More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4660 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4660  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 242 aa  444  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4223  regulatory protein, IclR  85.95 
 
 		 223 aa  371  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.918168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1292  regulatory proteins, IclR  60.49 
 
 		 226 aa  221  9.999999999999999e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1481  transcriptional regulator, IclR family  57.01 
 
 		 228 aa  220  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8832  Transcriptional regulator-like protein  64.1 
 
 		 210 aa  204  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.639619  normal  0.010904 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0091  transcriptional regulator, IclR family  59.62 
 
 		 219 aa  183  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.804126  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01040  transcriptional regulator  50.48 
 
 		 210 aa  159  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0791701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1905  IclR family transcriptional regulator  45.87 
 
 		 254 aa  152  4e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1112  IclR family transcriptional regulator  45.5 
 
 		 222 aa  142  5e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.0898782 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07180  transcriptional regulator  44.55 
 
 		 240 aa  135  6.0000000000000005e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2902  IclR family transcriptional regulator  40.64 
 
 		 248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4749  IclR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 268 aa  105  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1345  transcriptional regulator, IclR family  37.24 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.453635  normal  0.806138 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4661  transcriptional regulator, IclR family  38.81 
 
 		 234 aa  102  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2399  regulatory protein, IclR  35.52 
 
 		 233 aa  101  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3792  regulatory proteins, IclR  37.14 
 
 		 260 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.711541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3861  regulatory proteins, IclR  37.14 
 
 		 260 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3788  IclR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 260 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.65348  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1914  transcriptional regulator, IclR family  39.46 
 
 		 230 aa  97.1  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0780342  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0872  transcriptional regulator, TrmB  39.92 
 
 		 242 aa  96.3  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4247  regulatory proteins, IclR  35.2 
 
 		 244 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2571  IclR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 244 aa  90.5  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2303  transcriptional regulator, IclR family  38.85 
 
 		 244 aa  87.8  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584535 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20110  transcriptional regulator  41.84 
 
 		 242 aa  85.9  5e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  30.77 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1950  IclR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.400846  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2914  IclR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2228  IclR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.713006  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1720  IclR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0967  IclR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.225684  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1253  IclR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3039  IclR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1272  IclR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  31.65 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2234  IclR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  32.5 
 
 		 295 aa  68.9  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  37.86 
 
 		 246 aa  67.8  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  32.41 
 
 		 259 aa  67  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0364  IclR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  29.45 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  31.25 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1900  regulatory proteins, IclR  37.86 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.417398 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1920  IclR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1966  regulatory proteins, IclR  37.86 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0050  IclR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1072  IclR family transcriptional regulator  31 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0478344  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4151  transcriptional regulator, IclR family  30.57 
 
 		 264 aa  62  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.697972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4039  transcriptional regulator, IclR family  30.57 
 
 		 264 aa  62  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4797  transcriptional regulator, IclR family  33.12 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 254 aa  62  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 268 aa  62  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2718  transcriptional regulator, IclR family  34.53 
 
 		 265 aa  62  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13004  transcriptional regulator  34.78 
 
 		 233 aa  62  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27090  transcriptional regulator  31.08 
 
 		 268 aa  62  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2281  regulatory proteins, IclR  30.82 
 
 		 288 aa  61.6  0.000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.864202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2134  regulatory proteins, IclR  36.17 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3216  Transcriptional regulator IclR  32.07 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15602  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0741  IclR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000156602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2434  IclR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  25.52 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1249  transcriptional regulator, IclR family  31.03 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.775121  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0373  transcriptional regulator, IclR family  30.3 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0541267 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19700  transcriptional regulator, IclR family  39.16 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.089385  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6282  regulatory protein, IclR  31.94 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302936  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3302  transcriptional regulator, IclR family  41.67 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0492  IclR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  29.73 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4604  regulatory proteins, IclR  39.58 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  31.69 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7080  Transcriptional regulator  29.51 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4142  putative IclR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000218071  normal  0.711685 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0796  IclR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.060065  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0136  IclR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.731827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4694  transcriptional regulator, IclR family  33.06 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.116545  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6293  IclR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 261 aa  58.5  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5478  transcriptional regulator, IclR family  32.39 
 
 		 249 aa  58.5  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0650  transcriptional regulator, IclR family  35.17 
 
 		 263 aa  58.5  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2316  IclR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 246 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.812394  normal  0.959704 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  30.77 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4012  transcriptional regulator, IclR family  29.21 
 
 		 254 aa  57  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5543  regulatory protein, IclR  35.92 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.452687  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2487  transcriptional regulator KdgR  30.87 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.823978  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3002  transcriptional regulator, IclR family  35.97 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.169737  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  25.48 
 
 		 257 aa  57  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3729  IclR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 268 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2721  IclR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.276601 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 259 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5394  IclR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.340198 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6042  transcriptional regulator, IclR family  31.61 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5545  regulatory protein, IclR  32.67 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6756  IclR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 285 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.152181  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  25.69 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  26.58 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  27.27 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4847  IclR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0298139  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>