More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1158 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1158  cystathionine gamma-lyase  100 
 
 		 373 aa  725    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0760832  unclonable  0.0000000519282 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1267  cystathionine gamma-lyase  88.65 
 
 		 371 aa  589  1e-167  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.929061 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5997  cystathionine gamma-lyase  59 
 
 		 375 aa  365  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.847567  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1425  cystathionine gamma-lyase  55.49 
 
 		 400 aa  351  1e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.144406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4046  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  56.52 
 
 		 379 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163524  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2142  cystathionine gamma-lyase  52.2 
 
 		 369 aa  328  9e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.654295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1928  cystathionine gamma-lyase  52.76 
 
 		 367 aa  324  1e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.632886  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1974  cystathionine gamma-lyase  52.76 
 
 		 367 aa  324  1e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.798909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4220  cystathionine gamma-lyase  50 
 
 		 369 aa  323  2e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.597233 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1908  cystathionine gamma-lyase  52.49 
 
 		 367 aa  323  3e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.971857  normal  0.65945 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1684  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  54.13 
 
 		 410 aa  306  5.0000000000000004e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22690  cystathionine gamma-lyase  50.27 
 
 		 392 aa  288  1e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3117  cystathionine gamma-lyase  38.38 
 
 		 379 aa  204  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000114351 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  33.93 
 
 		 378 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1092  Cystathionine gamma-synthase  37.34 
 
 		 393 aa  202  7e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.38865 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0163  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  34.72 
 
 		 387 aa  201  9.999999999999999e-51  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.574145  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  38.44 
 
 		 399 aa  200  3e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  36.78 
 
 		 398 aa  199  9e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  35.14 
 
 		 377 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4786  cystathionine gamma-synthase  36.48 
 
 		 386 aa  197  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000330787 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  38.79 
 
 		 398 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8563  Cystathionine gamma-lyase  36.87 
 
 		 379 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0121  cystathionine gamma-synthase  36.98 
 
 		 386 aa  196  4.0000000000000005e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  33.93 
 
 		 392 aa  196  4.0000000000000005e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0702  Cystathionine gamma-synthase  38.1 
 
 		 383 aa  196  5.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558614  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4095  cystathionine gamma-synthase  36.72 
 
 		 413 aa  196  7e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3807  cystathionine gamma-synthase  36.72 
 
 		 386 aa  196  7e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0177  cystathionine gamma-synthase  36.29 
 
 		 386 aa  195  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0684  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  38.82 
 
 		 422 aa  195  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.228137  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1913  cystathionine gamma-synthase  38.92 
 
 		 390 aa  194  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.415467  normal  0.644507 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  37.66 
 
 		 396 aa  194  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3151  Cystathionine gamma-synthase  35.45 
 
 		 390 aa  194  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377384  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  34.62 
 
 		 394 aa  193  3e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4035  cystathionine gamma-synthase  35.42 
 
 		 386 aa  194  3e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0189  cystathionine gamma-synthase  36.2 
 
 		 425 aa  193  4e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0494  Cystathionine gamma-lyase  31.4 
 
 		 379 aa  193  4e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  38.22 
 
 		 398 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.510937 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01446  Cystathionine gamma-lyase (EC 4.4.1.1) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:B2LXT6]  35.69 
 
 		 419 aa  193  5e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.332216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1615  cystathionine gamma-synthase  38.87 
 
 		 393 aa  192  6e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1594  Cystathionine gamma-lyase  39.34 
 
 		 390 aa  192  7e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.320611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31860  cystathionine gamma-lyase  36.57 
 
 		 387 aa  192  9e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3411  Cystathionine gamma-synthase  38.6 
 
 		 395 aa  192  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306787  normal  0.0474144 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4501  cystathionine gamma-synthase  36.27 
 
 		 386 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0840458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  35.66 
 
 		 397 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4431  cystathionine gamma-synthase  36.27 
 
 		 386 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4381  cystathionine gamma-synthase  36.01 
 
 		 386 aa  191  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.89633 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3071  Cystathionine gamma-synthase  35.4 
 
 		 377 aa  191  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82057  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4434  cystathionine gamma-synthase  36.27 
 
