More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1988 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 208 aa  426  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 220 aa  82  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  29.35 
 
 		 220 aa  81.6  0.000000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 212 aa  74.7  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 212 aa  74.7  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 212 aa  74.7  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4427  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  56.06 
 
 		 193 aa  73.9  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3059  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 218 aa  71.2  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2681  transcriptional regulator, TetR family  28.08 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.387724  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5697  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.197583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0176  transcriptional regulator, TetR family  27.18 
 
 		 263 aa  69.7  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3221  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 232 aa  69.3  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1190  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106163  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2619  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5451  transcriptional regulator TetR family  28 
 
 		 241 aa  68.2  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  28.37 
 
 		 245 aa  68.2  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2776  transcriptional regulator, TetR family  27.86 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376535  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  45.83 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2131  regulatory protein, TetR  27.05 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00771887  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0851  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 241 aa  66.2  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6717  transcriptional regulator, TetR family  32.68 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.477187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2217  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2332  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1038  regulatory protein, TetR  34.92 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0256263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1016  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00988275  normal  0.688061 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3905  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1169  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 214 aa  64.7  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  28.82 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2347  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 223 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123383  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0952  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0602788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 190 aa  64.7  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2226  transcriptional regulator, TetR family  28.96 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.407434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4571  transcriptional regulator, TetR family  24.59 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3981  transcriptional regulator, TetR family  24.74 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000890193 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  43.06 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2364  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4003  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3958  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4502  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.595773 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1713  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.312899  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2325  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0873  transcriptional regulator, TetR family  28.82 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.326269 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1048  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3117  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0483  TetR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4301  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  56 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2395  transcriptional regulator, TetR family  52.63 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431985  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 218 aa  62  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  25.5 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3995  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4343  transcriptional regulator, TetR family  27.05 
 
 		 225 aa  62  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0349599  decreased coverage  0.000000750918 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 206 aa  62  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  52 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  25.57 
 
 		 231 aa  62  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 275 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0773  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0502  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3598  TetR family transcriptional regulator  22.82 
 
 		 227 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.699465 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0938  transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0638862 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5667  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 210 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1638  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 232 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0260  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 234 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1991  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 232 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2087  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 232 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390005  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0685  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 232 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0573  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 232 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0810713  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0015  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0594  TetR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0201579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0891  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0886  TetR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0634  TetR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000435144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  25.94 
 
 		 317 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1870  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5974  TetR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0426648  hitchhiker  0.00085933 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4014  transcriptional regulator, TetR family  26.57 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4569  TetR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000245113  hitchhiker  0.00602594 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0639  TetR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.307578  hitchhiker  0.000146714 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4071  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365856  normal  0.0686473 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>