More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4885 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4410  ABC transporter related  93.14 
 
 		 631 aa  1042    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4885  ABC transporter related  100 
 
 		 626 aa  1238    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1807  ABC transporter related protein  46.53 
 
 		 662 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0965737  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7945  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  44 
 
 		 633 aa  446  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3877  ABC transporter related  37.7 
 
 		 673 aa  357  5e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0212257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4440  ABC transporter related  37.5 
 
 		 665 aa  346  7e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.25933  normal  0.204471 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2447  ABC transporter related  38.05 
 
 		 647 aa  318  2e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.12281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4501  ABC transporter related  34.62 
 
 		 621 aa  302  1e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2787  ABC transporter related  33.84 
 
 		 653 aa  293  7e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3487  ABC transporter related protein  34.23 
 
 		 616 aa  285  1.0000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908956  normal  0.590401 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0404  ABC transporter related protein  32.12 
 
 		 609 aa  282  1e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3260  ABC transporter related  32.45 
 
 		 623 aa  281  2e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0661  ABC transporter related  31.26 
 
 		 625 aa  268  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0389  ABC transporter related protein  33.94 
 
 		 616 aa  264  4e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0530  ABC transporter related  31.19 
 
 		 625 aa  263  4.999999999999999e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2224  ABC transporter-like  30.81 
 
 		 604 aa  261  3e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00656  ABC transporter ATP-binding protein  33.46 
 
 		 626 aa  253  8.000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1868  ABC transporter related  35.66 
 
 		 638 aa  248  3e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133041  normal  0.243769 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0478  ABC transporter related  32.52 
 
 		 611 aa  246  8e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0961856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1927  ABC transporter related  32.75 
 
 		 615 aa  246  8e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2295  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  31.01 
 
 		 603 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000465139 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.2 
 
 		 603 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2538  ABC transporter related  31.76 
 
 		 619 aa  243  6e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3357  ABC transporter related  30.18 
 
 		 592 aa  243  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0397  carbohydrate ABC transporter  33.14 
 
 		 626 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0323  ABC transporter-related protein  26.69 
 
 		 608 aa  240  5.999999999999999e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2353  ABC transporter related  33.99 
 
 		 618 aa  240  6.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3698  ABC transporter related  31.82 
 
 		 611 aa  240  6.999999999999999e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.736817 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2085  ABC transporter related  34.54 
 
 		 618 aa  238  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.836292 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0429  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  34.54 
 
 		 618 aa  238  3e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0894  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.77 
 
 		 600 aa  237  4e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.652846  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2658  ABC transporter related  34.14 
 
 		 623 aa  237  4e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.0555578 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1897  ABC transporter, ATPase subunit  30.69 
 
 		 621 aa  235  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.423681  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1982  ABC transporter-related protein  30.65 
 
 		 621 aa  233  1e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.186428  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2067  ABC transporter related  30.37 
 
 		 621 aa  232  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.351689  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7737  carbohydrate ABC transporter  32.9 
 
 		 619 aa  230  7e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2389  ABC transporter related  31.25 
 
 		 615 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.168027 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1963  ABC transporter related  30.91 
 
 		 625 aa  211  4e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0472516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2541  ABC transporter related  26.63 
 
 		 613 aa  210  6e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684037 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4332  ABC transporter related  29.76 
 
 		 614 aa  210  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.754277  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2944  subtilin ABC transporter  27.5 
 
 		 597 aa  208  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000010922  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2561  ABC transporter related protein  35.02 
 
 		 616 aa  205  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0061  ABC transporter related  30.42 
 
 		 606 aa  204  4e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2000  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  25.25 
 
 		 566 aa  203  7e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0533598  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4186  ABC transporter related  31.06 
 
 		 611 aa  203  8e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.938404  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5807  ABC transporter related  33.65 
 
 		 627 aa  200  7.999999999999999e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0971  ABC transporter related protein  32.4 
 
 		 626 aa  199  9e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1840  ABC transporter related  27.65 
 
 		 591 aa  199  2.0000000000000003e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5831  ABC transporter related  31.62 
 
