More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0560 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01882  putative pullulanase  52.95 
 
 		 1472 aa  1549    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5150  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  39.3 
 
 		 1124 aa  640    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.910447  normal  0.74946 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0996  alpha amylase family protein  40.7 
 
 		 998 aa  682    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1694  putative pullulanase  53.48 
 
 		 1429 aa  1560    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04828  pullulanase  41.13 
 
 		 1328 aa  905    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1413  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  40.47 
 
 		 1117 aa  711    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4105  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  40.63 
 
 		 1035 aa  752    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001089  putative pullulanase precursor  40.33 
 
 		 1329 aa  919    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0560  putative pullulanase precursor  100 
 
 		 1432 aa  2940    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.594398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1316  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  53.28 
 
 		 1440 aa  1546    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0748066 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1941  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  53.11 
 
 		 1450 aa  1518    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0287  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  55.7 
 
 		 1441 aa  1582    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3074  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  53.21 
 
 		 1440 aa  1545    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000101349 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3767  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  39.78 
 
 		 1025 aa  613  9.999999999999999e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2488  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  39.15 
 
 		 1176 aa  597  1e-169  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.331345 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  35.41 
 
 		 1942 aa  576  1.0000000000000001e-162  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0096  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  38.9 
 
 		 891 aa  566  1e-160  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.380747  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3513  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  38.71 
 
 		 1331 aa  564  1.0000000000000001e-159  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0648874  normal  0.682211 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2712  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  38.05 
 
 		 2156 aa  565  1.0000000000000001e-159  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3061  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  36.71 
 
 		 946 aa  547  1e-154  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57883  normal  0.116697 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2273  pullulanase  42.45 
 
 		 717 aa  550  1e-154  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2329  Alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  36.02 
 
 		 991 aa  545  1e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0783894  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  36.14 
 
 		 1855 aa  531  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39745  predicted protein  38.1 
 
 		 1062 aa  520  1.0000000000000001e-145  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  38.03 
 
 		 1891 aa  501  1e-140  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  35.78 
 
 		 1975 aa  503  1e-140  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06650  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  35.21 
 
 		 1248 aa  498  1e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  36.35 
 
 		 2068 aa  483  1e-134  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0609  pullulanase, type I  28.95 
 
 		 1136 aa  309  2.0000000000000002e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2498  pullulanase  30.37 
 
 		 852 aa  308  4.0000000000000004e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00309415  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2463  pullulanase  30.37 
 
 		 850 aa  308  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2737  putative pullulanase  30.04 
 
 		 852 aa  304  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.31165e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2542  pullulanase  30.04 
 
 		 852 aa  303  2e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814075  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2728  pullulanase  30.04 
 
 		 852 aa  303  2e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00354349  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2786  pullulanase, type I  29.6 
 
 		 848 aa  297  1e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0751626  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2304  pullulanase, type I  29.7 
 
 		 1043 aa  289  2.9999999999999996e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2416  pullulanase, type I  32.06 
 
 		 856 aa  284  7.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00697767  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2741  putative pullulanase  29.99 
 
 		 852 aa  282  3e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0379063  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2761  pullulanase, putative  29.6 
 
 		 848 aa  281  5e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00586404  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0978  pullulanase, type I  30.15 
 
 		 843 aa  280  1e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.912818  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0959  pullulanase, type I  30.26 
 
 		 843 aa  280  1e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.557051  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2331  pullulanase, type I  31.45 
 
 		 647 aa  276  1.0000000000000001e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1803  pullulanase, type I  27.62 
 
 		 655 aa  270  2e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.248563  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1522  pullulanase precursor  27.49 
 
 		 655 aa  269  2.9999999999999995e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0360874  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2552  putative pullulanase  30.74 
 
 		 852 aa  268  5e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000407246  decreased coverage  0.0000000000706623 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  28.9 
 
 		 1888 aa  267  8.999999999999999e-70  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1839  putative pullulanase  29.61 
 
 		 1064 aa  265  4e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1558  pullulanase precursor  29.61 
 
 		 1064 aa  263  2e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.430377  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0057  pullulanase, type I  29.37 
 
 		 928 aa  256  2.0000000000000002e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0459  pullulanase, type I  27.21 
 
 		 842 aa  255  5.000000000000001e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.712908  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0061  pullulanase, type I  28.19 
 
 		 899 aa  254  7e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19550  pullulanase, type I  28.53 
 
