More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1485 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_1485  transaldolase B  100 
 
 
310 aa  638  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  3.65093e-10  normal  0.591576 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2168  transaldolase B  67.2 
 
 
308 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3574  transaldolase B  66.88 
 
 
308 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.372751  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1709  transaldolase B  66.56 
 
 
308 aa  417  1e-115  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.137258  hitchhiker  2.13936e-05 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1685  transaldolase B  65.59 
 
 
308 aa  415  1e-115  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1931  transaldolase B  66.24 
 
 
308 aa  416  1e-115  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.247297 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1914  transaldolase B  66.35 
 
 
313 aa  411  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163672 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2514  transaldolase B  64.24 
 
 
316 aa  411  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.38793  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3847  transaldolase B  67.42 
 
 
308 aa  408  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0913  transaldolase B  64.35 
 
 
317 aa  409  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.507004  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3622  transaldolase B  63.75 
 
 
317 aa  409  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.517107  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0570  transaldolase B  64.44 
 
 
317 aa  404  1e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3546  transaldolase B  63.72 
 
 
318 aa  406  1e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03321  transaldolase B  63.21 
 
 
319 aa  405  1e-112  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1049  transaldolase B  63.72 
 
 
318 aa  407  1e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00112286  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0009  transaldolase B  64.76 
 
 
338 aa  407  1e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.703316  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0008  transaldolase B  64.76 
 
 
317 aa  407  1e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0009  transaldolase B  64.76 
 
 
317 aa  407  1e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.967516  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00008  hypothetical protein  64.76 
 
 
317 aa  407  1e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3647  transaldolase B  64.76 
 
 
317 aa  407  1e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0007  transaldolase B  64.76 
 
 
338 aa  407  1e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0008  transaldolase B  64.76 
 
 
317 aa  407  1e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00008  transaldolase B  64.76 
 
 
317 aa  407  1e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1280  transaldolase B  64.49 
 
 
318 aa  404  1e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  1.01503e-07  normal  0.0282739 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3588  transaldolase  64.76 
 
 
317 aa  407  1e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3049  transaldolase B  62.93 
 
 
318 aa  402  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00546599  normal  0.166064 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2967  transaldolase B  62.93 
 
 
318 aa  402  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  4.61015e-05  normal  0.264438 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0537  transaldolase B  64.24 
 
 
317 aa  402  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2734  transaldolase B  63.41 
 
 
317 aa  401  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000145141  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0007  transaldolase B  63.17 
 
 
317 aa  400  1e-110  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0688  transaldolase B  63.29 
 
 
317 aa  398  1e-110  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0573478  hitchhiker  0.00205888 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0007  transaldolase B  63.17 
 
 
317 aa  400  1e-110  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0007  transaldolase B  63.17 
 
 
317 aa  400  1e-110  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.111561  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27960  transaldolase B  66.01 
 
 
307 aa  399  1e-110  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0007  transaldolase B  63.17 
 
 
317 aa  400  1e-110  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.411691  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1074  transaldolase B  64.78 
 
 
318 aa  399  1e-110  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3147  transaldolase B  62.93 
 
 
318 aa  401  1e-110  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000170325  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1185  transaldolase B  64.17 
 
 
318 aa  399  1e-110  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0507197  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2119  transaldolase  64.19 
 
 
309 aa  398  1e-110  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.449808  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32700  transaldolase B  67.1 
 
 
308 aa  399  1e-110  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0007  transaldolase B  63.17 
 
 
317 aa  400  1e-110  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.811187  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0803  transaldolase B  63.17 
 
 
317 aa  396  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.240224  normal  0.311976 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3599  transaldolase B  62.86 
 
 
317 aa  395  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83514  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3664  transaldolase B  63.29 
 
 
317 aa  397  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0204  transaldolase B  62.58 
 
 
317 aa  395  1e-109  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2900  transaldolase B  63.95 
 
 
317 aa  395  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3859  transaldolase B  62.97 
 
 
317 aa  395  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1089  transaldolase B  64.15 
 