 		 386 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.188504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4479  cystathionine gamma-synthase  35.75 
 
 		 386 aa  191  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.146972  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0802  cystathionine beta-lyase  36.23 
 
 		 394 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4347  cystathionine gamma-synthase  36.01 
 
 		 386 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3061  cystathionine gamma-synthase  36.5 
 
 		 389 aa  190  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0976  cystathionine gamma-lyase  38.06 
 
 		 387 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307995  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1266  Cystathionine gamma-synthase  35.76 
 
 		 376 aa  190  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.547301  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4046  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  35.75 
 
 		 386 aa  189  5e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4172  cystathionine gamma-synthase  35.75 
 
 		 386 aa  189  5e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4076  cystathionine gamma-synthase  35.75 
 
 		 386 aa  189  5e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4670  cystathionine gamma-synthase  36.27 
 
 		 393 aa  189  5e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.662704 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03825  cystathionine gamma-synthase  35.48 
 
 		 386 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.24888  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4425  cystathionine gamma-synthase  35.32 
 
 		 386 aa  189  5.999999999999999e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5399  cystathionine gamma-synthase  35.75 
 
 		 386 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.735878 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2219  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  36.39 
 
 		 377 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.201803  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03774  hypothetical protein  35.48 
 
 		 386 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.272027  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3697  cystathionine gamma-synthase  36.18 
 
 		 405 aa  189  8e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2008  Cystathionine gamma-lyase  36.69 
 
 		 377 aa  189  9e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.31334e-21 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2908  Cystathionine gamma-lyase  32.63 
 
 		 379 aa  188  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000019039 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  31.4 
 
 		 380 aa  188  1e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4317  cystathionine gamma-synthase  36.01 
 
 		 386 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1831  cystathionine gamma-synthase  35.4 
 
 		 381 aa  188  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  36.31 
 
 		 378 aa  188  1e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3473  cystathionine gamma-synthase  39.63 
 
 		 372 aa  187  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.400432  normal  0.010715 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0592  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  37.94 
 
 		 394 aa  187  2e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.19345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1618  Cystathionine gamma-synthase  34.76 
 
 		 383 aa  187  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  35.47 
 
 		 378 aa  187  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09046  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzyme  31.34 
 
 		 390 aa  188  2e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.312528  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  31.3 
 
 		 381 aa  188  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2046  cystathionine gamma-synthase  37.65 
 
 		 390 aa  187  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00917338  normal  0.373724 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3791  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  35.68 
 
 		 386 aa  187  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1362  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  42.55 
 
 		 406 aa  187  3e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0184  Cystathionine gamma-synthase  38.39 
 
 		 378 aa  187  3e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3171  cystathionine gamma-synthase  35.55 
 
 		 386 aa  187  3e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3776  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  34.46 
 
 		 387 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1563  cystathionine gamma-synthase  34.93 
 
 		 380 aa  187  4e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0740751 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0564  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  34.46 
 
 		 387 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0120  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  36.46 
 
 		 386 aa  186  4e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2761  cystathionine gamma-synthase  37.01 
 
 		 387 aa  186  4e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000790789 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0659  cystathionine gamma-synthase  36.98 
 
 		 423 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0844  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  35.58 
 
 		 396 aa  186  5e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.187169 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1506  Cystathionine gamma-synthase  38.55 
 
 		 373 aa  186  5e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2896  Cystathionine gamma-synthase  37.14 
 
 		 402 aa  186  8e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.063757  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1668  cystathionine beta-lyase  35.5 
 
 		 392 aa  186  8e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4056  cystathionine gamma-synthase  34.11 
 
 		 393 aa  185  9e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0693  cystathionine gamma-synthase  36.98 
 
 		 423 aa  185  9e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0520598 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  34.89 
 
 		 387 aa  185  1.0000000000000001e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0560  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  34.46 
 
 		 387 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  35.68 
 
 		 381 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3439  cystathionine gamma-synthase  34.11 
 
 		 393 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3614  cystathionine gamma-synthase  34.37 
 
 		 393 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0520  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  35.31 
 
 		 388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1948  Cystathionine gamma-synthase  35.13 
 
 		 398 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00285374 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>