 		 874 aa  250  1e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1427  pullulanase, type I  27.52 
 
 		 841 aa  243  1e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.671793  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13880  pullulanase, type I  26.57 
 
 		 640 aa  239  2e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0681  pullulanase, type I  28.19 
 
 		 718 aa  239  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0448  pullulanase, type I  28.15 
 
 		 825 aa  235  6e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  27.67 
 
 		 2638 aa  231  8e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0421  pullulanase, type I  29.58 
 
 		 601 aa  229  4e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1298  pullulanase, type I  29.07 
 
 		 669 aa  225  4e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4434  pullulanase  27.93 
 
 		 713 aa  220  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4814  putative pullulanase  28.12 
 
 		 713 aa  219  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4597  pullulanase  27.31 
 
 		 713 aa  218  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4953  pullulanase  27.31 
 
 		 713 aa  218  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4819  putative pullulanase  27.63 
 
 		 713 aa  217  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4452  pullulanase  27.63 
 
 		 713 aa  216  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0422  putative pullulanase  27.29 
 
 		 713 aa  214  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4837  putative pullulanase  27.37 
 
 		 713 aa  213  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.837132  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3365  pullulanase, type I  27.84 
 
 		 712 aa  211  9e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4533  pullulanase, type I  26.37 
 
 		 713 aa  209  4e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4844  pullulanase, putative  27.33 
 
 		 713 aa  207  9e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0872  pullulanase, type I  25.99 
 
 		 640 aa  177  9e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0852  pullulanase, putative  26.8 
 
 		 766 aa  176  3.9999999999999995e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.865256  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1216  pullulanase, putative  27.57 
 
 		 1252 aa  169  2.9999999999999998e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0305928  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0868  pullulanase, extracellular  23.59 
 
 		 776 aa  152  4e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3828  glycoside hydrolase family 13 protein  24.09 
 
 		 817 aa  117  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535052 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3315  glycogen debranching enzyme GlgX  23.54 
 
 		 711 aa  107  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3430  glycogen debranching enzyme GlgX  24.32 
 
 		 707 aa  103  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0101  alpha-amylase family protein  24.31 
 
 		 714 aa  102  6e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1056  glycogen debranching enzyme GlgX  24.26 
 
 		 712 aa  102  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1184  glycogen debranching enzyme GlgX  23.82 
 
 		 712 aa  102  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1115  glycogen debranching enzyme GlgX  24.14 
 
 		 712 aa  101  9e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2272  type II secretory pathway protein  31.68 
 
 		 496 aa  101  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2363  glycogen debranching enzyme GlgX  22.28 
 
 		 701 aa  100  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0149674 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2282  glycogen debranching enzyme GlgX  24.85 
 
 		 704 aa  100  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0218366  hitchhiker  0.000957469 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7550  glycogen debranching enzyme GlgX  24.53 
 
 		 702 aa  99  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317676  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3146  glycogen debranching enzyme GlgX  23.85 
 
 		 716 aa  98.6  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36630  putative glycosyl hydrolase  23.71 
 
 		 716 aa  98.6  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278347  normal  0.953744 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2265  glycogen debranching enzyme GlgX  22.01 
 
 		 708 aa  98.6  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202669 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2933  glycogen debranching enzyme GlgX  23.88 
 
 		 752 aa  98.6  8e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1249  glycogen debranching enzyme GlgX  24.22 
 
 		 735 aa  97.4  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2757  glycogen debranching enzyme GlgX  23.8 
 
 		 752 aa  96.7  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2835  glycogen debranching enzyme GlgX  24.07 
 
 		 752 aa  96.3  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6824  glycogen debranching enzyme GlgX  22.94 
 
 		 739 aa  96.7  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1322  glycogen debranching enzyme GlgX  24.42 
 
 		 733 aa  95.9  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.831141  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6129  glycogen debranching enzyme GlgX  22.08 
 
 		 717 aa  95.9  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.872744 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3027  glycogen debranching enzyme GlgX  24.42 
 
 		 733 aa  95.9  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1885  glycogen debranching enzyme GlgX  22.35 
 
 		 727 aa  95.5  6e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1358  glycogen debranching enzyme GlgX  23.96 
 
 		 733 aa  95.5  7e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.173381 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1332  glycogen debranching enzyme GlgX  24.42 
 
 		 733 aa  95.1  8e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0086  isoamylase  25.63 
 
 		 694 aa  94.7  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>