 
318 aa  397  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  6.75704e-05  normal  0.0360442 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3472  transaldolase B  63.17 
 
 
317 aa  396  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.179148  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1919  transaldolase B  62.9 
 
 
321 aa  391  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4104  transaldolase B  61.78 
 
 
320 aa  391  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.559408  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0576  transaldolase B  61.9 
 
 
317 aa  390  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.225405  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1655  transaldolase B  62.46 
 
 
316 aa  390  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  2.43642e-07  normal  0.288713 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3736  transaldolase B  61.64 
 
 
321 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2361  transaldolase B  66.01 
 
 
307 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1111  transaldolase B  62.78 
 
 
318 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  2.40039e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22140  transaldolase B  61.01 
 
 
322 aa  387  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3245  transaldolase B  62.78 
 
 
318 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000112094  decreased coverage  0.000667795 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1044  transaldolase B  62.78 
 
 
318 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  2.65536e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27340  transaldolase B  61.01 
 
 
322 aa  387  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0521  transaldolase B  61.2 
 
 
316 aa  385  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1145  transaldolase B  63.09 
 
 
318 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000154463  normal  0.579932 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3437  transaldolase B  61.01 
 
 
321 aa  381  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0564  transaldolase B  59.94 
 
 
316 aa  384  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2054  transaldolase B  60.19 
 
 
319 aa  383  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.4803  normal  0.221848 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1075  transaldolase B  61.54 
 
 
319 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170663  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2593  transaldolase A  59.37 
 
 
316 aa  377  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2742  transaldolase A  59.37 
 
 
316 aa  377  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2830  transaldolase A  59.37 
 
 
316 aa  376  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02355  transaldolase A  59.37 
 
 
316 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1206  transaldolase  59.37 
 
 
316 aa  377  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3685  transaldolase A  59.37 
 
 
316 aa  377  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.206304  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1213  transaldolase A  59.37 
 
 
316 aa  377  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2610  transaldolase A  59.37 
 
 
316 aa  377  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02317  hypothetical protein  59.37 
 
 
316 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1167  transaldolase B  61.22 
 
 
319 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0516908  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000494  transaldolase  60.06 
 
 
316 aa  373  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.237649  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0086  transaldolase B  59.63 
 
 
316 aa  369  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.946439  normal  0.860525 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3479  transaldolase A  57.68 
 
 
316 aa  370  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.272335  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3234  transaldolase B  57.78 
 
 
324 aa  369  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06256  transaldolase B  60.06 
 
 
316 aa  368  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2959  transaldolase A  58.1 
 
 
316 aa  369  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.874274 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1231  transaldolase B  60.45 
 
 
319 aa  367  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0164617  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0645  transaldolase B  59.81 
 
 
316 aa  364  1e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.452226  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28222  transaldolase  57.14 
 
 
316 aa  364  1e-99  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.562417  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0746  transaldolase A  56.11 
 
 
316 aa  362  5e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2706  transaldolase A  58.36 
 
 
316 aa  360  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0775  transaldolase B  57.41 
 
 
318 aa  360  2e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.38826  normal  0.0662498 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2617  transaldolase A  58.36 
 
 
316 aa  360  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2839  transaldolase A  58.04 
 
 
316 aa  360  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3806  transaldolase B  60 
 
 
326 aa  360  2e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.390141 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2666  transaldolase A  58.04 
 
 
316 aa  359  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0982  transaldolase A  56.11 
 
 
316 aa  359  3e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2732  transaldolase A  58.04 
 
 
316 aa  358  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51564  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3850  transaldolase B  58.18 
 
 
318 aa  358  5e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.866528  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2089  transaldolase B  58.47 
 
 
318 aa  358  5e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.466177  normal  0.339985 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2069  transaldolase B  59.29 
 
 
318 aa  358  9e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.851541  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2104  transaldolase B  60.63 
 
 
317 aa  355  7e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.194981 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2149  transaldolase A  56.05 
 
 
316 aa  354  9e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03170  transaldolase, putative  56.88 
 
 
323 aa  353  2e-96  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>