More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1744 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1744  twitching motility protein  100 
 
 
362 aa  738    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0668  twitching motility protein  60.97 
 
 
365 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0657  twitching motility protein  60.4 
 
 
366 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0657  twitching motility protein  60.11 
 
 
366 aa  435  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0623  twitching motility protein  60.11 
 
 
366 aa  435  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1632  twitching motility protein  60.34 
 
 
366 aa  434  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0245  twitching motility protein  62.65 
 
 
359 aa  433  1e-120  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.292052  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2594  twitching motility protein  60.34 
 
 
366 aa  434  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2513  twitching motility protein  59.49 
 
 
365 aa  431  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2148  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  59.54 
 
 
374 aa  431  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1394  pilus retraction protein PilT  60 
 
 
365 aa  429  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2681  twitching motility protein  58.31 
 
 
368 aa  427  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  60.11 
 
 
365 aa  423  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1654  twitching motility protein  57.3 
 
 
363 aa  420  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4827  twitching motility protein  56.41 
 
 
366 aa  408  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465197  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1391  twitching motility protein  54.57 
 
 
375 aa  402  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.899661  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  56.7 
 
 
360 aa  399  9.999999999999999e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  58.29 
 
 
351 aa  382  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  55.2 
 
 
368 aa  380  1e-104  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1990  hypothetical protein  55.69 
 
 
344 aa  369  1e-101  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3004  pilus retraction protein PilT  55.95 
 
 
345 aa  370  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0593  twitching motility protein  55.62 
 
 
370 aa  370  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  0.0167916 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3640  twitching motility protein PilT  54.36 
 
 
344 aa  369  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  52.87 
 
 
397 aa  370  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1841  twitching motility protein  54.19 
 
 
349 aa  367  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.616267  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2476  twitching motility protein  54.97 
 
 
345 aa  367  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  53.03 
 
 
349 aa  367  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3351  twitching motility protein PilT  54.39 
 
 
345 aa  365  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5045  twitching motility protein  53.89 
 
 
344 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.597487  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1995  hypothetical protein  55.39 
 
 
344 aa  366  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4149  twitching motility protein  53.49 
 
 
344 aa  367  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.84862 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0478  pilus retraction protein PilT  54.19 
 
 
344 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3717  twitching motility protein  55.29 
 
 
347 aa  365  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1194  pilus retraction ATPase PilT  54.68 
 
 
345 aa  366  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0809497  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1265  pilus retraction ATPase PilT  54.68 
 
 
345 aa  366  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395146  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1195  pilus retraction ATPase PilT  54.68 
 
 
345 aa  367  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.035221  normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_793  twitching mobility protein  47.59 
 
 
360 aa  363  2e-99  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1138  twitching motility protein  54.71 
 
 
345 aa  364  2e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2681  twitching motility protein  53.33 
 
 
349 aa  363  3e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.172502  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0922  twitching mobility protein  48.16 
 
 
363 aa  362  4e-99  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.987668  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0806  twitching motility protein  47.86 
 
 
360 aa  362  4e-99  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3182  twitching motility protein  53.51 
 
 
345 aa  362  4e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000300358  normal  0.0171368 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3039  twitching motility protein  53.51 
 
 
345 aa  362  4e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00110048  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1339  twitching motility protein  53.51 
 
 
345 aa  362  4e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0176269  hitchhiker  0.0000000675214 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0537  twitching motility protein  54.19 
 
 
344 aa  362  5.0000000000000005e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3039  type II secretion system protein (twitching motility protein) (PilT)  55.26 
 
 
344 aa  362  6e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.37999  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1128  twitching motility protein  54.09 
 
 
345 aa  362  6e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0169735  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0264  twitching motility protein  52.3 
 
 
403 aa  362  7.0000000000000005e-99  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.723918 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2686  twitching motility protein  54.09 
 
 
345 aa  362  8e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3053  twitching motility protein  53.21 
 
 
346 aa  361  9e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.39006  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3024  twitching motility protein  53.22 
 
 
345 aa  360  1e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00035663  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0998  putative type II/IV secretion system protein  53.47 
 
