aa  99.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4050  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.96 
 
 		 614 aa  100  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00780594  decreased coverage  0.000540594 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  25.75 
 
 		 617 aa  100  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1797  TonB-dependent receptor plug  36.78 
 
 		 647 aa  98.6  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4200  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.81 
 
 		 614 aa  99  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000101627  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  26 
 
 		 634 aa  98.6  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3730  TonB-dependent receptor  22.47 
 
 		 637 aa  98.2  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0159073  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  32.34 
 
 		 688 aa  97.8  7e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2667  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 627 aa  97.4  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0986558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  25 
 
 		 652 aa  97.1  9e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  35.93 
 
 		 618 aa  96.3  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2720  iron complex outermembrane recepter protein  27.66 
 
 		 631 aa  96.3  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83965  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  25.14 
 
 		 628 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2400  outer membrane receptor protein  26.94 
 
 		 621 aa  95.1  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.901841 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0132  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.17 
 
 		 631 aa  95.5  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00107286  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 698 aa  95.5  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  23.36 
 
 		 626 aa  95.5  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2970  TonB-dependent receptor protein  25.15 
 
 		 651 aa  94.7  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.140883  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  23.61 
 
 		 626 aa  94.7  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0469  iron-regulated outer membrane virulence protein, TonB receptor CfrA  25.93 
 
 		 698 aa  94.7  5e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.442515  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3735  TonB-dependent receptor plug  25.33 
 
 		 628 aa  94  9e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000331916  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>