More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0184 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0184  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 586 aa  1177    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0185  ABC transporter ATP-binding protein  33.11 
 
 		 585 aa  247  4e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0045  ABC transporter, ATP-binding protein  30.61 
 
 		 614 aa  207  4e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0479  ABC transporter related protein  30.83 
 
 		 596 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3260  ABC transporter related  27.43 
 
 		 623 aa  192  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1719  ABC transporter related  24.27 
 
 		 631 aa  191  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.737168  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0404  ABC transporter related protein  27.39 
 
 		 609 aa  190  5.999999999999999e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2000  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  27.15 
 
 		 566 aa  189  9e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0533598  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0603  ABC transporter-like protein  31.3 
 
 		 599 aa  187  3e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.131331 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2183  ABC transporter related protein  28.24 
 
 		 608 aa  187  5e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0389  ABC transporter related protein  32.12 
 
 		 616 aa  186  8e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2541  ABC transporter related  26.5 
 
 		 613 aa  186  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684037 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3698  ABC transporter related  26.14 
 
 		 611 aa  185  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.736817 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0830  ABC transporter, ATP-binding protein  34.01 
 
 		 596 aa  184  5.0000000000000004e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0162208  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2224  ABC transporter-like  25.13 
 
 		 604 aa  182  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1247  ABC transporter related  39.15 
 
 		 611 aa  182  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0411  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  26.04 
 
 		 587 aa  181  4e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1982  ABC transporter-related protein  24.8 
 
 		 621 aa  181  4e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.186428  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1897  ABC transporter, ATPase subunit  25.16 
 
 		 621 aa  180  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.423681  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0661  ABC transporter related  27.15 
 
 		 625 aa  180  5.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2067  ABC transporter related  24.84 
 
 		 621 aa  180  8e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.351689  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0817  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  29.12 
 
 		 603 aa  180  8e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1915  ABC transporter related  30.85 
 
 		 613 aa  179  1e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0818  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  32.7 
 
 		 596 aa  179  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0397  carbohydrate ABC transporter  29.33 
 
 		 626 aa  178  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2295  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  28.12 
 
 		 603 aa  178  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000465139 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0829  ABC transporter, ATP-binding protein  29.33 
 
 		 603 aa  177  4e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.588647  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5831  ABC transporter related  28.47 
 
 		 633 aa  177  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5809  ABC transporter related  27.53 
 
 		 578 aa  176  8e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1927  ABC transporter related  27.84 
 
 		 615 aa  176  9e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4501  ABC transporter related  32.2 
 
 		 621 aa  176  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.37 
 
 		 603 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2538  ABC transporter related  37.7 
 
 		 619 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3115  ABC transporter related  30.27 
 
 		 606 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2389  ABC transporter related  37.14 
 
 		 615 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.168027 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0591  ABC transporter-related protein  31.14 
 
 		 566 aa  174  5e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4332  ABC transporter related  29.55 
 
 		 614 aa  173  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.754277  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0315  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  28.08 
 
 		 594 aa  173  9e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0532583  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3116  ABC transporter related  30.85 
 
 		 610 aa  168  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2353  ABC transporter related  29.17 
 
 		 618 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0429  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  30.99 
 
 		 618 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5807  ABC transporter related  22.83 
 
 		 627 aa  167  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2085  ABC transporter related  30.99 
 
 		 618 aa  167  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.836292 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08270  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  24.95 
 
 		 596 aa  167  5.9999999999999996e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00203006  normal  0.441586 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4186  ABC transporter related  29.16 
 
 		 611 aa  167  6.9999999999999995e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.938404  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3066  ABC transporter related  27.04 
 
 		 593 aa  166  9e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000101983  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0028  ABC transporter ATP-binding protein  41.2 
 
 		 624 aa  166  1.0000000000000001e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.716088  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0691  ABC transporter related  32.52 
 
 		 578 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1774  ABC transporter related  32.52 
 
 		 578 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.937186  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3487  ABC transporter related protein  27.08 
 
 		 616 aa  166  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908956  normal  0.590401 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2524  ABC transporter, ATP-binding protein  39.23 
 