 		 633 aa  196  8.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1915  ABC transporter related  30.18 
 
 		 613 aa  195  2e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2701  ABC transporter related  29.06 
 
 		 605 aa  195  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0086  ABC transporter related  31.27 
 
 		 618 aa  196  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0117635  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2876  ABC transporter related  29.32 
 
 		 619 aa  193  8e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.39915  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2022  ABC transporter related  26.41 
 
 		 605 aa  192  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029505 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3756  ABC transporter related  31.17 
 
 		 595 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2183  ABC transporter related protein  29.89 
 
 		 608 aa  191  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08270  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  44.44 
 
 		 596 aa  191  2.9999999999999997e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00203006  normal  0.441586 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2586  ABC transporter related  29.21 
 
 		 619 aa  190  5e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000702067 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1838  ABC transporter related protein  32.33 
 
 		 611 aa  188  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355315  normal  0.263806 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1278  ABC transporter related protein  32.76 
 
 		 617 aa  187  5e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3590  ABC transporter related protein  41.37 
 
 		 604 aa  187  5e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.657817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  41.25 
 
 		 618 aa  187  6e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0817  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  25.78 
 
 		 603 aa  186  9e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2031  ABC transporter related  41.01 
 
 		 500 aa  185  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1395  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  40.7 
 
 		 610 aa  185  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.507365  hitchhiker  0.000128889 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0829  ABC transporter, ATP-binding protein  23.11 
 
 		 603 aa  184  5.0000000000000004e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.588647  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1741  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  40.91 
 
 		 590 aa  184  6e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5809  ABC transporter related  33.26 
 
 		 578 aa  183  7e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0964  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  43.07 
 
 		 601 aa  182  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.519828  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0234  ABC transporter ATP-binding protein  27.26 
 
 		 603 aa  181  2.9999999999999997e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0989  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  45.49 
 
 		 634 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0152  ABC transporter related protein  37.93 
 
 		 602 aa  181  4.999999999999999e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1247  ABC transporter related  26.99 
 
 		 611 aa  180  9e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1774  ABC transporter related  33.33 
 
 		 578 aa  179  1e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.937186  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0691  ABC transporter related  33.33 
 
 		 578 aa  179  1e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1316  lipid/multidrug ABC transporter MsbA ATPase and inner membrane domains  33.6 
 
 		 595 aa  179  2e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1061  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  26.74 
 
 		 594 aa  178  3e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00531558  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1062  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  40.31 
 
 		 598 aa  178  3e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1248  ABC transporter related  25.29 
 
 		 604 aa  177  6e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0261442  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3591  ABC transporter related protein  39.18 
 
 		 623 aa  176  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.727827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  36.68 
 
 		 600 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  41.32 
 
 		 591 aa  176  9.999999999999999e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  34.2 
 
 		 576 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1828  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  43.77 
 
 		 600 aa  176  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.924491 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0315  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  23.06 
 
 		 594 aa  176  1.9999999999999998e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0532583  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0797  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  41.98 
 
 		 632 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0777  ABC transporter related  32.84 
 
 		 635 aa  175  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193136  normal  0.304338 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2746  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  41.51 
 
 		 627 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0546982 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0603  ABC transporter-like protein  41.15 
 
 		 599 aa  174  5.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.131331 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0389  ABC transporter ATP-binding protein  29.3 
 
 		 582 aa  174  5.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3296  ABC transporter related  38.82 
 
 		 588 aa  172  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0353  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.72 
 
 		 582 aa  172  1e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.693994  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  38.89 
 
 		 601 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1277  ABC transporter related protein  32.28 
 
 		 590 aa  172  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.412647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  38.89 
 
 		 601 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0184  ABC transporter, ATP-binding protein  24.3 
 
 		 586 aa  171  3e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0481  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  43.01 
 
 		 600 aa  171  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3544  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  43.5 
 
 		 629 aa  171  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1454  ABC transporter related  37.7 
 
 		 600 aa  171  3e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1885  ABC transporter related protein  27.92 
 
 		 618 aa  171  5e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>