294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0604 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0604  hydrolase  100 
 
 		 238 aa  492  9.999999999999999e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0021  hydrolase  37.31 
 
 		 218 aa  140  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.993674  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0937  HAD family hydrolase  39.71 
 
 		 206 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2933  HAD family hydrolase  36.87 
 
 		 210 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.954117  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2069  HAD family hydrolase  37.62 
 
 		 212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.827654  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2451  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.65 
 
 		 212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.15 
 
 		 206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00317051 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2242  phosphatases  39.01 
 
 		 256 aa  118  9e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0404  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.31 
 
 		 224 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1666  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.23 
 
 		 236 aa  115  5e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.695428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2849  hydrolase  34.16 
 
 		 206 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2173  HAD family hydrolase  34.65 
 
 		 232 aa  111  9e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0277554  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1697  HAD family hydrolase  34.88 
 
 		 224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.264529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0148  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.39 
 
 		 247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0660196 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2784  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.24 
 
 		 208 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1900  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.56 
 
 		 221 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.65867  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1876  phosphatases  32.35 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000282708  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0261  HAD family hydrolase  31.16 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000130583  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1092  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.29 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4555  phosphoglycolate phosphatase  31.82 
 
 		 461 aa  67.4  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  0.133597 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.73 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.143986  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  32.39 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2111  phosphoglycolate phosphatase  29.95 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  31.82 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0927  HAD family hydrolase  26.92 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1778  HAD family hydrolase  28.49 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0979226  decreased coverage  0.0000822361 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1697  HAD family hydrolase  29.15 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0993915 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1144  HAD family hydrolase  26.94 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  26.8 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0868  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.24 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000353752  normal  0.072442 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0072  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.27 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1543  HAD family hydrolase  29.85 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.290377 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2007  HAD family hydrolase  28.96 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4023  phosphoglycolate phosphatase  27.65 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1437  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.42 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000111508  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  28.19 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3061  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.86 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2880  phosphoglycolate phosphatase  28.57 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.587243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  27.32 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2658  haloacid dehalogenase-like hydrolase  26.22 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0742  beta-phosphoglucomutase  23.91 
 
 		 214 aa  54.7  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  29.15 
 
 		 272 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0391  phosphoglycolate phosphatase  23.96 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  25.57 
 
 		 227 aa  54.3  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46650  phosphoglycolate phosphatase  30.69 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  24.74 
 
 		 225 aa  54.3  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  23.11 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.187107 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0484  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.34 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  26 
 
 		 209 aa  54.3  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  28.7 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  24.77 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2110  phosphoglycolate phosphatase  25.27 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.782136  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0937  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.07 
 
 		 219 aa  53.5  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  27.32 
 
 		 214 aa  53.5  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4954  pyrophosphatase PpaX  26.19 
 
 		 215 aa  53.5  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1715  HAD family hydrolase  28.12 
 
 		 195 aa  53.5  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.101498 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0019  phosphatase  22.16 
 
 		 208 aa  53.5  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.379676 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4600  phosphoglycolate phosphatase  27.87 
 
 		 232 aa  53.1  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.383007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3737  haloacid dehalogenase-like hydrolase  27.7 
 
 		 254 aa  53.1  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  28.25 
 
 		 272 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1874  HAD family hydrolase  28.37 
 
 		 216 aa  52.4  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.785736  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2240  HAD family hydrolase  26.03 
 
 		 214 aa  52.4  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.279618  normal  0.937061 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0027  HAD superfamily hydrolase  28.85 
 
 		 235 aa  52.4  0.000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2187  putative hydrolase  25.11 
 
 		 230 aa  52  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0143931  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  27.13 
 
 		 226 aa  52  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1368  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  27.75 
 
 		 206 aa  51.6  0.000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.668908  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0915  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  27.65 
 
 		 205 aa  52  0.000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00720904  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  24.89 
 
 		 272 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.23 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0058  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.04 
 
 		 203 aa  51.6  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00166064  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2273  HAD family hydrolase  26.49 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.768763  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0571  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.32 
 
 		 618 aa  51.2  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2757  phosphoglycolate phosphatase  26.9 
 
 		 243 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.411374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0492  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  27.75 
 
 		 206 aa  51.6  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0923435  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1246  HAD superfamily hydrolase  25 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5322  pyrophosphatase PpaX  25.36 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3704  pyrophosphatase PpaX  25.58 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1102  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.34 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1973  phosphoglycolate phosphatase  37.11 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.662433 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  27.18 
 
 		 229 aa  50.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1899  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.86 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000244384  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1458  phosphoglycolate phosphatase  25.66 
 
 		 231 aa  51.2  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677189  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1492  HAD family hydrolase  25.87 
 
 		 217 aa  50.8  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210059  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5265  pyrophosphatase PpaX  25.37 
 
 		 216 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2263  beta-phosphoglucomutase  25.82 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000132741  hitchhiker  0.000000451899 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5010  pyrophosphatase PpaX  25.58 
 
 		 216 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0218  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.28 
 
 		 206 aa  50.1  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  26.52 
 
 		 227 aa  50.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5390  pyrophosphatase PpaX  25.58 
 
 		 216 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1198  phosphoglycolate phosphatase  27.4 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.042458  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1056  putative periplasmic protein  27.03 
 
 		 207 aa  50.4  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0228325  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0590  HAD family hydrolase  29.19 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0419315 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2300  HAD family hydrolase  27.41 
 
 		 215 aa  50.1  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000835779  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  26.52 
 
 		 227 aa  50.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0350  HAD family hydrolase  25.53 
 
 		 208 aa  50.1  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.373549  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2716  HAD family hydrolase  24.06 
 
 		 218 aa  49.7  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000772309  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4839  pyrophosphatase PpaX  25.87 
 
 		 216 aa  49.7  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4854  pyrophosphatase PpaX  25.87 
 
 		 216 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3122  phosphoglycolate phosphatase  26.8 
 
 		 248 aa  49.7  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.571446  normal  0.270174 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2438  HAD family hydrolase  27.55 
 
 		 219 aa  49.7  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.625372  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>