 		 423 aa  165  2.0000000000000002e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00646333  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0323  ABC transporter-related protein  28.85 
 
 		 608 aa  164  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0530  ABC transporter related  35.08 
 
 		 625 aa  164  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0478  ABC transporter related  29.4 
 
 		 611 aa  163  8.000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0961856  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1062  ABC transporter ATP-binding protein  38.58 
 
 		 625 aa  163  9e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.908887  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3357  ABC transporter related  27.33 
 
 		 592 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1517  ABC transporter related  29.16 
 
 		 622 aa  162  1e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0894  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.79 
 
 		 600 aa  161  3e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.652846  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3591  ABC transporter related protein  32.71 
 
 		 623 aa  160  4e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.727827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1868  ABC transporter related  33.2 
 
 		 638 aa  160  7e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133041  normal  0.243769 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3067  ABC transporter related  26.79 
 
 		 616 aa  160  8e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000774728  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4885  ABC transporter related  24.73 
 
 		 626 aa  159  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1454  ABC transporter related  29.91 
 
 		 600 aa  159  1e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2201  ABC transporter related  26.26 
 
 		 618 aa  159  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0878043  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1041  ABC transporter related  27.89 
 
 		 577 aa  159  2e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4410  ABC transporter related  28.92 
 
 		 631 aa  157  6e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19150  ABC transporter, composite transmembrane permease and ATP binding components  28.14 
 
 		 615 aa  157  7e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2658  ABC transporter related  34.87 
 
 		 623 aa  156  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.0555578 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0276  ABC transporter related  31.79 
 
 		 583 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2944  subtilin ABC transporter  36.47 
 
 		 597 aa  154  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000010922  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3756  ABC transporter related  25.11 
 
 		 595 aa  154  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0630  ABC transporter related  34.78 
 
 		 597 aa  154  4e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2561  ABC transporter related protein  25.99 
 
 		 616 aa  154  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03608  ABC transporter protein AtrC [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y748]  35.18 
 
 		 1266 aa  154  5e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0627  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.83 
 
 		 584 aa  154  5e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.746647  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1782  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  28.63 
 
 		 588 aa  154  5e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1840  ABC transporter related  30.93 
 
 		 591 aa  154  5e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0234  ABC transporter ATP-binding protein  24.66 
 
 		 603 aa  154  5.9999999999999996e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1248  ABC transporter related  29.75 
 
 		 604 aa  154  5.9999999999999996e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0261442  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0658  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  40.91 
 
 		 760 aa  154  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.357384  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2314  ABC transporter related  25.4 
 
 		 587 aa  154  5.9999999999999996e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0749379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2031  ABC transporter related  32.95 
 
 		 500 aa  153  8e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0325  ABC transporter, transmembrane region  32.52 
 
 		 746 aa  152  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.771448 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0152  ABC transporter related protein  27.78 
 
 		 602 aa  152  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1963  ABC transporter related  23.24 
 
 		 625 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0472516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1453  ABC transporter related  28.03 
 
 		 571 aa  151  3e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2510  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.51 
 
 		 577 aa  151  3e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00122809  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0880  ABC transporter related  35.25 
 
 		 579 aa  151  3e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000105658  decreased coverage  0.000000000323108 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1498  ABC transporter related  28.03 
 
 		 571 aa  151  4e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4581  ABC transporter related  32.82 
 
 		 613 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1860  ABC transporter related  29.01 
 
 		 584 aa  150  5e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.827939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0387  lipid A ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.31 
 
 		 586 aa  150  6e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0707  ABC transporter related  39.83 
 
 		 584 aa  150  7e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0139832  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1807  ABC transporter related protein  33.2 
 
 		 662 aa  150  8e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0965737  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2288  ABC transporter related  25.93 
 
 		 704 aa  150  9e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.418994  normal  0.773085 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1061  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  27.04 
 
 		 594 aa  149  1.0000000000000001e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00531558  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0041  ABC transporter, transmembrane region, type 1  33.85 
 
 		 594 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3782  ABC transporter related  34.85 
 
 		 676 aa  149  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253912  normal  0.646389 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0340  ABC transporter related  34.39 
 
 		 580 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0061  ABC transporter related  35.8 
 
 		 606 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>