 
373 aa  361  1e-98  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00360033  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0951  twitching motility protein  50.57 
 
 
372 aa  360  2e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0495  twitching motility protein PilT  53.49 
 
 
344 aa  360  2e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  53.51 
 
 
345 aa  360  2e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05180  twitching motility protein PilT  53.49 
 
 
344 aa  360  2e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03297  twitching motility protein PilT  53.04 
 
 
349 aa  359  4e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.987753  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1823  twitching motility protein  52.56 
 
 
378 aa  359  5e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.227924  normal  0.842745 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  53.04 
 
 
347 aa  357  9.999999999999999e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0375  pilus retraction protein PilT  50.99 
 
 
372 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0278  twitching motility protein  51.83 
 
 
352 aa  357  1.9999999999999998e-97  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.378494  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1346  twitching motility protein  52.69 
 
 
566 aa  356  2.9999999999999997e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1221  twitching motility protein  53.53 
 
 
344 aa  356  2.9999999999999997e-97  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.475571  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1253  twitching motility protein  53.53 
 
 
344 aa  356  2.9999999999999997e-97  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0316  twitching motility protein  54.71 
 
 
345 aa  356  3.9999999999999996e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.436596  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1165  pilus retraction ATPase PilT  52.05 
 
 
367 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.591926  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0342  twitching motility protein  55.35 
 
 
345 aa  355  5e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2800  pilus retraction protein PilT  53.57 
 
 
347 aa  354  1e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2414  twitching motility protein  52.52 
 
 
344 aa  354  2e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1333  twitching motility protein  53.22 
 
 
345 aa  354  2e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3027  twitching motility protein  49.57 
 
 
382 aa  354  2e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1233  twitching motility protein PilT  54.79 
 
 
344 aa  354  2e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000670856  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2413  twitching motility protein  50.43 
 
 
351 aa  353  2e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03577  hypothetical protein  52.85 
 
 
346 aa  353  2e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0014  twitching motility protein PilT  52.25 
 
 
345 aa  353  2.9999999999999997e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0544  twitching mobility protein PilT, type II/IV secretion system protein  51.15 
 
 
345 aa  353  2.9999999999999997e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1609  twitching motility protein  51.63 
 
 
345 aa  352  4e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.409997 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5318  pilus retraction protein PilT  52.03 
 
 
344 aa  352  5e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002458  twitching motility protein PilT  52.55 
 
 
346 aa  352  5e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2070  twitching motility protein  50.84 
 
 
362 aa  352  5.9999999999999994e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4696  twitching motility protein  49.86 
 
 
374 aa  352  5.9999999999999994e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.787911 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  52.54 
 
 
347 aa  351  8.999999999999999e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1537  twitching motility protein PilT  53.64 
 
 
344 aa  350  2e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2936  twitching motility protein  52.68 
 
 
347 aa  350  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.745836  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1643  twitching motility protein PilT  51.01 
 
 
361 aa  350  2e-95  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2682  twitching motility protein  52.98 
 
 
347 aa  350  3e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  53.94 
 
 
347 aa  350  3e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1969  twitching motility protein  50.7 
 
 
374 aa  349  3e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0267  pilus retraction protein PilT  52.6 
 
 
350 aa  349  4e-95  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2918  twitching motility protein  52.57 
 
 
347 aa  349  5e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2506  twitching motility protein  52.57 
 
 
347 aa  348  6e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.876718 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1251  pilus retraction protein PilT  50.86 
 
 
360 aa  348  1e-94  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01993  twitching motility protein  52.94 
 
 
345 aa  347  2e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.913118  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3527  twitching motility protein  54.52 
 
 
344 aa  347  2e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.318184  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3883  pilus retraction protein PilT  52.54 
 
 
347 aa  347  3e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1637  twitching motility protein  49.72 
 
 
372 aa  346  3e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.601857  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1611  twitching motility protein  49.72 
 
 
372 aa  346  3e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  52.29 
 
 
351 aa  347  3e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0293  twitching motility protein  52.02 
 
 
350 aa  346  4e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2918  twitching motility protein PilT  52.82 
 
 
344 aa  346  4e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.683879  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>